特許
J-GLOBAL ID：201203092545457604

系統発生分析のための方法およびシステム

発明者：
ガーリー・エル・アンデルセン

ガーリー・エル・アンデルセン について

, 
トッド・ゼッド・デサンティス

トッド・ゼッド・デサンティス について

, 
エオイン・ブロディー

エオイン・ブロディー について


出願人/特許権者：
ザ リージェンツ オブ ザ ユニバーシティ オブ カリフォルニア

ザ リージェンツ オブ ザ ユニバーシティ オブ カリフォルニア について


代理人 (4件)： 村山 靖彦 ,  志賀 正武 ,  渡邊 隆 ,  実広 信哉
公報種別：公表公報
出願番号（国際出願番号）：特願2012-517804
公開番号（公開出願番号）：特表2012-531211
出願日： 2010年06月25日
公開日（公表日）： 2012年12月10日
要約：
本発明は、生物特異的および/または操作的分類単位(OTU)特異的プローブを設計および使用するための方法およびシステムを開示する。本方法およびシステムは、プローブとの試料中の標的分子のハイブリダイゼーションまたは結合に基づいて、試料中の複数の生体分子または微生物を検出、同定、および定量化することを可能にする。いくつかの実施形態は、クラスタリングツリー上のノードに特異的なオリゴヌクレオチドプローブを選択する方法を提供する。他の実施形態は、高い信頼度を伴って、試料中の複数の生物を正確に検出することにおいて使用するための生物特異的またはOTU特異的オリゴヌクレオチドプローブを選択する方法を提供する。いくつかの実施形態は、試料中の希有なOTUの存在を検出するための方法およびシステムを提供する。
請求項（抜粋）：
1つのアッセイで、少なくとも10,000の異なる操作的分類単位(OTU)の存在、非存在、相対存在量、および/または量を判定することができる複数のプローブを備えるシステム。
IPC (7件)：
C12M 1/00 ,  C12N 15/09 ,  C12Q 1/68 ,  C12Q 1/06 ,  G01N 33/53 ,  G01N 37/00 ,  G01N 33/569
FI (9件)：
C12M1/00 A ,  C12N15/00 F ,  C12N15/00 A ,  C12Q1/68 A ,  C12Q1/06 ,  G01N33/53 M ,  G01N37/00 102 ,  G01N33/569 A ,  G01N33/569 B
Fターム (22件)：
4B024AA11 ,  4B024CA04 ,  4B024CA09 ,  4B024CA20 ,  4B024HA14 ,  4B029AA07 ,  4B029BB20 ,  4B029CC08 ,  4B029FA01 ,  4B029FA15 ,  4B063QA01 ,  4B063QA18 ,  4B063QQ05 ,  4B063QQ06 ,  4B063QQ42 ,  4B063QQ52 ,  4B063QR32 ,  4B063QR56 ,  4B063QR62 ,  4B063QS25 ,  4B063QS34 ,  4B063QX02
引用特許：
審査官引用 (4件)
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