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J-GLOBAL ID：201702251189723488   整理番号：17A1830472

環境DNAは森林池の水からの陸生哺乳類の検出を可能にする【Powered by NICT】

Environmental DNA enables detection of terrestrial mammals from forest pond water

著者 (20件)： Ushio Masayuki (Center for Ecological Research, Kyoto University, Otsu, Japan) ,  Ushio Masayuki (PRESTO, Japan Science and Technology Agency, Kawaguchi, Japan) ,  Ushio Masayuki (Joint Research Center for Science and Technology, Ryukoku University, Otsu, Japan) ,  Fukuda Hisato (Department of Environmental Solution Technology, Ryukoku University, Otsu, Japan) ,  Inoue Toshiki (Department of Environmental Solution Technology, Ryukoku University, Otsu, Japan) ,  Makoto Kobayashi (Teshio Experimental Forest, Field Science Center for Northern Biosphere, Hokkaido University, Hokkaido, Japan) ,  Kishida Osamu (Teshio Experimental Forest, Field Science Center for Northern Biosphere, Hokkaido University, Hokkaido, Japan) ,  Kishida Osamu (Tomakomai Experimental Forest, Field Science Center for Northern Biosphere, Hokkaido University, Hokkaido, Japan) ,  Sato Keiichi (Okinawa Churashima Research Center, Okinawa, Japan) ,  Murata Koichi (College of Bioresource Sciences, Nihon University, Kanagawa, Japan) ,  Murata Koichi (Yokohama Zoological Gardens ZOORASIA, Kanagawa, Japan) ,  Nikaido Masato (School of Life Science and Technology, Tokyo Institute of Technology, Tokyo, Japan) ,  Sado Tetsuya (Natural History Museum and Institute, Chiba, Japan) ,  Sato Yukuto (Tohoku Medical Megabank Organization, Tohoku University, Miyagi, Japan) ,  Takeshita Masamichi (Department of Biological Sciences, The University of Tokyo, Tokyo, Japan) ,  Iwasaki Wataru (Department of Biological Sciences, The University of Tokyo, Tokyo, Japan) ,  Yamanaka Hiroki (Department of Environmental Solution Technology, Ryukoku University, Otsu, Japan) ,  Yamanaka Hiroki (The Research Center for Satoyama Studies, Ryukoku University, Shiga, Japan) ,  Kondoh Michio (Department of Environmental Solution Technology, Ryukoku University, Otsu, Japan) ,  Miya Masaki (Natural History Museum and Institute, Chiba, Japan)
資料名： Molecular Ecology Resources  (Molecular Ecology Resources)
巻： 17  号： 6  ページ： e63-e75  発行年： 2017年 
JST資料番号： W2685A  ISSN： 1755-098X  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 陸上動物は生存への水と頻繁な接触を有し,それらの動物由来の環境DNA(eDNA)は,陸上生態系における水を含む場所から検出可能であることが示唆されなければならない。森林水試料を用いた陸生哺乳類の存在を検出することを目的として,metabarcodingほ乳類eDNAの普遍的PCRプライマー(MiMammal,魚ユニバーサルプライマーの修正版)のセットを適用した。MiMammalプライマーの汎用性を,in silicoおよび組織から抽出したDNA増幅により試験した。結果はMiMammalプライマーであり,哺乳類の種の多様なグループを識別する増幅できることを示唆した。添加では,既知の種組成と哺乳類の動物園ケージからの水試料の分析はMiMammalプライマーは現場で水試料から哺乳類種を検出できることを示唆した。,北海道,北日本の二冷温帯林における池から五500ml水試料を収集して自然生態系から哺乳類を検出する実験を行った。水試料から抽出したeDNAを用いて構築したMiMammalアンプリコンライブラリー,Illumina MiSeqにより生成される定常時系列は,データ処理と分類学的帰属を行った。は,サンプリング地域に共通する哺乳類の複数種を検出し,シカ(Cervus nippon),マウス(Mus musculus),ハタネズミ(Myodes rufocanus),アライグマ(Procyon lotor),ラット(Rattus norvegicus)とトガリネズミ(Sorex unguiculatus)を含む。eDNA metabarcodingアプローチの多くの以前の応用は,水生/半水生系に限られていたが,ここで提示した結果は,この手法が森林哺乳類の生物多様性調査のためにも有望であることを示した。Copyright 2017 Wiley Publishing Japan K.K. All Rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【Powered by NICT】

シソーラス用語： 北海道 ,  *哺乳類 ,  動物園 ,  動物 ,  陸地 ,  トガリネズミ科 ,  水試料 ,  生物多様性 ,  データ処理
準シソーラス用語： ハタネズミ ,  種組成 ,  DNA増幅 ,  陸上生態系 ,  *陸生 ,  *環境DNA , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (6件)： 環境DNA ,  森林 ,  Illumina MiSeq ,  哺乳類 ,  metabarcoding ,  陸上生態系

分類 (2件)： 個体群生態学  (EE03030S) ,  森林生物学一般  (FF02010T)

タイトルに関連する用語 (5件)： 環境DNA ,  森林 ,  水 ,  陸生 ,  哺乳類