ヌクレオソームにおけるAPE1プロセシングDNA損傷の構造的基礎【JST・京大機械翻訳】

Weaver, T. M.; Hoitsma, N. M.; Spencer, J. J.; Gakhar, L.; Schnicker, N. J.; Freudenthal, B. D.

プレプリント

J-GLOBAL ID：202202203980739212 整理番号：22P0317659

ヌクレオソームにおけるAPE1プロセシングDNA損傷の構造的基礎【JST・京大機械翻訳】

Structural basis for APE1 processing DNA damage in the nucleosome

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発行年： 2022年03月11日プレプリントサーバーでの情報更新日： 2022年03月11日
JST資料番号： O7001B 資料種別：プレプリント
記事区分：プレプリント発行国：アメリカ合衆国 (USA) 言語：英語 (EN)

ゲノムDNAはDNA損傷を促進する内因性及び外因性因子に絶えず曝露されている。真核生物ゲノムDNAはヌクレオソームにパッケージされ,DNA損傷をアクセスし,効果的に修復する障壁を示す。DNA修復蛋白質がヌクレオソームにおけるDNA損傷を修復し,ゲノム安定性を保護するためのこの障壁を克服する機構は不明である。ここでは,塩基除去修復(BER)エンドヌクレアーゼAP-エンドヌクレアーゼ1(APE1)がヌクレオソームにおけるDNA損傷を認識し,切断する方法を決定する。速度論的分析は,APE1が,閉塞AP部位より3~6桁高い効率でヌクレオソームの溶媒曝露AP部位を切断すると決定した。溶媒曝露AP部位を含むヌクレオソームに結合したAPE1の凍結電子顕微鏡構造は,APE1がAP部位認識にDNA切断機構を用い,APE1がAP部位にアクセスするためにヌクレオソームDNAを曲げることを明らかにした。特に,閉塞AP部位のさらなる生化学的及び構造的特性化は,APE1によるAP部位の効率的プロセシングを妨げるヌクレオソームDNAとヒストン八量体間の接触を同定した。これらの知見はヌクレオソームにおけるBER蛋白質の位置依存性活性の理論的根拠を提供し,ヌクレオソームDNAに対するBER蛋白質の能力がクロマチンにおける効率的なBERを駆動することを示唆する。【JST・京大機械翻訳】

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分子遺伝学一般

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