文献

J-GLOBAL ID：201702213932059160   整理番号：17A0587832

Thermococcus kodakarensis由来の祖先型β-脱炭酸デヒドロゲナーゼの構造及び機能

Structure and function of an ancestral-type β-decarboxylating dehydrogenase from Thermococcus kodakarensis

著者 (11件)： SHIMIZU Tetsu (Univ. Tokyo, Tokyo, JPN) ,  YIN Lulu (Univ. Tokyo, Tokyo, JPN) ,  YOSHIDA Ayako (Univ. Tokyo, Tokyo, JPN) ,  YOKOOJI Yuusuke (Kyoto Univ., Kyoto, JPN) ,  HACHISUKA Shin-ichi (Kyoto Univ., Kyoto, JPN) ,  SATO Takaaki (Kyoto Univ., Kyoto, JPN) ,  TOMITA Takeo (Univ. Tokyo, Tokyo, JPN) ,  NISHIDA Hiromi (Toyama Prefectural Univ., Toyama, JPN) ,  ATOMI Haruyuki (Kyoto Univ., Kyoto, JPN) ,  KUZUYAMA Tomohisa (Univ. Tokyo, Tokyo, JPN) ,  NISHIYAMA Makoto (Univ. Tokyo, Tokyo, JPN)
資料名： Biochemical Journal  (Biochemical Journal)
巻： 474  号： 1  ページ： 105-122  発行年： 2017年01月 
JST資料番号： B0205A  ISSN： 0264-6021  CODEN： BIJOAK  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 様々な微生物種から集めたβ-脱炭酸デヒドロゲナーゼに関する分子系統発生解析を実施し,β-脱炭酸デヒドロゲナーゼファミリー間の系統発生関連性を明確にした。祖先型β-脱炭酸デヒドロゲナーゼのモデルとして,超好熱性古細菌Thermococcus kodakarensis由来のTK0280に集中した。TK0280の機能的特性化により,ホモイソクエン酸(HIC),イソクエン酸(IC)及び3-イソプロピルリンゴ酸(IPM)に対するそれの広い基質特異性を明らかにし,これらの3基質と複合体を形成したこの酵素の結晶学研究により,Thr71及びSer80はHIC及びICの認識において役割を果たし,Ile82及びLeu83から成る疎水性領域はIPMの認識に寄与することを示した。これらの解析により,TK0280の基質特異性に関するThr71を含むβ3-α4の安定化に対する水素結合ネットワークの重要性を示唆した。

シソーラス用語： *古細菌 ,  *アルコールオキシドレダクターゼ ,  *系統発生 ,  系統樹 ,  高温菌 ,  *基質特異性 ,  分子認識 ,  酵素基質複合体 ,  X線結晶学 ,  結晶構造 ,  アミノ酸残基 ,  ネットワーク ,  Michaelis定数 ,  アミノ酸配列 ,  相同性 ,  脂肪族アルコール ,  脂肪族カルボン酸 ,  第二アルコール ,  ヒドロキシ酸 ,  ポリカルボン酸
準シソーラス用語： *Thermococcus kodakarensis ,  水素結合ネットワーク ,  *分子系統発生

分類 (2件)： 酵素一般  (EB09010D) ,  微生物の生化学  (EG03020N)

物質索引 (3件)： 3-イソプロピルりんご酸 ,  イソくえん酸 ,  ホモイソくえん酸

タイトルに関連する用語 (3件)： Thermococcus ,  脱炭酸 ,  デヒドロゲナーゼ