特許
J-GLOBAL ID：200903087308013670

プローブ核酸配列設計方法、プローブ核酸、検出表面、プログラム、情報記憶媒体、並びにプローブ核酸設計システム

発明者：
根岸 真紀子

根岸 真紀子 について


出願人/特許権者：
ソニー株式会社

ソニー株式会社 について


代理人 (1件)： 渡邊 薫
公報種別：公開公報
出願番号（国際出願番号）：特願2006-127943
公開番号（公開出願番号）：特開2007-295872
出願日： 2006年05月01日
公開日（公表日）： 2007年11月15日
要約：
【課題】プローブ核酸の設計段階において、二本鎖核酸とインターカレーターとの相互作用を考慮することにより、バイオアッセイ時などにおける二本鎖核酸の検出精度、定量性などを向上すること。 【解決手段】遺伝子情報として取得した塩基配列から、プローブ核酸に用いる配列を選択するプローブ核酸設計方法であって、2本鎖核酸とインターカレーターとの相互作用に関するプロファイルデータに基づいて、所定の塩基配列を有する配列領域を選択範囲から除外する工程、若しくは前記配列領域の重み付けを行う工程を含むプローブ核酸設計方法を提供する。ここで、プロファイルデータは、インターカレーターの蛍光強度、2本鎖核酸とインターカレーターとの相互作用量などに関する塩基配列ごとのデータである。本発明に基づいてプローブ核酸を設計することにより、バイオアッセイ時などにおける二本鎖核酸の検出精度、定量性などを向上できる。 【選択図】図3
請求項（抜粋）：
遺伝子情報として取得した塩基配列から、プローブ核酸に用いる配列を選択するプローブ核酸設計方法であって、 2本鎖核酸とインターカレーターとの相互作用に関するプロファイルデータに基づいて、所定の塩基配列を有する配列領域を選択範囲から除外する工程、若しくは前記配列領域の重み付けを行う工程を含むプローブ核酸設計方法。
IPC (6件)：
C12Q 1/68 ,  C12N 15/09 ,  C12M 1/00 ,  G01N 33/53 ,  G01N 21/78 ,  G01N 37/00
FI (7件)：
C12Q1/68 A ,  C12N15/00 A ,  C12N15/00 F ,  C12M1/00 A ,  G01N33/53 M ,  G01N21/78 C ,  G01N37/00 102
Fターム (29件)：
2G054AA06 ,  2G054CA22 ,  2G054CE02 ,  2G054EA03 ,  2G054GA04 ,  2G054GB02 ,  2G054GB04 ,  4B024AA11 ,  4B024CA01 ,  4B024CA09 ,  4B024HA14 ,  4B029AA07 ,  4B029BB20 ,  4B029CC03 ,  4B029CC08 ,  4B029FA15 ,  4B063QA01 ,  4B063QA18 ,  4B063QQ42 ,  4B063QQ52 ,  4B063QR08 ,  4B063QR32 ,  4B063QR56 ,  4B063QR62 ,  4B063QR66 ,  4B063QR84 ,  4B063QS25 ,  4B063QS34 ,  4B063QX02
引用特許：
出願人引用 (5件)
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審査官引用 (5件)
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引用文献：
出願人引用 (1件) 審査官引用 (1件)

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