文献
J-GLOBAL ID:201802214310438737
整理番号:18A0462658
Pachinko Allocation Modelを用いたクラスタリングによるシングルセル発現解析手法
A method for cluster analysis of single-cell gene expression data using the Pachinko Allocation Model
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著者 (4件):
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資料名:
巻:
2018
号:
MPS-117
ページ:
Vol.2018-MPS-117,No.1,1-6 (WEB ONLY)
発行年:
2018年02月22日
JST資料番号:
U0451A
資料種別:
会議録 (C)
記事区分:
原著論文
発行国:
日本 (JPN)
言語:
日本語 (JA)
抄録/ポイント:
抄録/ポイント
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近年のシングルセル解析技術の発展により,遺伝子発現プロファイ...
シソーラス用語:
シソーラス用語/準シソーラス用語
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分類 (1件):
分類
JSTが定めた文献の分類名称とコードです
分子・遺伝情報処理
引用文献 (14件):
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DuVerle, D. A., Yotsukura, S., Nomura, S., Aburatani, H. and Tsuda, K.: CellTree: an R/bioconductor package to infer the hierarchical structure of cell populations from single-cell RNA-seq data, BMC Bioinformatics, Vol. 17, No. 1, p. 363 (2016).
-
Blei, D. M., Edu, B. B., Ng, A. Y., Edu, A. S., Jordan, M. I. and Edu, J. B.: Latent Dirichlet Allocation, Journal of Machine Learning Research, Vol. 3, pp. 993-1022 (2003).
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ACM: Pachinko allocation: DAG-structured mixture models of topic correlations (2006).
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Kivioja, T., V?h?rautio, A., Karlsson, K., Bonke, M., Enge, M., Linnarsson, S. and Taipale, J.: Counting absolute numbers of molecules using unique molecular identifiers, Nature Methods, Vol. 9, No. 1, pp. 72-74 (2011).
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?urauskien?, J. and Yau, C.: pcaReduce: hierarchical clustering of single cell transcriptional profiles, BMC Bioinformatics, Vol. 17, No. 1, p. 140 (2016).
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