プレプリント
J-GLOBAL ID:202202217484662073   整理番号:22P0326481

機構に基づく架橋プローブは立体配座的に区別した触媒状態における大腸菌ケトシンターゼFabBを捕捉する【JST・京大機械翻訳】

Mechanism-based crosslinking probes capture E. coli ketosynthase FabB in conformationally-distinct catalytic states.
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発行年: 2022年04月04日  プレプリントサーバーでの情報更新日: 2022年04月04日
JST資料番号: O7001B  資料種別: プレプリント
記事区分: プレプリント  発行国: アメリカ合衆国 (USA)  言語: 英語 (EN)
抄録/ポイント:
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ケトシンターゼ(KS)は2段階,ピンポン反応メカニズムを用いて脂肪酸生合成における必須炭素-炭素結合形成反応を触媒する。E.coliでは,2つのホモ二量体伸長KS,FabBおよびFabFがあり,両者は重複基質選択性を有する。しかし,FabBは外因性UFAsの非存在下で細胞生存に必要な不飽和脂肪酸(UFAs)の生合成に必須である。さらに,FabBは14炭素より長い基質に対して活性を低下させたが,FabFは飽和C14及び不飽和C16:1アシル-アシルキャリア蛋白質(ACP)複合体の伸長を効率的に触媒した。本研究では,触媒段階を近似する長鎖脂肪酸架橋プローブで官能化されたACPsと複合体中のFabBの2つの架橋結晶構造を解いた。両ホモ二量体構造は非対称基質結合ポケットを有し,C14及びC16アシル鎖に従事するとき2つのFabB単量体間の協同的関係を示唆した。さらに,これらの構造は活性部位ゲーティング残基F392の異常な回転異性体を捕捉し,基質放出前の触媒状態を代表する可能性がある。これらの構造は,KS媒介触媒作用を伴う近原子分解能立体配座遷移で捕捉し,解明するための機構に基づく架橋法の有用性を示す。【JST・京大機械翻訳】
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分類 (2件):
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JSTが定めた文献の分類名称とコードです
代謝と栄養  ,  遺伝子発現 

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