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J-GLOBAL ID:200903016468674172

微生物識別方法、微生物識別装置、微生物識別用データベースの作成方法および微生物識別プログラムを記録した記録媒体

Inventor:
Applicant, Patent owner:
Agent (1): 福島 祥人
Gazette classification:公開公報
Application number (International application number):2001400953
Publication number (International publication number):2002325586
Application date: Dec. 28, 2001
Publication date: Nov. 12, 2002
Summary:
【要約】【課題】 微生物群を構成する複数の微生物を同時にかつ容易に識別することが可能な微生物識別方法、微生物識別装置および微生物識別用データベースの作成方法および微生物識別プログラムを記録した記録媒体を提供することである。【解決手段】 微生物識別方法は、SSC-PCR法により微生物の解析実験を行うステップS1と、解析実験により得られた電気泳動像を取り込むステップS2と、画像データから電気泳動像の輝度分布を示す波形データを生成するステップS3と、波形データを補正するステップS4と、波形データを連結するステップS5と、波形データを用いてデータベースの検索を行うステップS6と、結果を表示するステップS7とから構成される。
Claim (excerpt):
識別対象となる微生物を識別する微生物識別方法であって、複数のプライマーを準備し、前記複数のプライマーの各々を用いて、識別対象となる微生物のDNAに対し、熱変成工程、プライマーのアニーリング工程およびポリメラーゼによる伸長反応工程をこの順序で繰り返し行うポリメラーゼ連鎖反応法を一度に適用することにより、前記識別対象となる微生物のDNAのDNA断片を増幅するステップと、前記複数のプライマーの各々を用いて増幅されたDNA断片に対して電気泳動法を適用し、各プライマーに対応する電気泳動像を得るステップと、各プライマーに対応する前記電気泳動像を画像データに変換するステップと、前記画像データに基づいて各プライマーに対応する前記電気泳動像における輝度分布を示す波形データを求めるステップと、照合対象となる微生物についての複数のプライマーに対応する電気泳動像に関する情報が予め記憶されたデータベースを検索し、前記データベースに記憶された情報に基づいて前記照合対象となる微生物についての複数のプライマーに対応する電気泳動像における輝度分布を示す波形データを求め、前記識別対象となる微生物について求められた前記波形データと前記照合対象となる微生物について求められた前記波形データとの相関関係を求めるステップと、前記相関関係に基づいて前記識別対象となる微生物を識別するステップとを備えたことを特徴とする微生物識別方法。
IPC (7):
C12N 15/09 ZNA ,  B01D 57/02 ,  B03C 5/00 ,  C12M 1/00 ,  C12Q 1/68 ,  G01N 27/447 ,  G06F 17/30 170
FI (8):
B01D 57/02 ,  B03C 5/00 Z ,  C12M 1/00 A ,  C12Q 1/68 A ,  G06F 17/30 170 F ,  C12N 15/00 ZNA A ,  G01N 27/26 325 B ,  G01N 27/26 325 D
F-Term (20):
4B024AA11 ,  4B024AA19 ,  4B024CA04 ,  4B024EA04 ,  4B024HA11 ,  4B024HA19 ,  4B029AA23 ,  4B029BB20 ,  4B029CC08 ,  4B063QA01 ,  4B063QQ05 ,  4B063QQ41 ,  4B063QR32 ,  4B063QR55 ,  4B063QR62 ,  4B063QS34 ,  4D054FA10 ,  4D054FB20 ,  5B075ND20 ,  5B075UU19
Patent cited by the Patent:
Cited by examiner (3)
Article cited by the Patent:
Cited by examiner (3)

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