DNAアミノ酸配列比較方法

Inventor： , ,
Applicant, Patent owner：
Agent (1)：平木祐輔
Gazette classification：公開公報
Application number (International application number)：1996167770
Publication number (International publication number)：1998005000
Application date： Jun. 27, 1996
Publication date： Jan. 13, 1998
Summary：

【要約】【課題】 DNA配列に挿入あるいは欠失が存在しても類似している既知アミノ酸配列を高感度に検索できるDNA配列とアミノ酸配列の直接比較方法を提供する。【解決手段】 DNA配列をアミノ酸への翻訳規則にのっとってアミノ酸配列に翻訳する手段305、翻訳アミノ酸配列と既知アミノ酸配列をDNA配列に存在する挿入あるいは欠失を考慮して比較を行う手段306、比較結果に基づいて、翻訳アミノ酸配列と既知アミノ酸配列の並置結果をDNA配列と共に表示する手段307を順次実行し、検索結果を出力する。【効果】新たに決定されたDNA配列に対して配列中に存在する挿入あるいは欠失を考慮して、類似しているアミノ酸配列を高感度に検索を行うことができ、類似している部分を並置結果として表示することで、DNA配列の持つ機能を類推することが容易となる。

Claim (excerpt)：

塩基の挿入あるいは欠失を含むまたは含まないDNA配列とアミノ酸配列を直接比較する比較方法において、前記DNA配列を所定の長さの塩基群に分割し、分割された塩基群について所定の方向に塩基をずらしてアミノ酸に翻訳し、そのデーターを前記アミノ酸配列と比較して並置を行いその結果を表示することを特徴とするDNAアミノ酸配列比較方法。

IPC (2)：

C12Q 1/68 ZNA , C12N 15/09

FI (2)：

C12Q 1/68 ZNA Z , C12N 15/00 A

Patent cited by the Patent：

Cited by examiner (8)

文字配列検索方法
Gazette classification：公開公報 Application number：特願平6-247507 Applicant：株式会社日立製作所
文字配列検索方法
Gazette classification：公開公報 Application number：特願平6-177989 Applicant：株式会社日立製作所
配列検索方法および装置
Gazette classification：公開公報 Application number：特願平6-247506 Applicant：株式会社日立製作所

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