変動する伝達ネットワークにより仲介される協調的蛋白質アロステリック転移【JST・京大機械翻訳】

Post, M.; Lickert, B.; Diez, G.; Wolf, S.; Stock, G.

プレプリント

J-GLOBAL ID：202202203346435820 整理番号：21P0272953

変動する伝達ネットワークにより仲介される協調的蛋白質アロステリック転移【JST・京大機械翻訳】

Cooperative protein allosteric transition mediated by a fluctuating transmission network

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発行年： 2022年04月29日プレプリントサーバーでの情報更新日： 2022年04月29日
JST資料番号： O7001B 資料種別：プレプリント
記事区分：プレプリント発行国：アメリカ合衆国 (USA) 言語：英語 (EN)

遠隔蛋白質部位間のアロステリックコミュニケーションは,生体分子調節とシグナル伝達の重要な機構である。しかし,蛋白質折畳みのような他のプロセスと比較して,アロステリック転移の動的進化はまだよく理解されていない。遠隔蛋白質領域間のアロステリックカップリングの例として,ヒンジ領域における局所運動により誘導されるT4リゾチームの2ドメインの大域的開放閉鎖運動を考察した。残基間接触の相関分析と広範な分子動力学シミュレーションを組み合わせて,協奏的に移動する残基間距離のネットワークを同定した。協調プロセスはヒンジ領域における疎水性コアのコグホイール様運動から生じ,それは柔軟な伝送ネットワークを構成する。剛直な接触と蛋白質骨格を通して,疎水性コアの小さな局所変化は遠位の末端ドメインに通過し,稀なグローバルな立体配座転移の出現をもたらす。Ising型モデルにおいて,アロステリック転移の協同性は局所変動の相互作用によって説明できる。【JST・京大機械翻訳】

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, , , , , 【Automatic Indexing@JST】

酵素一般 , 分子構造

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