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J-GLOBAL ID：202202232090879053   整理番号：22A0491117

Streptomyces coelicolorメチルマロニル-CoAエピメラーゼの活性部位で捕獲された基質エノラート中間体と模倣体【JST・京大機械翻訳】

Substrate Enolate Intermediate and Mimic Captured in the Active Site of Streptomyces coelicolor Methylmalonyl-CoA Epimerase

著者 (5件)： Stunkard Lee M. (Department of Biochemistry, Purdue University, 175 S. University St., West Lafayette, IN 47907, USA) ,  Benjamin Aaron B. (Department of Biochemistry, Purdue University, 175 S. University St., West Lafayette, IN 47907, USA) ,  Bower James B. (Department of Biochemistry, Purdue University, 175 S. University St., West Lafayette, IN 47907, USA) ,  Huth Tyler J. (Department of Biochemistry, Purdue University, 175 S. University St., West Lafayette, IN 47907, USA) ,  Lohman Jeremy R. (Department of Biochemistry, Purdue University, 175 S. University St., West Lafayette, IN 47907, USA)
資料名： ChemBioChem  (ChemBioChem)
巻： 23  号： 2  ページ： e202100487  発行年： 2022年 
JST資料番号： W1258A  ISSN： 1439-4227  CODEN： CBCHFX  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： メチルマロニル-CoAエピメラーゼ(MMCE)は,一般的な酸塩基触媒を使用すると提案されているが,提案された触媒グルタミン酸は,多くの他のラセマーゼとは異なり,活性部位で高度に非対称である。触媒機構,構造,および基質選択性の間のpuling関係への洞察を得るために,中間体/遷移状態類似体である基質または2-ニトロプロピオニル-CoAを有するStreptomyces coelicolor MMCE構造を解明した。両配位子結合構造は平面メチルマロン酸/2-ニトロプロピオニル部分を有し,触媒酸に対する≧4Å距離の脱プロトン化C_2を示した。両グルタミン酸塩は,直接または他の残基を通して,カルボキシラート/ニトロ基と相互作用する。これは,提案した触媒酸が,エノラート中間体を有する基質のC_2とカルボキシレートの間のプロトン移動を逐次的に触媒することを示唆する。さらに,我々の構造は,コンビナトリアル生合成をサポートするための基質範囲を拡大するための変異を設計するためのプラットフォームを提供する。Copyright 2022 Wiley Publishing Japan K.K. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 相互作用 ,  プロトン移動 ,  *基質 ,  基質特異性 ,  *活性部位 ,  非対称性 ,  *エピメラーゼ ,  ラセマーゼ ,  カルボン酸塩 ,  ニトロ基 ,  *エノラート ,  *Streptomyces coelicolor ,  脱プロトン ,  *中間体 ,  アミノ酸 ,  脂肪族アミン ,  脂肪族カルボン酸 ,  ジカルボン酸 ,  第一アミン

著者キーワード (5件)： キラリティー ,  立体配座変化 ,  イソメラーゼ ,  等配電子 ,  金属酵素

分類 (1件)： 酵素一般  (EB09010D)

物質索引 (1件)： グルタミン酸

タイトルに関連する用語 (9件)： Streptomyces ,  メチルマロニル-CoA ,  エピメラーゼ ,  活性部位 ,  捕獲 ,  基質 ,  エノラート ,  中間体 ,  模倣