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J-GLOBAL ID：202102264485914690   整理番号：21A0083789

Legionella種の診断及び環境サーベイランスにおけるMALDI-TOF質量分析の評価:培養及びMip遺伝子配列決定技術との比較【JST・京大機械翻訳】

Evaluation of MALDI-TOF Mass Spectrometry in Diagnostic and Environmental Surveillance of Legionella Species: A Comparison With Culture and Mip-Gene Sequencing Technique

著者 (12件)： Pascale Maria Rosaria (Department of Biological, Geological, and Environmental Sciences, University of Bologna, Bologna, Italy) ,  Mazzotta Marta (Department of Biological, Geological, and Environmental Sciences, University of Bologna, Bologna, Italy) ,  Salaris Silvano (Department of Biological, Geological, and Environmental Sciences, University of Bologna, Bologna, Italy) ,  Girolamini Luna (Department of Biological, Geological, and Environmental Sciences, University of Bologna, Bologna, Italy) ,  Grottola Antonella (Regional Reference Laboratory for Clinical Diagnosis of Legionellosis, Unit of Microbiology and Virology, Modena University Hospital, Modena, Italy) ,  Simone Maria Luisa (Department of Life Sciences, University of Modena and Reggio Emilia, Modena, Italy) ,  Cordovana Miriam (Microbiology Unit-Department of Experimental, Diagnostic and Specialty Medicine, S. Orsola-Malpighi University Hospital, Bologna, Italy) ,  Bisognin Francesco (Microbiology Unit-Department of Experimental, Diagnostic and Specialty Medicine, S. Orsola-Malpighi University Hospital, Bologna, Italy) ,  Dal Monte Paola (Microbiology Unit-Department of Experimental, Diagnostic and Specialty Medicine, S. Orsola-Malpighi University Hospital, Bologna, Italy) ,  Bucci Sabattini Maria Antonietta (Regional Agency for Prevention, Environment and Energy of Emilia-Romagna, Bologna, Italy) ,  Viggiani Mariagabriella (Regional Agency for Prevention, Environment and Energy of Emilia-Romagna, Bologna, Italy) ,  Cristino Sandra (Department of Biological, Geological, and Environmental Sciences, University of Bologna, Bologna, Italy)
資料名： Frontiers in Microbiology (Web)  (Frontiers in Microbiology (Web))
巻： 11  ページ： 589369  発行年： 2020年 
JST資料番号： U7080A  ISSN： 1664-302X  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： Legionella spp.は,ヒト健康への成長影響を有する水生環境における広範な細菌である。61の種の間で,Legionella pneumophilaは,ヒト疾患で最も流行している。それどころか,Legionella non-pneumoniae種は,培養における遅い成長および特異的および迅速な診断/分析ツールの欠如のため,臨床診断または環境監視中に検出されない。信頼できる迅速分離同定は,感染の源を推定し,封じ込め対策を下り,臨床治療を決定するのに不可欠である。実験室の日常診断への導入以来,マトリックス支援レーザ脱離イオン化飛行時間質量分析(MALDI-TOF MS)は,Legionella臨床および環境監視に関するいくつかの研究で記載されている,異なる細菌種の同定のための広く受け入れられている方法である。本研究の焦点は,Legionella 院内およびコミュニティ監視中に採取したLegionella non-pneumoniae種に対するMALDI-TOF MSの改善であった。培養およびmip遺伝子配列決定結果との比較解析を行った。さらに,系統発生分析を行い,分離株間の相関を推定した。MALDI-TOF MSはLegionella anisa,Legionella rubrilucens,Legionella felectii及びLegionella jordanis種に属する分離株の45.0%に対して正しい種レベル同定を達成し,mip遺伝子配列決定結果との高い一致を示した。対照的に,データベースに含まれていない種に属する試料に対応する分離株の残りの55.0%に対して,より信頼性の低い同定が見出された。系統発生分析は,種内の関連差異を示し,3つの主なクレードで再調査した。Legionella anisaクレードの中で,主クレードから3.3%の分岐を有するサブクレードが観察された。さらに,Legionella quinlivaniiと同定された1つの分離株は,対応する参照株から3.8%の発散を示した。しかし,これらの知見は補足的調査を必要とする。結果は,日常診断および環境Legionella監視におけるMALDI-TOF MSの実施を奨励し,それは種レベルで信頼できて迅速な同定を示し,データベースにはまだ含まれていない種を同定する可能性も示す。さらに,系統発生解析は,分離株を相関させるための関連アプローチであり,特にLegionella予防が過小評価されている非在来型貯水池において,それらの広がりを追跡するための関連アプローチである。Copyright 2021 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： イオン化 ,  *質量分析 ,  脱着 ,  貯水池 ,  信頼性 ,  データベース ,  ヒト ,  系統発生 ,  Legionella pneumophila ,  *Legionella ,  *MALDI-TOF MS
準シソーラス用語： 系統解析 ,  *遺伝子配列 ,  クレード ,  分離株 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (6件)： Legionella non-pneumophila種 ,  Legionellaの同定 ,  MALDI-TOF MS ,  MALDIバイオタイプシステム ,  凝集試験 ,  mip遺伝子配列決定

分類 (1件)： 微生物検査法  (EG02020G)

引用文献 (68件)：

• Abdel-NourM.DuncanC.LowD. E.GuyardC. (2013). Biofilms: the stronghold of Legionella pneumophila. Int. J. Mol. Sci. 14 21660-21675. doi: 10.3390/ijms141121660 24185913
• Amemura-maekawaJ.KuraF.ChidaK.OhyaH.KanataniJ.IsobeJ. (2018). Legionella pneumophila and other legionella species isolated from legionellosis patients in Japan between 2008 and 2016. Appl. Environ. Microbiol. 84 1-9. doi: 10.1007/978-0-387-70896-6_1
• ArvandM.JungkindK.HackA. (2011). Contamination of the cold water distribution system of health care facilities by Legionella pneumophila: do we know the true dimension? Eurosurveillance 16 1-6. doi: 10.2807/ese.16.16.19844-en
• BaladronB.GilV.PelazC. (2006). “Serological versus sequence-based methods for Legionella identification,” in Legionella: State of the Art 30 Years After Its Recognition, eds CianciottoS. M. S.KwaikY. A.EdelsteinP. H.FieldsB. S.GearyD. F.HarrisonT. G. (Washington DC: American Society for Microbiology), 58-62. doi: 10.1128/9781555815660.ch16
• BeautéJ. (2017). Legionnaires’ disease in Europe, 2011 to 2015. Eurosurveillance 22 1-8. doi: 10.2807/1560-7917.ES.2017.22.27.30566 28703097

タイトルに関連する用語 (10件)： Legionella ,  診断 ,  環境 ,  サーベイランス ,  MALDI-TOF ,  質量分析 ,  評価 ,  培養 ,  MIP ,  遺伝子配列決定