特許
J-GLOBAL ID：201003024341002896
糖ペプチド構造解析方法及び装置
発明者：
,
出願人/特許権者：
代理人 (1件)：
小林 良平
公報種別：公開公報
出願番号（国際出願番号）：特願2009-104671
公開番号（公開出願番号）：特開2010-256101
出願日： 2009年04月23日
公開日（公表日）： 2010年11月11日
要約：
【課題】目的の糖ペプチド由来のイオンをプリカーサイオンとしたMS/MSスペクトルに基づくデータベース検索により、糖ペプチドを構成するペプチドのアミノ酸配列と糖鎖結合部位とを高い信頼度で推定する。【解決手段】MSスペクトルから糖ペプチド由来のイオンを見つけてMS/MSスペクトルを取得し(S1〜S3)、該スペクトルから全ての糖鎖が脱離したペプチドに帰属される、及び、糖による単純な修飾を受けたペプチドに帰属されるプロダクトイオンを抽出し、各プロダクトイオン以下のm/zを持つピークのリストをそれぞれ作成する(S4,S5)。S4で判明する修飾条件(糖の種類)を検索条件としピークリストをデータベース検索に供し、一致度の高いペプチドの候補をリスト化する(S6〜S8)。各ピークリストの検索結果を総合的に判定し、アミノ酸配列及び糖鎖結合部位の候補のリストを表示する(S9)。【選択図】図2
請求項（抜粋）：
MS/MS分析可能な質量分析装置を用いて糖ペプチドを構成するペプチドと糖鎖結合部位とを同定する糖ペプチド構造解析方法であって、
a)被検試料をMS分析して得られたMSスペクトル中に現れる糖ペプチド由来のイオンを見つけ、該イオンをプリカーサイオンとして選定して前記被検試料に対するMS/MS分析を実行し、MS/MSスペクトルを取得する分析実行ステップと、
b)前記分析実行ステップにより得られたMS/MSスペクトルから、全ての糖鎖が脱離したペプチドに帰属されるプロダクトイオンと糖による単純な修飾を受けたペプチドに帰属されるプロダクトイオンとを探索し、その複数のプロダクトイオン毎にそれぞれ、前記MS/MSスペクトル中でそのプロダクトイオンの質量電荷比以下の質量電荷比を有するイオンピークを列挙したピークリストを作成するピークリスト作成ステップと、
c)前記ピークリスト作成ステップにおいてプロダクトイオンを探索する際に想定された修飾条件と前記ピークリストとを検索条件として、同定用データベースを用いたデータベース検索を実行するデータベース検索実行ステップと、
d)前記データベース検索により、複数のピークリストに対し一致度が相対的に高いとの結果が得られたペプチドのアミノ酸配列及び糖鎖結合部位に関する情報を出力する結果提供ステップと、
を有することを特徴とする糖ペプチド構造解析方法。
IPC (1件)：
FI (2件)：
G01N27/62 V
, G01N27/62 Y
2G041CA01
, 2G041DA04
, 2G041DA05
, 2G041FA10
, 2G041FA12
, 2G041FA13
, 2G041GA04
, 2G041GA06
, 2G041GA08
, 2G041GA09
, 2G041KA01
, 2G041LA07
出願人引用 (5件)
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審査官引用 (5件)
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