SWATH-MSを用いた食道癌化学療法治療結果に関連する血漿蛋白質の同定【JST・京大機械翻訳】

Guo, N.; Minas, G.; Synowsky, S. A.; Dunne, M. R.; Ahmed, H.; McShane, R.; Bhardwaj, A.; Donlon, N. E.; Lorton, C.; O'Sullivan, J.; Reynolds, J. V.; Caie, P. D.; Shirran, S. L.; Lynch, A. G.; Stewart, A.; Arya, S.

プレプリント

J-GLOBAL ID：202202214689902361 整理番号：22P0330712

SWATH-MSを用いた食道癌化学療法治療結果に関連する血漿蛋白質の同定【JST・京大機械翻訳】

Identification of plasma proteins associated with oesophageal cancer chemotherapeutic treatment outcomes using SWATH-MS

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資料名：
発行年： 2022年04月08日プレプリントサーバーでの情報更新日： 2022年04月08日
JST資料番号： O7001B 資料種別：プレプリント
記事区分：プレプリント発行国：アメリカ合衆国 (USA) 言語：英語 (EN)

食道腺癌(OAC)は5年生存率<15%の悪性癌である。現在の化学療法戦略は,患者の少数(20~30%)のみに有益であり,応答者と非応答者の間で区別できる方法は存在しない。治療前に局所進行OACの23人の患者からのアルブミン/IgG枯渇および非枯渇血漿試料に対する,全てのTHeoreticalフラグメントイオンスペクトル-質量分析(SWATH-MS)の逐次Window Acquisitionを用い,定量的プロテオミクスを行った。化学療法後の腫瘍回帰(TRG)スコア(TRG1/2/3対TRG4/5)に基づいて個人をグループ分けし,差次的に豊富な蛋白質を比較した。高度に豊富な蛋白質の蛋白質枯渇は,多くの蛋白質の約2倍の同定をもたらした。SWATH-MSは,2つの群の間でいくつかの蛋白質の豊度における有意な定量的差異を明らかにした。これらは,補体c1qサブユニット蛋白質,C1QA,C1QBおよびC1QCを含み,これは低TRG群でより豊富であった。高TRG群でより高い豊度を持つことを見出したので,GSTP1は最低のp値および最も高い分類精度とCohensκ値を示すことを見出した。これらの蛋白質の濃度をELISAに基づくアッセイを用いてさらに調べた。本研究は,食道がんにおける化学療法治療に対する反応を支持する血漿プロテオームの違いに関連する定量的情報を提供する。【JST・京大機械翻訳】

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消化器の腫よう

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