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J-GLOBAL ID：202303001586803346

細胞系譜生成方法、プログラム、及び細胞系譜生成装置

Inventor： 八木 健 ,  内村 有邦 ,  佐藤 康成 ,  松本 拡高
Applicant, Patent owner： 国立大学法人大阪大学 ,  公益財団法人 放射線影響研究所
Agent (1)： 新居 広守
Gazette classification：特許公報
Application number (International application number)：2019139833
Publication number (International publication number)：2021019564
Patent number：7355325
Application date： Jul. 30, 2019
Publication date： Feb. 18, 2021
Claim (excerpt)：

【請求項1】 分析対象とする個体の第1組織を構成する複数の細胞における、第1変異の頻度を示す第1頻度、第2変異の頻度を示す第2頻度、及び、第3変異の頻度を示す第3頻度を取得し、前記個体の第2組織を構成する複数の細胞における、前記第1変異の頻度を示す第4頻度、前記第2変異の頻度を示す第5頻度、及び、前記第3変異の頻度を示す第6頻度を取得する取得ステップと、 前記第2頻度と前記第3頻度との和が前記第1頻度に一致又はほぼ一致し、かつ、前記第5頻度と前記第6頻度との和が前記第4頻度に一致又はほぼ一致するか否かを判定する判定ステップと、 前記判定ステップにおける判定結果に基づき、前記第1変異、前記第2変異、及び前記第3変異の関係を分析して、前記個体の細胞における変異に基づく細胞系譜を生成する分析ステップと、を含み、 前記分析ステップでは、 前記第2頻度と前記第3頻度との和が前記第1頻度に一致又はほぼ一致し、かつ、前記第5頻度と前記第6頻度との和が前記第4頻度に一致又はほぼ一致すると判定された場合に、前記第1変異を有する第1細胞、前記第2変異を有する第2細胞、及び前記第3変異を有する第3細胞は、前記第1細胞から、前記第2細胞又は前記第3細胞へと分岐する第1分岐点の関係を有すると決定し、 決定した前記第1分岐点の関係に整合する前記細胞系譜を生成する 細胞系譜生成方法。

IPC (3)：

C12Q 1/6869 ( 201 8.01) ,  C12M 1/34 ( 200 6.01) ,  C12N 15/09 ( 200 6.01)

FI (3)：

C12Q 1/686 Z ,  C12M 1/34 B ,  C12N 15/09 Z

Patent cited by the Patent：

Cited by examiner (1)

• 系統樹を構築する装置、方法およびシステム
  Gazette classification：公開公報   Application number：特願2015-113297   Applicant：株式会社日立製作所

Article cited by the Patent：

Cited by examiner (3)

• BMC Bioinformatics, 2014, Vol.15, No.35, pp.1-16
• PLoS Comput. Biol., 2014, Vol.10, No.7, e1003703, pp.1-15
• Nature Genetics, 2015, Vol.47, No.4, pp.367-372, ONLINE METHODS