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J-GLOBAL ID：202102285172594749   整理番号：21A0385018

ゲノムワイド関連マッピングを用いたコムギ(Triticum aestivum L.)における斑点病抵抗性の新しいQTL【JST・京大機械翻訳】

New QTLs for Spot Blotch Disease Resistance in Wheat (Triticum aestivum L.) Using Genome-Wide Association Mapping

著者 (15件)： Tomar Vipin (Borlaug Institute for South Asia, Ludhiana, India) ,  Tomar Vipin (Institute of Advanced Research, Gandhinagar, Gujarat, India) ,  Singh Daljit (The Climate Corporation, Bayer Crop Science, Creve Coeur, MO, United States) ,  Dhillon Guriqbal Singh (Department of Biotechnology, Thapar Institute of Engineering and Technology, Patiala, India) ,  Singh Ravi Prakash (Global Wheat Program, International Maize and Wheat Improvement Center (CIMMYT), Texcoco, Mexico) ,  Poland Jesse (Department of Plant Pathology, Kansas State University, Manhattan, KS, United States) ,  Joshi Arun Kumar (Borlaug Institute for South Asia, Ludhiana, India) ,  Joshi Arun Kumar (International Maize and Wheat Improvement Centre, New Delhi, India) ,  Singh Pawan Kumar (Global Wheat Program, International Maize and Wheat Improvement Center (CIMMYT), Texcoco, Mexico) ,  Bhati Pradeep Kumar (Borlaug Institute for South Asia, Ludhiana, India) ,  Kumar Suneel (Borlaug Institute for South Asia, Ludhiana, India) ,  Rahman Mokhlesur (Wheat Research Center, Regional Agricultural Research Station, Bangladesh Agricultural Research Institute, Jamalpur, Bangladesh) ,  Tiwari Budhi Sagar (Institute of Advanced Research, Gandhinagar, Gujarat, India) ,  Kumar Uttam (Borlaug Institute for South Asia, Ludhiana, India) ,  Kumar Uttam (Global Wheat Program, International Maize and Wheat Improvement Center (CIMMYT), Texcoco, Mexico)
資料名： Frontiers in Genetics (Web)  (Frontiers in Genetics (Web))
巻： 11  ページ： 613217  発行年： 2020年 
JST資料番号： U7071A  ISSN： 1664-8021  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： Bipolaris sorokinianaによるスポットブロット病は熱帯および亜熱帯におけるコムギ生産の主要な制約である。病害感受性系統に対するスポットブロット抵抗性対立遺伝子の移入は,これらの地域におけるコムギ生産を確保するために重要である。スポットブロットのためのゲノムワイド関連研究(GWAS)は以前に試みられたが,本研究は多様な野外条件で自然疾患圧力下のスポットブロットのための新しい量的形質遺伝子座(QTLs)の同定に焦点を当てた。インドとバングラデシュの3つの環境(3年と2か所)で合計139の先進春播コムギ系統を評価した。14,063多型遺伝子タイピング(GBS)マーカーを用いたGWASは,コムギゲノムの8つの染色体に属するスポットブロット病耐性と関連する8つのQTLを同定した。ここでは,疾患と関係した対立遺伝子効果と共に,同定したマーカー-形質会合(MTA)を報告する。有意なマーカーの機能的アノテーションは,複数の染色体領域にわたってNBS-LRR,MADS-box転写因子および34の他の植物関連蛋白質ファミリーを同定した。結果は,いくつかの耐病性蛋白質ファミリーに関連した染色体1A(497.2Mb),1D(89.84Mb),2B(421.92Mb)および6D(6.84Mb)に関する4つの有望な新しいQTLを示した。これらの結果は,スポットブロット病に関連する新しいゲノム領域への洞察を提供し,更なる検証により,コムギ開発における耐病性育種努力に利用できる。Copyright 2021 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 染色体 ,  *コムギ ,  *ゲノム ,  熱帯 ,  亜熱帯 ,  対立遺伝子 ,  *斑点病 ,  耐病性 ,  春播コムギ ,  転写因子 ,  ブロッティング ,  量的形質遺伝子座 ,  アノテーション ,  ゲノムワイド関連解析
準シソーラス用語： 耐病性育種 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (6件)： GWAS ,  GBS ,  スポットブロット ,  QTL ,  BLUP ,  コムギ

分類 (2件)： 麦  (FC03033M) ,  菌類による植物病害  (FC04052Y)

引用文献 (62件)：

• AdhikariT. B.GurungS.HansenJ. M.JacksonE. W.BonmanJ. M. (2012). Association mapping of quantitative trait loci in spring wheat landraces conferring resistance to bacterial leaf streak and spot blotch. Plant Genome. 5 1-16. doi: 10.3835/plantgenome2011.12.0032
• AlvaradoG.RodríguezF. M.PachecoA.BurgueñoJ.CrossaJ.VargasM. (2020). META-R: A software to analyze data from multi-environment plant breeding trials. Crop J. 8 745-756. doi: 10.1016/j.cj.2020.03.010
• AyanaG. T.AliS.SidhuJ. S.Gonzalez HernandezJ. L.TurnipseedB.SehgalS. K. (2018). Genome-wide association study for spot blotch resistance in hard winter wheat. Front. Plant Sci. 9:926. doi: 10.3389/fpls.2018.00926 30034404
• BainslaN. K.PhukeR. M.HeX.GuptaV.BishnoiS. K.SharmaR. K. (2020). Genome-wide association study for spot blotch resistance in Afghan wheat germplasm. Plant Pathol. 69 1161-1171. doi: 10.1111/ppa.13191
• BradburyP. J.ZhangZ.KroonD. E.CasstevensT. M.RamdossY.BucklerE. S. (2007). TASSEL: software for association mapping of complex traits in diverse samples. Bioinformatics 23 2633-2635. doi: 10.1093/bioinformatics/btm308 17586829

タイトルに関連する用語 (7件)： ゲノム ,  マッピング ,  コムギ ,  Triticum ,  斑点病 ,  抵抗性 ,  QTL