特許
J-GLOBAL ID：200903088966142103

糖鎖構造の予測方法及び予測プログラム

発明者：
伊藤 將弘

伊藤 將弘 について

, 
松室 有紀

松室 有紀 について


出願人/特許権者：
学校法人立命館

学校法人立命館 について


代理人 (3件)： 三枝 英二 ,  掛樋 悠路 ,  松本 公雄
公報種別：公開公報
出願番号（国際出願番号）：特願2006-336632
公開番号（公開出願番号）：特開2008-151514
出願日： 2006年12月14日
公開日（公表日）： 2008年07月03日
要約：
【課題】 質量分析データを用いた糖鎖構造の予測方法及びプログラムを提供すること。 【解決手段】 MS/MSデータの所定ピークを基準として、質量が小さい側の所定範囲中のピークを選択する第1ステップ(S2)と、ピーク間の質量差を用いてデータベースを検索して得られた糖を接続して第1糖鎖を作成する第2ステップ(S2)と、複数種類の第1糖鎖の各々に関して、非還元末端糖を削除して第2糖鎖を生成する第3ステップ(S4)と、同じ非還元末端糖を複数含む第2糖鎖に関して、還元末端に最も近い非還元末端糖のみを残し、その他の非還元末端糖を削除して第3糖鎖を生成する第4ステップ(S4)と、第3糖鎖の各々において、非還元末端糖の非還元末端側に位置する糖を削除して第4糖鎖を生成する第5ステップ(S5)と、全ての第4糖鎖を対象として同じ順位に位置する同じ糖を1つのグループとする第6ステップ(S6)とを含む。【選択図】 図2
請求項（抜粋）：
分析対象の試料を開裂して質量分析することによって得られるMS/MSデータを用いる糖鎖構造の予測方法であって、 測定によって得られた前記MS/MSデータ中の所定のピークを基準として、該ピークよりも質量が小さい所定範囲に存在する複数のピークを選択する第1ステップと、 選択された複数の前記ピーク間の質量差を求め、該質量差を用いて糖の質量の情報を含むデータベースを検索し、検出された複数の糖を接続して第1糖鎖を作成する第2ステップと、 前記第2ステップで作成された前記第1糖鎖が複数種類ある場合、前記第1糖鎖の各々に関して、非還元末端糖を削除して第2糖鎖を生成する第3ステップと、 同じ非還元末端糖を複数含む前記第2糖鎖に関して、還元末端に最も近い前記非還元末端糖のみを残し、その他の前記非還元末端糖を削除して、第3糖鎖を生成する第4ステップと、 前記第3糖鎖の各々において、前記非還元末端糖の非還元末端側に位置する糖を削除して第4糖鎖を生成する第5ステップと、 全ての前記第4糖鎖を対象として、還元末端糖から数えて同じ順位に位置する同じ糖の全てを1つのグループとする第6ステップとを含むことを特徴とする糖鎖構造の予測方法。
IPC (1件)：
G01N 27/62
FI (2件)：
G01N27/62 V ,  G01N27/62 D
Fターム (10件)：
2G041CA01 ,  2G041DA04 ,  2G041EA01 ,  2G041FA10 ,  2G041GA03 ,  2G041GA06 ,  2G041GA09 ,  2G041JA07 ,  2G041LA01 ,  2G041LA05
引用特許：
出願人引用 (2件) 審査官引用 (6件)
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