文献

J-GLOBAL ID：200902256426936069   整理番号：06A0686534

蛋白質複合体形成での蛋白質柔軟性変化解析のためのグラフ理論アプローチ

A Graph Theoretical Approach for Analysis of Protein Flexibility Change at Protein Complex Formation

著者 (9件)： DEL CARPIO M.Carlos A. (Tohoku Univ., Sendai, JPN) ,  SHAIKH Abdul Rajjak (Tohoku Univ., Sendai, JPN) ,  ICHIISHI Eichiro (Tohoku Univ., Sendai, JPN) ,  KOYAMA Michihisa (Tohoku Univ., Sendai, JPN) ,  KUBO Momoji (Tohoku Univ., Sendai, JPN) ,  KUBO Momoji (JST-PRESTO, Saitama, JPN) ,  NISHIJIMA Kazumi (Tohoku Univ., Sendai, JPN) ,  NISHIJIMA Kazumi (Mochida Pharmaceutical Co. Ltd., Tokyo, JPN) ,  MIYAMOTO Akira (Tohoku Univ., Sendai, JPN)
資料名： Genome Informatics Series  (Genome Informatics Series)
巻： 16  号： 2  ページ： 148-160  発行年： 2005年 
JST資料番号： L4348A  ISSN： 0919-9454  資料種別： 会議録 (C)
記事区分： 原著論文  発行国： 日本 (JPN)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： グラフ理論例を基本とした新しいアルゴリズムを用いて相互作用分...

シソーラス用語： *タンパク質複合体 ,...
準シソーラス用語： HIVプロテアーゼ

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分類 (1件)： 蛋白質・ペプチド一般  (EB03010N)

引用文献 (17件)：

• [1] Brasseur, R., Differentiation of lipid-associating helices by use of three dimensional molecular hydrophobicity potential calculations, J. Biol. Chem., 266: 16120-16127, 1998.
• [2] Del Carpio, C. A., Ichiishi, E., Yoshimori, A., and Yoshikawa, T., MIAX: A new paradigm for modeling boiomacromolecular interactions and complex formation in condensed phases, PROTEINS: Structure, Function and Genetics, 48: 696-732, 2002.
• [3] Del Carpio, C. A., Peissker, T, Yoshimori, A., and Ichiishi, E., Docking Unbound Proteins with MIAX: A novel algorithm for protein-protein soft docking, Genome Inform., 14: 238-249, 2003.
• [4] Fernandez-Recio, J., Abagyan, R., and Totrov, M., Improving CAPRI predictions: Optimized desolvation for rigid-body docking, PROTEINS: Structure, Function, and Bioinformatics, 60: 308-313, 2005.
• [5] Fischer, D., Lin, S. L., Wolfson, L., and Nussinov, R., A geometry-based suite of molecular docking processes, J. Mol. Biol., 248: 459-477, 1995.

タイトルに関連する用語 (4件)： 蛋白質複合体 ,  蛋白質 ,  解析 ,  グラフ理論