Rchr
J-GLOBAL ID:200901096723619667
Update date: Mar. 08, 2024
Asai Kiyoshi
アサイ キヨシ | Asai Kiyoshi
Affiliation and department:
Job title:
教授
Other affiliations (1):
-
National Institute of Advanced Industrial Science and Technology
Computational Biology Research Center
Homepage URL (2):
http://asailab.cb.k.u-tokyo.ac.jp/
,
http://www.ncrna.org
Research field (2):
Systems genomics
, Biological, health, and medical informatics
Research keywords (4):
Bioinformatics
, RNA Informatics
, Biological Sequence Design
, stochastic models
Research theme for competitive and other funds (21):
- 2021 - 2024 修飾塩基を持つRNAの情報解析基盤技術の開発
- 2018 - 2023 化学を基盤とするゲノムスケールDNA合成技術の開発
- 2019 - 2022 プライバシー保護データ解析技術の社会実装
- 2016 - 2022 先進ゲノム解析研究推進プラットフォーム
- 2018 - 2021 バイオ医薬品の高度製造技術の開発
- 2016 - 2019 安全な秘匿化データ処理を実現する汎用依頼計算技術
- 2016 - 2019 エピトランスクリプトーム解析のためのRNAインフォマティクス基盤技術
- 2015 - 2018 国際基準に適合した次世代抗体医薬等の製造技術のうち高生産宿主構築の効率化基盤技術の開発に係るもの
- 2012 - 2017 ゲノム配列設計技術
- 2013 - 2016 Development of basic technology for privacy-preserving bioinformatics and its application
- 2013 - 2016 RNA・タンパク質相互作用の網羅的予測と検証
- 2011 - 2016 人材養成プログラム
- 2010 - 2016 ゲノム科学の総合的推進に向けた大規模ゲノム情報生産・高度情報解析支援
- 2010 - 2014 マイクロRNAおよびsnoRNAとその標的の網羅的予測
- 2010 - 2012 大規模生命データ解析
- 2007 - 2011 統合データベース基盤技術開発
- 2007 - 2010 生命情報科学技術者養成コース
- 2005 - 2010 機能性RNAプロジェクト
- 2005 - 2009 比較ゲノム解析のための情報変換モデルの構築と計算手法の開発
- 1995 - 2009 Fuctional RNA Project
- 2000 - 2005 情報表現モデルによるゲノム配列情報のモデル化と予測
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Papers (163):
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Fumitaka Hashiya, Hirotaka Murase, Akash Chandela, Haruka Hiraoka, Masahito Inagaki, Yuko Nakashima, Naoko Abe, Mayu Nakamura, Goro Terai, Yasuaki Kimura, et al. The Effect of γ Phosphate Modified Deoxynucleotide Substrates on PCR Activity and Fidelity. Chembiochem : a European journal of chemical biology. 2023. 24. 14. e202200572
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Mathys Grapotte, Manu Saraswat, Chloé Bessière, Christophe Menichelli, Jordan A. Ramilowski, Jessica Severin, Yoshihide Hayashizaki, Masayoshi Itoh, Michihira Tagami, Mitsuyoshi Murata, et al. Author Correction: Discovery of widespread transcription initiation at microsatellites predictable by sequence-based deep neural network (Nature Communications, (2021), 12, 1, (3297), 10.1038/s41467-021-23143-7). Nature Communications. 2022. 13. 1
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Yukiteru Ono, Michiaki Hamada, Kiyoshi Asai. PBSIM3: a simulator for all types of PacBio and ONT long reads. NAR genomics and bioinformatics. 2022. 4. 4. lqac092
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Yoichiro Ito, Misa Ishigami, Goro Terai, Yasuyuki Nakamura, Noriko Hashiba, Teruyuki Nishi, Hikaru Nakazawa, Tomohisa Hasunuma, Kiyoshi Asai, Mitsuo Umetsu, et al. A streamlined strain engineering workflow with genome-wide screening detects enhanced protein secretion in Komagataella phaffii. Communications Biology. 2022. 5. 1
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Junichi Iwakiri, Kumiko Tanaka, Takeshi Chujo, Hiro Takakuwa, Tomohiro Yamazaki, Goro Terai, Kiyoshi Asai, Tetsuro Hirose. Remarkable improvement in detection of readthrough downstream-of-gene transcripts by semi-extractable RNA-sequencing. RNA. 2022. 29. 2. 170-177
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MISC (75):
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二宮賢介, ALY Mahmoud Khamis, 坂口裕理子, 足達俊吾, 夏目徹, 岩切淳一, 寺井悟朗, 浅井潔, 鈴木勉, 廣瀬哲郎. 核内ストレス体による2つのスプライシング制御機構. 日本RNA学会年会要旨集. 2019. 21st
-
二宮賢介, ALY Mahmoud Khamis, 坂口裕理子, 足達俊吾, 夏目徹, 岩切淳一, 寺井悟朗, 浅井潔, 鈴木勉, 廣瀬哲郎. HSATIII lncRNAによる2つのスプライシング制御機構. 日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web). 2019. 42nd
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二宮賢介, 足達俊吾, 夏目徹, 岩切淳一, 寺井悟朗, 浅井潔, 廣瀬哲郎. 核内ストレス体によるストレス回復期のスプライシング制御. 日本RNA学会年会要旨集. 2018. 20th. 94
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二宮賢介, 足達俊吾, 夏目徹, 岩切淳一, 寺井悟朗, 浅井潔, 廣瀬哲郎. 核内ストレス体によるストレス回復期のスプライシング制御. RNAフロンティアミーティング, 2018. 2018
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森田 啓, 大畑 幸矢, Nuttapong Attrapadung, 縫田 光司, 山田 翔太, 清水 佳奈, 花岡 悟一郎, 浅井 潔. クライアント補助型秘匿計算および基本ツール. 2018年暗号と情報セキュリティシンポジウム(SCIS2018)予稿集. 2018
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Patents (15):
Books (1):
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生物配列の統計 統計科学のフロンティア9
岩波書店 2003 ISBN:4000068490
Education (4):
- 1995 - The University of Tokyo
- 1983 - 1985 The University of Tokyo
- 1981 - 1983 The University of Tokyo The Faculty of Engineering Department of Mathematical Engineering and Information Physics
- 1979 - 1981 The University of Tokyo College of Arts and Sciences
Professional career (1):
Work history (9):
- 2015/04 - 現在 産業技術総合研究所 人工知能研究センター 招聘研究員
- 2007/04 - 現在 The University of Tokyo Undergraduate Program for Bioinformatics and Systems Biology, Faculty of Science
- 2003/04 - 現在 東京大学大学院 新領域創成科学研究科 教授
- 2007/04 - 2014/03 産業技術総合研究所 生命情報工学研究センター 研究センター長
- 2010/04 - 2011/03 Kyoto University Institute for Chemical Research
- 2008/04 - 2010/03 Kyoto University
- 2003/04 - 2007/03 産業技術総合研究所 生命情報科学研究センター 数理モデルチーム長
- 2000/05 - 2006/03 Nara Institute of Science and Technology
- 2001/04 - 2003/03 産業技術総合研究所 生命情報科学研究センター 副研究センター長
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Committee career (12):
- 2024/02 - 現在 AMED 脳神経科学統合プログラム PO
- 2020/11 - 現在 JST CREST「異分野融合による新型コロナウイルスをはじめとした感染症との共生に資する技術基盤の創生」領域アドバイザー
- 2012 - 2020/03 JST CREST「生命動態の理解と制御のための基盤技術の創出」領域アドバイザー
- 2019 - 2019 文部科学省 数学アドバンストイノベーションプラットフォーム 中間評価委員
- 2017 - 2017 文部科学省 数学アドバンストイノベーションプラットフォーム 委託先選定委員
- 2013/04 - 2015/03 日本バイオインフォマティクス学会 会長
- 2014 - International Conference on Genome Informatics (GIW2014) 実行委員長
- 2010/04 - 2013/03 日本バイオインフォマティクス学会 副会長
- 2007 - 日本バイオインフォマティクス学会 2007年年会長
- 1997 - 1999 International Society for Computational Biology Board of Directors
- 1999 - International Conference on Genome Informatics (GIW1999) プログラム委員長
- 1994 - 1998 International Conference on Intelligent Systems for Molecular Biology (ISMB) プログラム委員
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Awards (1):
- 2021 - Japanese Society for Bioinformatics Japanese Society for Bioinformatics Prize
Association Membership(s) (5):
日本RNA学会
, International Society for Computational Biology
, 情報処理学会
, 日本バイオインフォマティクス学会
, 日本分子生物学会
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