超並列高速シークエンサーによる簡便なHLA遺伝子のDNAタイピング方法およびキット

Inventor： , , , ,
Applicant, Patent owner：
Agent (1)：内田直人
Gazette classification：特許公報
Application number (International application number)：2015550999
Patent number：6643902
Application date： Nov. 27, 2014
Claim (excerpt)：

【請求項1】(1)ヒトゲノム塩基配列におけるHLA-DRB1、HLA-DRB3、HLA-DRB4、HLA-DRB5、HLA-DQB1、およびHLA-DPB1からなる群から選択される少なくとも1つの対象遺伝子のプライマーセットを準備するステップであって、当該プライマーセットがイントロン1領域およびエクソン4領域に各々特異的にアニールし、エクソン2、イントロン2、エクソン3、イントロン3およびエクソン4の一部を含む領域を増幅するものであり、前記対象遺伝子がHLA-DRB1、HLA-DRB3、HLA-DRB4およびHLA-DRB5からなる群から選択される少なくとも1つの遺伝子である場合には、前記プライマーセットがそれぞれ配列番号:1および配列番号:2に示す塩基配列を有するオリゴヌクレオチドであり、前記対象遺伝子がHLA-DQB1遺伝子である場合には、前記プライマーセットがそれぞれ配列番号:3および4のいずれか一方または両方および配列番号:5に示す塩基配列を有するオリゴヌクレオチドであり、前記対象遺伝子がHLA-DPB1遺伝子である場合には、前記プライマーセットがそれぞれ配列番号:6および配列番号:7に示す塩基配列を有するオリゴヌクレオチドである、ステップ; (2)前記プライマーセットを用いて被検試料(DNA)をPCR法によりDNA増幅するステップ; (3)増幅されたPCR産物の塩基配列を決定するステップ;および (4)任意に、データベースとのホモロジー検索を実施するステップを含む、HLA遺伝子のDNAタイピング方法。

IPC (3)：

C12Q 1/6876 ( 201 8.01) , C12N 15/09 ( 200 6.01) , G01N 33/53 ( 200 6.01)

FI (3)：

C12Q 1/687 ZNA Z , C12N 15/09 Z , G01N 33/53 M

Patent cited by the Patent：

Cited by applicant (2)

HLA変異体の検出のためのシステムおよび方法
Gazette classification：公表公報 Application number：特願2012-505088 Applicant：エフ.ホフマン-ラロシュアーゲー
HLA遺伝子のマルチプレックスDNAタイピング方法及びキット
Gazette classification：公開公報 Application number：特願2013-099547 Applicant：ジェノダイブファーマ株式会社

Cited by examiner (2)

HLA変異体の検出のためのシステムおよび方法
Gazette classification：公表公報 Application number：特願2012-505088 Applicant：エフ.ホフマン-ラロシュアーゲー
HLA遺伝子のマルチプレックスDNAタイピング方法及びキット
Gazette classification：公開公報 Application number：特願2013-099547 Applicant：ジェノダイブファーマ株式会社

Article cited by the Patent：

Cited by applicant (7)

PNAS, 2012, Vol.109, No.22, p.8676-8681
MHC, 2012, Vol.19, No.2, p.211-222
Human Immunology, 20131117, Vol.74, p.160, 165-P

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Cited by examiner (10)

PNAS, 2012, Vol.109, No.22, p.8676-8681
MHC, 2012, Vol.19, No.2, p.211-222
Human Immunology, 20131117, Vol.74, p.160, 165-P

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