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J-GLOBAL ID：202102290376836087   整理番号：21A0348285

単一ヌクレオソームイメージングは活性RNAポリメラーゼIIを介してルーズゲノムクロマチンネットワークを明らかにする【JST・京大機械翻訳】

Single nucleosome imaging reveals loose genome chromatin networks via active RNA polymerase II

著者 (22件)： Nagashima Ryosuke (Genome Dynamics Laboratory, National Institute of Genetics, Research Organization of Information and Systems, Mishima, Japan) ,  Nagashima Ryosuke (Department of Genetics, School of Life Science, SOKENDAI, Mishima, Japan) ,  Hibino Kayo (Genome Dynamics Laboratory, National Institute of Genetics, Research Organization of Information and Systems, Mishima, Japan) ,  Hibino Kayo (Department of Genetics, School of Life Science, SOKENDAI, Mishima, Japan) ,  Ashwin S.S. (Department of Applied Physics, Nagoya University, Nagoya, Japan) ,  Ashwin S.S. (Department of Computational Science and Engineering, Nagoya University, Nagoya, Japan) ,  Babokhov Michael (Genome Dynamics Laboratory, National Institute of Genetics, Research Organization of Information and Systems, Mishima, Japan) ,  Fujishiro Shin (Department of Applied Physics, Nagoya University, Nagoya, Japan) ,  Fujishiro Shin (Department of Computational Science and Engineering, Nagoya University, Nagoya, Japan) ,  Imai Ryosuke (Genome Dynamics Laboratory, National Institute of Genetics, Research Organization of Information and Systems, Mishima, Japan) ,  Imai Ryosuke (Department of Genetics, School of Life Science, SOKENDAI, Mishima, Japan) ,  Nozaki Tadasu (Genome Dynamics Laboratory, National Institute of Genetics, Research Organization of Information and Systems, Mishima, Japan) ,  Tamura Sachiko (Genome Dynamics Laboratory, National Institute of Genetics, Research Organization of Information and Systems, Mishima, Japan) ,  Tani Tomomi (Eugene Bell Center for Regenerative Biology and Tissue Engineering, Marine Biological Laboratory, Woods Hole, MA) ,  Kimura Hiroshi (Cell Biology Center, Institute of Innovative Research, Tokyo Institute of Technology, Yokohama, Japan) ,  Shribak Michael (Eugene Bell Center for Regenerative Biology and Tissue Engineering, Marine Biological Laboratory, Woods Hole, MA) ,  Kanemaki Masato T. (Department of Genetics, School of Life Science, SOKENDAI, Mishima, Japan) ,  Kanemaki Masato T. (Molecular Cell Engineering Laboratory, National Institute of Genetics, ROIS, Mishima, Japan) ,  Sasai Masaki (Department of Applied Physics, Nagoya University, Nagoya, Japan) ,  Sasai Masaki (Department of Computational Science and Engineering, Nagoya University, Nagoya, Japan) ,  Maeshima Kazuhiro (Genome Dynamics Laboratory, National Institute of Genetics, Research Organization of Information and Systems, Mishima, Japan) ,  Maeshima Kazuhiro (Department of Genetics, School of Life Science, SOKENDAI, Mishima, Japan)
資料名： Journal of Cell Biology  (Journal of Cell Biology)
巻： 218  号： 5  ページ： 1511-1530  発行年： 2019年 
JST資料番号： C0575A  ISSN： 0021-9525  CODEN： JCLBA3  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： クロマチン組織化と動力学は遺伝子転写において重要な役割を果たすが,これらの相互作用は不明である。この問題にアプローチするために,単一ヌクレオソームイメージングを用いて生きているヒト細胞における様々な転写条件下でゲノムワイドクロマチン挙動を検討した。RNAポリメラーゼII(RNAPII)による転写は,一般的に,よりオープンで動的なクロマチンを必要とすると考えられているが,活性RNAPIIがクロマチンの動きを全体的に制約することを見出した。RNAPII阻害またはその急速な枯渇はクロマチン拘束を解除し,クロマチン動態を増加させた。活性RNAPIIと関連するP-TEFbクラスターの摂動実験は同様の結果を有した。さらに,クロマチン移動度も静止G0細胞及びUV照射細胞において増加し,それは転写的に低活性であった。本結果はクロマチンが活性RNAPIIを介して緩い接続により大域的に安定化され,それは古典的転写工場のモデルまたは転写関連因子の液体液滴形成と互換性があることを示した。計算モデリングと共に,活性RNAPIIクラスタ/液滴を介した種々のイントラ/染色体間接触に対する緩いクロマチンドメインネットワークの存在を提案した。Please refer to the version of record for the copyright holder. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 移動度 ,  液滴 ,  相互作用 ,  互換性 ,  *ネットワーク ,  紫外線照射 ,  *クロマチン ,  染色体 ,  ヒト ,  *ゲノム ,  クラスタ ,  摂動 ,  *RNAポリメラーゼII
準シソーラス用語： ドメイン構造 , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (2件)： 細胞構成体の機能  (EF03060C) ,  細胞生理一般  (EF02010S)

引用文献 (99件)：

• Albiez. Chromatin domains and the interchromatin compartment form structurally defined and functionally interacting nuclear networks. Chromosome Res. 2006, 14, 707. doi:10.1007/s10577-006-1086-x
• Baddeley. Measurement of replication structures at the nanometer scale using super-resolution light microscopy. Nucleic Acids Res. 2010, 38, e8. doi:10.1093/nar/gkp901
• Belmont. Visualization of G1 chromosomes: a folded, twisted, supercoiled chromonema model of interphase chromatid structure. J. Cell Biol. 1994, 127, 287. doi:10.1083/jcb.127.2.287
• Bensaude. Inhibiting eukaryotic transcription: Which compound to choose? How to evaluate its activity?. Transcription. 2011, 2, 103. doi:10.4161/trns.2.3.16172
• Berezney. Heterogeneity of eukaryotic replicons, replicon clusters, and replication foci. Chromosoma. 2000, 108, 471. doi:10.1007/s004120050399

タイトルに関連する用語 (2件)： 活性 ,  RNAポリメラーゼII