抄録/ポイント:
抄録/ポイント
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同族パートナーへの蛋白質結合に影響する変異は,主に,埋没残基またはパートナー結合に直接関与する曝露残基のどちらかで生じる。突然変異表現型のみに基づくこれら2つのカテゴリー間の識別は,困難である。細菌毒素CcdBはDNAギラーゼへの結合により細胞を殺す。細胞死は,GyrA結合部位と部分的に重複する拡張界面で,その同族抗毒素CcdAへの結合により阻止される。モデルとしてCcdAB毒素-抗毒素(TA)系を用いて,CcdBの包括的な部位特異的変異誘発ライブラリーを,その天然オペロン文脈において発生させた。各変異体の突然変異感受性を,2つの菌株,1つの耐性,およびCcdB毒素の毒性活性に対する他の感受性について,深い配列決定を通して,各突然変異体の相対存在量を評価することによって推定した。CcdAB複合体がそれ自身のプロモーターに結合し,転写を抑制するので,CcdAに結合する能力はRelEリポーター遺伝子アッセイを通して推測された。CcdB感受性,CcdB耐性およびRelEレポーター株における変異体表現型を解析することにより,残基を埋没,CcdA相互作用またはGyrA相互作用部位に割り当てることが可能であった。少数の変異体を個別に構築し,発現させ,生物物理学的に特性化して,観察された表現型に関与する分子機構を検証した。また,抗毒素結合に重要であると推定される残基は,CcdB-Gyrase複合体からCcdBを若返するのに重要であるようである。したがって,構造情報がない場合でさえ,適切な遺伝子スクリーニングに連結すると,このようなハイスループット戦略は,蛋白質の構造的および機能的決定因子を予測するために展開できる。より広範な衝撃状態喪失機能喪失は,埋没部位または曝露,活性部位残基のいずれかで主に発生する。蛋白質に対する異なる相互作用パートナーに対する複数の結合部位を同定する容易な方法を報告し,変異データからのみ,埋没部位および曝露非活性部位残基からそれらを区別した。【JST・京大機械翻訳】