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J-GLOBAL ID：201702210935952496   整理番号：17A0749800

Glycyrrhiza uralensis,薬用マメ科植物のドラフトゲノムアセンブリおよびアノテーション【Powered by NICT】

Draft genome assembly and annotation of Glycyrrhiza uralensis, a medicinal legume

著者 (16件)： Mochida Keiichi (RIKEN Center for Sustainable Resource Science, 1-7-22 Suehiro-cho, Tsurumi-ku, Yokohama, Kanagawa, 230-0045, Japan) ,  Mochida Keiichi (Institute of Plant Science and Resources, Okayama University, Chuo 2-20-1, Kurashiki, Okayama, 710-0046, Japan) ,  Mochida Keiichi (Kihara Institute for Biological Research, Yokohama City University, 641-12 Maioka-cho, Totsuka-ku, Yokohama, Kanagawa, 244-0813, Japan) ,  Sakurai Tetsuya (RIKEN Center for Sustainable Resource Science, 1-7-22 Suehiro-cho, Tsurumi-ku, Yokohama, Kanagawa, 230-0045, Japan) ,  Sakurai Tetsuya (Research and Education Faculty, Multidisciplinary Science Cluster, Interdisciplinary Science Unit, Kochi University, 200 Otsu, Monobe, Nankoku, Kochi, 783-8502, Japan) ,  Seki Hikaru (RIKEN Center for Sustainable Resource Science, 1-7-22 Suehiro-cho, Tsurumi-ku, Yokohama, Kanagawa, 230-0045, Japan) ,  Seki Hikaru (Department of Biotechnology, Graduate School of Engineering, Osaka University, 2-1 Yamadaoka, Suita, Osaka, 565-0871, Japan) ,  Yoshida Takuhiro (RIKEN Center for Sustainable Resource Science, 1-7-22 Suehiro-cho, Tsurumi-ku, Yokohama, Kanagawa, 230-0045, Japan) ,  Takahagi Kotaro (RIKEN Center for Sustainable Resource Science, 1-7-22 Suehiro-cho, Tsurumi-ku, Yokohama, Kanagawa, 230-0045, Japan) ,  Takahagi Kotaro (Kihara Institute for Biological Research, Yokohama City University, 641-12 Maioka-cho, Totsuka-ku, Yokohama, Kanagawa, 244-0813, Japan) ,  Sawai Satoru (RIKEN Center for Sustainable Resource Science, 1-7-22 Suehiro-cho, Tsurumi-ku, Yokohama, Kanagawa, 230-0045, Japan) ,  Uchiyama Hiroshi (Department of Applied Biological Science, College of Bioresource Sciences, Nihon University, 1866 Kameino, Fujisawa, Kanagawa, Japan) ,  Muranaka Toshiya (RIKEN Center for Sustainable Resource Science, 1-7-22 Suehiro-cho, Tsurumi-ku, Yokohama, Kanagawa, 230-0045, Japan) ,  Muranaka Toshiya (Department of Biotechnology, Graduate School of Engineering, Osaka University, 2-1 Yamadaoka, Suita, Osaka, 565-0871, Japan) ,  Saito Kazuki (RIKEN Center for Sustainable Resource Science, 1-7-22 Suehiro-cho, Tsurumi-ku, Yokohama, Kanagawa, 230-0045, Japan) ,  Saito Kazuki (Graduate School of Pharmaceutical Sciences, Chiba University, 1-8-1 Inohana, Chuo-ku, Chiba, 260-8675, Japan)
資料名： Plant Journal  (Plant Journal)
巻： 89  号： 2  ページ： 181-194  発行年： 2017年 
JST資料番号： A1374A  ISSN： 0960-7412  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 中国カンゾウ/カンゾウ(Glycyrrhiza uralensis)は,根および根茎が生薬と天然甘味料として広く使用されているマメ科植物種である。全ゲノム塩基配列決定であるカンゾウ中の遺伝子発見研究と分子育種に必須である。ここでは,G.uralensisの308 19歪の約379,Mb全ゲノム配列のドラフトアセンブリーを報告した。この集合体は34445個の予測蛋白質をコードする遺伝子を含んでいた。比較分析はカンゾウのゲノムとMedicagoおよびヒヨコマメのような他のマメ科植物の間の遺伝子座(シンテニー)の良く保存されたゲノム成分と共線性を示唆した。イソフラボノイド生合成,すなわち,2-ヒドロキシイソフラバノンシンターゼ(CYP93C),2,7,4′-トリヒドロキシイソフラバノン4′-O-methyltransferase/イソフラボン 4′-O-メチルトランスフェラーゼ(HI4OMT)とイソフラボン 7 O メチルトランスフェラーゼ(7 IOMT)に関与する三遺伝子はカンゾウゲノムの足場上で一つのクラスターを形成し,Medicagoおよびヒヨコマメと保存されたミクロシンテニーを示したことを観察した。カンゾウゲノムアノテーションに基づいて,P450の遺伝子とUDP依存性グリコシルトランスフェラーゼ(UGT)スーパーファミリーで,そのいくつかはトリテルペノイドサポニン生合成に関与する,基準ゲノム配列との遺伝子発現を特性化しを予測した。ゲノム解読とその注釈は分子育種によるカンゾウ改善と合成生物学的アプローチによる工学生物活性成分に有用な遺伝子の発見に必須である資源を提供する。Copyright 2017 Wiley Publishing Japan K.K. All Rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【Powered by NICT】

シソーラス用語： 中華人民共和国 ,  イソフラボノイド ,  *カンゾウ ,  メチルトランスフェラーゼ ,  ヒヨコマメ ,  根 ,  遺伝子発現 ,  生合成 ,  タンパク質 ,  *ゲノム ,  クラスタ ,  キャラクタリゼーション ,  ヌクレオチド配列 ,  ウマゴヤシ属
準シソーラス用語： ゲノム配列 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (8件)： Glycyrrhiza uralensis ,  カンゾウ/カンゾウ ,  ゲノム配列 ,  PRJDB3943 ,  シンテニー ,  フラボノイド ,  P450 ,  UDP-依存性グリコシルトランスフェラーゼ

分類 (2件)： 植物生理学一般  (EH02010Y) ,  遺伝子の構造と化学  (EC02020U)

タイトルに関連する用語 (5件)： Glycyrrhiza ,  マメ科植物 ,  ドラフト ,  ゲノムアセンブリ ,  アノテーション