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J-GLOBAL ID:202202216244006499   整理番号:22A0462885

ゲノムワイド相互作用研究は,ネロール牛における牛肉脂質関連形質の上位相互作用を明らかにする【JST・京大機械翻訳】

Genome-wide interaction study reveals epistatic interactions for beef lipid-related traits in Nellore cattle
著者 (8件):
資料名:
巻: 53  号:ページ: 35-48  発行年: 2022年 
JST資料番号: T0281A  ISSN: 0268-9146  資料種別: 逐次刊行物 (A)
記事区分: 原著論文  発行国: アメリカ合衆国 (USA)  言語: 英語 (EN)
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遺伝子-遺伝子相互作用は自然個体群における隠れた遺伝的変異を引き起こし,複雑な形質研究で典型的に観察される複製の欠如の原因である。本研究は,Nellore牛の牛肉脂肪酸プロファイル形質におけるエピスタシスをテストするために,経験的Hilbert-Schmidt Index Criterion法を用いて遺伝子-遺伝子相互作用を同定することを目的とした。データセットは963頭の雄牛からの記録を含み,777962k SNPチップを用いて遺伝子型を決定した。Longissimus筋肉の肉試料を採取し,ガスクロマトグラフィーにより定量した脂肪酸組成を測定した。飽和(SFA),モノ不飽和(MUFA),ポリ不飽和(PUFA),オメガ-3(OM3),オメガ-6(OM6),SFA:PUFAおよびOM3:OM6脂肪酸比の和を用いて作用した。[数式:原文を参照]が個別にマッピングされた相互作用におけるSNPは,候補遺伝子を探索するために使用された。SFAs,MUFA,PUFAs,OM3s,OM6sおよびSFA:PUFAおよびOM3:OM6比に対する602,3,13,215および169の候補遺伝子の合計を同定した。見出された候補遺伝子はコレステロール,脂質調節,低密度リポ蛋白質受容体,飼料効率および炎症反応と関連していた。濃縮分析は,57の有意なGOと18のKEGG用語([数式:原文を参照])を明らかにし,それらの大部分は肉質と補足的項に関連した。著者らの結果は,Nellore牛において,脂質プロファイル,肉質,枝肉および飼料効率形質に関連する実質的な遺伝的相互作用を初めて示した。これらのSNP-SNP相互作用の知識は,脂質関連形質に寄与する遺伝的および生理学的メカニズムの理解を改善し,より健康的な肉製品の選択によりヒトの健康を改善する。Copyright 2022 Wiley Publishing Japan K.K. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】
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牛 
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