文献

J-GLOBAL ID：202102277986034545   整理番号：21A0385956

SARS-CoV-2主要プロテアーゼとスパイクRBDの潜在的阻害剤としての天然化合物のin silicoスクリーニング:COVID-19の標的【JST・京大機械翻訳】

In silico Screening of Natural Compounds as Potential Inhibitors of SARS-CoV-2 Main Protease and Spike RBD: Targets for COVID-19

著者 (3件)： Teli Divya M. (Department of Pharmaceutical Chemistry, L. M. College of Pharmacy, Ahmedabad, India) ,  Shah Mamta B. (Department of Pharmacognosy, L. M. College of Pharmacy, Ahmedabad, India) ,  Chhabria Mahesh T. (Department of Pharmaceutical Chemistry, L. M. College of Pharmacy, Ahmedabad, India)
資料名： Frontiers in Molecular Biosciences (Web)  (Frontiers in Molecular Biosciences (Web))
巻： 7  ページ： 599079  発行年： 2020年 
JST資料番号： U7081A  ISSN： 2296-889X  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 歴史的に,植物は,病気を治療するための多数の可能性を提供する多様な化学化合物の生産のためのバイオ要因として探索されてきた。現在のパンデミックコロナウイルス病2019(COVID-19)と戦うために,植物ベースの天然化合物を,COVID-19の原因,SARS-CoV-2(重症急性呼吸器症候群コロナウイルス2)を阻害するそれらの可能性のために調査した。本研究は,SARS-CoV-2のACE2(PDBコード:6M0J)に対する主要なプロテアーゼ(Mpro)(PDBコード:6LU7)とスパイク(S)糖蛋白質受容体結合ドメイン(RBD)を阻害するための分子ドッキングアプローチを用いて,SARS-CoV-2に対する植物成分のいくつかのグループの抗ウイルス作用の研究を目的とした。結合親和性評価のため,ドッキングスコアをMaestroのGlideドッキングモジュールの超精密(XP)プロトコルを用いて計算した。CovDockを用いて共有結合を調べた。OPLS3e力場をシミュレーションに用いた。ドッキングスコアは最低結合自由エネルギー(最良姿勢)を持つ配位子の立体配座を優先して計算した。結果は,Mproおよびスパイク糖蛋白質RBD二重阻害剤として,ソラニン,アセトシドおよびルチンのより良い可能性を示した。アセトシドとクルクミンはMpro共有結合を阻害することが分かった。また,クルクミンは,すべての物理化学的および薬物動力学的パラメータを有した。したがって,ソラニン,アセトシド,ルチン,およびクルクミンのような植物化学物質は,COVID-19に対する処理オプションとして開発される可能性がある。Copyright 2021 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 立体配座 ,  ドッキング ,  抗ウイルス作用 ,  糖タンパク質 ,  結合部位 ,  *ペプチド結合ヒドロラーゼ ,  共有結合 ,  *スクリーニング ,  植物成分 ,  ジエン ,  フェノール類 ,  フェノールエーテル ,  エノン ,  ジケトン ,  酸素複素環化合物 ,  配糖体 ,  多価フェノール ,  二糖類 ,  ピラノシド ,  フラボノイド ,  芳香族縮合化合物 ,  ヒドロキシケトン
準シソーラス用語： *重症急性呼吸器症候群 ,  結合親和性 ,  *in silico ,  *天然化合物 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (6件)： ACE2 ,  COVID-19 ,  植物成分 ,  SARS-CoV-2 ,  スパイク(S)糖蛋白質 ,  MPRO

分類 (1件)： ウイルス感染の生理と病原性  (EG04042Y)

物質索引 (2件)： クルクミン ,  ルチン

引用文献 (39件)：

• AanouzI.BelhassanA.El-KhatabiK.LakhlifiT.El-ldrissiM.BouachrineM. (2020). Moroccan medicinal plants as inhibitors against SARS-CoV-2 main protease: Computational investigations. J. Biomol. Struct. Dyn. 38, 1-9. doi: 10.1080/07391102.2020.1758790
• Ben-ShabatS.YarmolinskyL.PoratD.DahanA. (2020). Antiviral effect of phytochemicals from medicinal plants: applications and drug delivery strategies. Drug Deliv. Transl. Res. 10, 354-367. doi: 10.1007/s13346-019-00691-631788762
• BorahP.DebP. K.DekaS.VenugopalaK. N.SinghV.MailavaramR. P.. (2020). Current scenario and future prospect in the management of COVID-19. Curr. Med. Chem. 27, 1-27. doi: 10.2174/092986732766620090811364232900341
• EnogieruA. B.HaylettW.HissD. C.BardienS.EkpoO. E. (2018). Rutin as a potent antioxidant: implications for neurodegenerative disorders. Oxid. Med. Cell. Longev. 2018:6241017. doi: 10.1155/2018/624101730050657
• FehrA. R.PerlmanS. (2015). Coronaviruses: an overview of their replication and pathogenesis. Coronaviruses Methods Protoc. 1282, 1-23. doi: 10.1007/978-1-4939-2438-7_125720466

タイトルに関連する用語 (8件)： SARS-CoV-2 ,  プロテアーゼ ,  スパイク ,  阻害剤 ,  天然化合物 ,  スクリーニング ,  COVID-19 ,  標的