ウサギモデルにおける頭蓋内血管の評価のための空間分解トランスクリプトーム:概念の証明【JST・京大機械翻訳】

Zabriskie, M. S.; Cooke, D. L.; Wang, C.; Alexander, M. D.

プレプリント

J-GLOBAL ID：202202209961154775 整理番号：22P0314840

ウサギモデルにおける頭蓋内血管の評価のための空間分解トランスクリプトーム:概念の証明【JST・京大機械翻訳】

Spatially Resolved Transcriptomics for Evaluation of Intracranial Vessels in a Rabbit Model: Proof of Concept

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発行年： 2022年02月28日プレプリントサーバーでの情報更新日： 2022年02月28日
JST資料番号： O7001B 資料種別：プレプリント
記事区分：プレプリント発行国：アメリカ合衆国 (USA) 言語：英語 (EN)

【背景】脳血管障害の理解を改善するために,血管生物学および血管病態生理のより詳細な理解が必要である。疾患血管からの組織は最良のデータを提供できる。ウサギモデルは頭蓋内血管を研究するために有効であり,ヒト組織を得る困難から生じるギャップを埋める。特に,空間分解トランスクリプトミクス(SRT)は,RNA配列決定法上に構築され,病理組織学でそのようなデータを増強するので,そのようなモデルを研究するのに有望である。【方法】無傷動脈のウサギ脳をフラッシュ凍結し,凍結切片し,H&Eで染色し,組織最適化およびVisium SRTプラットフォームを用いた遺伝子発現分析を行う前に,頭蓋内血管の適切な包含を確認した。SRT結果をk-平均クラスタ分析で分析し,動脈を静脈と比較し,差次的遺伝子発現を調べた。【結果】クライオ切片を,Visium prientsスライドに首尾よく搭載した。品質管理閾値を満たした。最適透過度は組織最適化段階で24分であると決定した。SRTデータの分析において,k-平均クラスタ化は実質から維管束組織を区別した。遺伝子発現形質を比較するとき,最も差別的に発現された遺伝子は,平滑筋細胞で見つかったそれらであった。これらの遺伝子は静脈と比較して動脈においてより一般的に発現した。【結論】モデルウサギからの頭蓋内血管は,Visium SRTプラットフォームで処理され,分析される。顔面妥当性は,実質組織から血管を区別するためのSRTデータの能力と静脈から動脈を正確に識別する差次的発現分析に見つかる。SRTは脳血管疾患に対する将来の動物モデル調査のために考慮されるべきである。【JST・京大機械翻訳】

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遺伝子発現 , 循環系の基礎医学

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