DNAアミノ酸配列比較方法

発明者： , ,
出願人/特許権者：
代理人 (1件)：平木祐輔
公報種別：公開公報
出願番号（国際出願番号）：特願平8-167770
公開番号（公開出願番号）：特開平10-005000
出願日： 1996年06月27日
公開日（公表日）： 1998年01月13日
要約：

【要約】【課題】 DNA配列に挿入あるいは欠失が存在しても類似している既知アミノ酸配列を高感度に検索できるDNA配列とアミノ酸配列の直接比較方法を提供する。【解決手段】 DNA配列をアミノ酸への翻訳規則にのっとってアミノ酸配列に翻訳する手段305、翻訳アミノ酸配列と既知アミノ酸配列をDNA配列に存在する挿入あるいは欠失を考慮して比較を行う手段306、比較結果に基づいて、翻訳アミノ酸配列と既知アミノ酸配列の並置結果をDNA配列と共に表示する手段307を順次実行し、検索結果を出力する。【効果】新たに決定されたDNA配列に対して配列中に存在する挿入あるいは欠失を考慮して、類似しているアミノ酸配列を高感度に検索を行うことができ、類似している部分を並置結果として表示することで、DNA配列の持つ機能を類推することが容易となる。

請求項（抜粋）：

塩基の挿入あるいは欠失を含むまたは含まないDNA配列とアミノ酸配列を直接比較する比較方法において、前記DNA配列を所定の長さの塩基群に分割し、分割された塩基群について所定の方向に塩基をずらしてアミノ酸に翻訳し、そのデーターを前記アミノ酸配列と比較して並置を行いその結果を表示することを特徴とするDNAアミノ酸配列比較方法。

IPC (2件)：

C12Q 1/68 ZNA , C12N 15/09

FI (2件)：

C12Q 1/68 ZNA Z , C12N 15/00 A

引用特許：

審査官引用 (14件)

文字配列検索方法
公報種別：公開公報出願番号：特願平6-247507 出願人：株式会社日立製作所
文字配列検索方法
公報種別：公開公報出願番号：特願平6-177989 出願人：株式会社日立製作所
配列検索方法および装置
公報種別：公開公報出願番号：特願平6-247506 出願人：株式会社日立製作所

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