Yokogawa Takashi

ヨコガワタカシ | Yokogawa Takashi

Affiliation and department：
Other affiliations (2)：

連合創薬医療情報研究科教授
自然科学技術研究科教授

Research field (4)： Biochemistry , Molecular biology , Physical and health education , Functional biochemistry

Research keywords (18)： Functional analysis of RNA , Protein synthesis , RNA工学 , タンパク質工学 , 環状RNA , アミノアシルtRNA合成酵素 , 分子進化工学 , 転写後修飾 , アーキア , 遺伝暗号表 , 分子整形術 , Click Chemistry , GTP結合タンパク質 , 無細胞タンパク質合成系 , アジドチロシン , PUREシステム , 非天然アミノ酸 , tRNA

Research theme for competitive and other funds (29)：

2020 - 2023 複合tRNA修飾酵素の各サブユニットの役割と基質tRNA認識機構の解明
2019 - 2022 Development of protein production system by using translation system from mesophilic methanogen
2018 - 2020 Development of method for analysis of long non-coding RNA by combination of DNAzyme, solid-phase DNA probe and mass spectrometry
2015 - 2016 遺伝子工学を活用したメタン菌の改良と液体燃料生成
2011 - 2014 Comparative characterization of tRNA splicing mechanism in Eukarya and Archaea

2008 - 2011 Designing novel functions of proteins by using an artificial genetic code dictionary

2011 - 非天然アミノ酸を利用したタンパク質の高機能化

2010 - 獣毛製品鑑定に関する研究

2009 - 獣毛製品鑑定に関する研究

2008 - 2009 獣毛のDNA分析による属の鑑別

2006 - 2008 タンパク質の新規N末端特異的修飾法の開発とDNAリンクタンパク質の創製

2006 - 2007 タンパク質の新規N末端特異的修飾法の開発とDNAリンクタンパク質の創製

2005 - 2006 蛍光修飾蛋白質の相互作用解析に関する研究

2004 - 2006 Site-selective introduction of unnatural amino acid into proteins and its use for analyses of structure-function relationship of proteins.

2004 - 2005 バクテリアのタンパク質合成系に関与する未知遺伝子群の探索

2002 - 2005 分子進化工学を用いたチロシルtRNA合成酵素のアミノ酸特異性のスイッチング

2005 - 純化タンパク質合成系の高機能化および安定化に関する研究

2003 - 2004 次々世代を担う研究者の支援プログラム

2003 - 2004 バクテリアのタンパク質合成系に未知遺伝子は存在するか?

2002 - 2004 複数の蛍光プローブを用いた機能性RNA分子のモーションキャプチャー

2004 - 2004 バクテリアのタンパク質合成系に関与する未知遺伝子群の探索

2002 - 2004 分子進化工学を用いたチロシルtRNA合成酵素のアミノ酸特異性のスイッチング

2003 - 2003 バクテリアのタンパク質合成系に未知遺伝子は存在するか?

2002 - 2003 複数の蛍光プローブを用いた機能性RNA分子のモーションキャプチャー

2000 - 2001 Identification and Conversion of Molecular Recognition Elements in Yeast Tyrosine tRNA

2000 - 2001 非天然アミノ酸を認識するアミノアシルtRNA合成酵素の創製

1994 - 1994 異常構造を持つtRNAに対するミトコンドリア・セリルtRNA合成酵素の認識機構

1991 - 1993 Studies on in vitro translation system of mitochondria

1986 - 非天然アミノ酸を含む有用タンパク質の創製

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Papers (61)：

Naoshi Shimojo, Akiko Yagami, Fumiaki Ohno, Yuta Tsurumi, Masashi Nakamura, Kayoko Suzuki, Kazunobu Kuwabara, Kyoko Futamura, Satoshi Ohno, Takashi Yokogawa, et al. Fish collagen as a potential indicator of severe allergic reactions among patients with fish allergies. Clinical and experimental allergy : journal of the British Society for Allergy and Clinical Immunology. 2022. 52. 1. 183-187
Nariyasu Tahara, Itaru Tachibana, Kazuyo Takeo, Shinji Yamashita, Atsuhiro Shimada, Misuzu Hashimoto, Satoshi Ohno, Takashi Yokogawa, Tsutomu Nakagawa, Fumiaki Suzuki, et al. Boosting Auto-induction of Recombinant Proteins in Escherichia coli with Glucose and Lactose Additives. Protein and peptide letters. 2021. 28. 10. 1180-1190
Keita Hibi, Kazuaki Amikura, Naoki Sugiura, Keiko Masuda, Satoshi Ohno, Takashi Yokogawa, Takuya Ueda, Yoshihiro Shimizu. Reconstituted cell-free protein synthesis using in vitro transcribed tRNAs. Communications biology. 2020. 3. 1. 350-350
Shizuka Arakawa, Kohsuke Kamizaki, Yusuke Kuwana, Naruki Kataoka, Chieko Naoe, Chie Takemoto, Takashi Yokogawa, Hiroyuki Hori. Application of solid-phase DNA probe method with cleavage by deoxyribozyme for analysis of long non-coding RNAs. Journal of Biochemistry. 2020. 168. 3. 273-283
Takashi Yokogawa, Yuichiro Nomura, Akihiro Yasuda, Hiromi Ogino, Keita Hiura, Saori Nakada, Natsuhisa Oka, Kaori Ando, Takuya Kawamura, Akira Hirata, et al. Identification of a radical SAM enzyme involved in the synthesis of archaeosine. Nat. Chem. Biol. 2019. 15. 12. 1148-1155

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MISC (54)：

桑名祐輔, 上崎晃輔, 荒川静花, 白水美香子, 竹本千重, 横川隆志, 堀弘幸. Search for pseudouridine synthase genes for 16S rRNA modification of an extremely-thermophilic eubacterium. 日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web). 2021. 44th
桑名祐輔, 上崎晃輔, 荒川靜花, 白水美香子, 竹本千重, 横川隆志, 堀弘幸. 高度好熱菌シュードウリジン合成酵素遺伝子二重破壊株の作成方法の開発. 日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web). 2020. 43rd
横堀伸一, 馬場柾, 橋本ちひろ, 古川龍太郎, 松田直樹, 松田直樹, 遠藤有紀, 佐藤陸, 笹本峻弘, 横川隆志, et al. 祖先アミノアシルtRNA合成酵素の復元. 日本生化学会大会(Web). 2020. 93rd
竹本千重, 川添将仁, 小西史一, 横川隆志, 直枝智恵子, 苫米地由里, 板垣貴, 白水美香子, 横山茂之. 可変領域が最も長いtRNA^SerのX線結晶構造解析. 日本RNA学会年会要旨集. 2019. 21st
横堀伸一, 馬場柾, 笹本峻弘, 松田直樹, 橋本ちひろ, 村松あやか, 佐藤陸, 遠藤有紀, 宮下奈津実, 丸山真歩, et al. 祖先アミノアシルtRNA合成酵素の復元に基づく遺伝暗号の進化の解析. 日本進化学会大会プログラム・講演要旨集(Web). 2019. 21st

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Patents (12)：

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Lectures and oral presentations (8)：

Methanosarcina acetivoransのイントロン含有tRNA前駆体と結合するタンパク質群の解析
(24回Archaea研究会 2011)
Methanosarcina acetivoransにおけるAUAコドン解読機構
(23回Archaea研究会 2010)
Preparation of an ochre suppressor tRNA recognizing exclusively UAA codon by using the molecular surgery technique
(核酸化学シンポジウム 2009)
Methanosarcina acetivorans PylRS を利用した部位特異的リシンアナログ導入タンパク質の合成
(22回Archaea研究会 2009)
Methanosarcina acetivoransピロリシルtRNA合成酵素を利用したタンパク質の部位特異的修飾の試み
(第10回RNAミーティング 2008)

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Education (3)：

1989 - 1992 Tokyo Institute of Technology Interdisciplinary Graduate School of Science and Engineering
1987 - 1989 東京大学大学院工学系研究科合成化学専攻修士課程
1983 - 1987 The University of Tokyo The Faculty of Engineering

Professional career (1)：

博士(理学) (東京工業大学)

Work history (4)：

2013 - Gifu University Faculty of Engineering
2007/04/01 - Gifu University
1995/12/01 - Gifu University
Gifu University Faculty of Engineering, Department of Biomolecular Science

Awards (1)：

1999 - 日本生化学会JB論文賞

Association Membership(s) (3)：

日本RNA学会 , 日本分子生物学会 , 日本生化学会

※ Researcher’s information displayed in J-GLOBAL is based on the information registered in researchmap. For details, see here.

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