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J-GLOBAL ID:200903014024143348

糖鎖修飾タンパク質又は糖鎖修飾ペプチド同定方法及び装置

Inventor:
Applicant, Patent owner:
Agent (1): 平木 祐輔
Gazette classification:公開公報
Application number (International application number):2006225715
Publication number (International publication number):2008051552
Application date: Aug. 22, 2006
Publication date: Mar. 06, 2008
Summary:
【課題】糖鎖修飾ペプチドから糖鎖を遊離することなく、糖鎖及びペプチドシーケンス解析を行う。【解決手段】シアル酸やフコースの脱離が起こりにくい負イオンモードCIDで糖鎖構造解析を行い、正イオンモードECDでペプチドシーケンス解析を行う。【選択図】図1
Claim (excerpt):
試料を負イオンにイオン化する工程と、 前記負イオンの衝突誘起解離(CID)あるいは赤外多光子解離(IRMPD)によるタンデム質量分析を行う工程と、 試料を正イオンにイオン化する工程と、 前記正イオンの電子捕獲解離(ECD)あるいは電子移動解離(ETD)によるタンデム質量分析を行う工程と、 前記CID又はIRMPDによるタンデム質量分析により取得したスペクトルデータから、該当する糖鎖情報を抽出する工程と、 前記ECD又はETDモードによるタンデム質量分析により取得したスペクトルデータから、該当するタンパク質又はペプチドと修飾部位情報を抽出する工程と、 抽出された前記タンパク質又はペプチドと修飾部位情報により前記試料の同定をする工程と を有することを特徴とする糖鎖修飾タンパク質又は糖鎖修飾ペプチド同定方法。
IPC (4):
G01N 27/62 ,  G01N 33/68 ,  B82B 3/00 ,  H01J 49/26
FI (4):
G01N27/62 V ,  G01N33/68 ,  B82B3/00 ,  H01J49/26
F-Term (23):
2G041CA01 ,  2G041CA03 ,  2G041EA04 ,  2G041FA10 ,  2G041FA12 ,  2G041GA03 ,  2G041GA05 ,  2G041GA06 ,  2G041GA08 ,  2G041GA09 ,  2G041GA10 ,  2G041HA01 ,  2G041KA01 ,  2G041LA07 ,  2G045BB02 ,  2G045BB03 ,  2G045CA25 ,  2G045DA44 ,  2G045FA36 ,  2G045FB01 ,  2G045FB06 ,  5C038HH28 ,  5C038HH30
Patent cited by the Patent:
Cited by applicant (1) Cited by examiner (1)
  • 糖鎖構造同定方法及び同解析装置
    Gazette classification:公開公報   Application number:特願2004-080611   Applicant:独立行政法人産業技術総合研究所, 三井情報開発株式会社, 株式会社島津製作所
Article cited by the Patent:
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