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J-GLOBAL ID：201602252549644258   整理番号：16A0721368

スーパーコンピュータ「京」上でのエクソーム解析パイプラインの開発

Development of Exome Analysis Pipeline on the K Computer

著者 (8件)： 青山健人 (東京工大 大学院情報理工学研究科) ,  青山健人 (東京工大) ,  角田将典 (東京工大 大学院情報理工学研究科) ,  松崎由理 (東京工大) ,  石田貴士 (東京工大 大学院情報理工学研究科) ,  石田貴士 (東京工大) ,  秋山泰 (東京工大 大学院情報理工学研究科) ,  秋山泰 (東京工大)
資料名： 情報処理学会論文誌トランザクション コンピューティングシステム(Web)  (情報処理学会論文誌 コンピューティングシステム(Web))
巻： 9  号： 2  ページ： 15-33 (WEB ONLY)  発行年： 2016年07月14日 
JST資料番号： U0477A  ISSN： 1882-7829  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 日本 (JPN)  言語： 日本語 (JA)

抄録/ポイント： 近年,次世代シーケンサなどに代表される実験技術の向上による爆...

シソーラス用語： *スーパコンピュータ ,...
準シソーラス用語： MPI【インタフェイス】

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分類 (1件)： 分子・遺伝情報処理  (JE15040B)

引用文献 (29件)：

• Genomon-exome-東京大学医科学研究所ヒトゲノム解析センター,入手先 http://genomon.hgc.jp/exome>.
• Fischer, M., Snajder, R. et al.: SIMPLEX: Cloudenabled pipeline for the comprehensive analysis of exome sequencing data, PLOS ONE, Vol.7, No.8, e41948 (2012).
• NGS analyzer-理化学研究所統合生命医科学研究センター,入手先 http://www.csrp.riken.jp/application_d_j.html.
• 宮崎博行,草野義博,新庄直樹,庄司文由,横川三津夫, 渡邊 貞:スーパーコンピュータ「京」の概要,FUJITSU, Vol.63, No.3, pp.237-246 (2012).
• Michael, J.B., Sarah, B.N. et al.: Exome sequencing as a tool for Mendelian disease gene discovery, Nature Reviews, Vol.12, No.11, pp.745-755 (2011).

タイトルに関連する用語 (4件)： スーパーコンピュータ ,  エクソーム解析 ,  パイプライン ,  開発