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J-GLOBAL ID：201802271981223923   整理番号：18A1139622

子宮頚部上皮内腫瘍および浸潤性子宮頸癌の日本人女性から分離したヒトパピローマウイルス遺伝子型52および58の全ゲノム解析【JST・京大機械翻訳】

Whole-genome analysis of human papillomavirus genotypes 52 and 58 isolated from Japanese women with cervical intraepithelial neoplasia and invasive cervical cancer

著者 (16件)： Tenjimbayashi Yuri (Department of Obstetrics and Gynecology, Showa University School of Medicine, Tokyo, Japan) ,  Tenjimbayashi Yuri (Pathogen Genomics Center, National Institute of Infectious Diseases, Tokyo, Japan) ,  Onuki Mamiko (Department of Obstetrics and Gynecology, Showa University School of Medicine, Tokyo, Japan) ,  Hirose Yusuke (Department of Obstetrics and Gynecology, Showa University School of Medicine, Tokyo, Japan) ,  Hirose Yusuke (Pathogen Genomics Center, National Institute of Infectious Diseases, Tokyo, Japan) ,  Mori Seiichiro (Pathogen Genomics Center, National Institute of Infectious Diseases, Tokyo, Japan) ,  Ishii Yoshiyuki (Pathogen Genomics Center, National Institute of Infectious Diseases, Tokyo, Japan) ,  Takeuchi Takamasa (Pathogen Genomics Center, National Institute of Infectious Diseases, Tokyo, Japan) ,  Tasaka Nobutaka (Department of Obstetrics and Gynecology, Faculty of Medicine, University of Tsukuba, Tsukuba, Japan) ,  Satoh Toyomi (Department of Obstetrics and Gynecology, Faculty of Medicine, University of Tsukuba, Tsukuba, Japan) ,  Morisada Tohru (Department of Obstetrics and Gynecology, Keio University School of Medicine, Tokyo, Japan) ,  Iwata Takashi (Department of Obstetrics and Gynecology, Keio University School of Medicine, Tokyo, Japan) ,  Miyamoto Shingo (Department of Obstetrics and Gynecology, Showa University School of Medicine, Tokyo, Japan) ,  Matsumoto Koji (Department of Obstetrics and Gynecology, Showa University School of Medicine, Tokyo, Japan) ,  Sekizawa Akihiko (Department of Obstetrics and Gynecology, Showa University School of Medicine, Tokyo, Japan) ,  Kukimoto Iwao (Pathogen Genomics Center, National Institute of Infectious Diseases, Tokyo, Japan)
資料名： Infectious Agents and Cancer (Web)  (Infectious Agents and Cancer (Web))
巻： 12  号： 1  ページ： 44  発行年： 2017年 
JST資料番号： U7324A  ISSN： 1750-9378  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 【背景】ヒトパピローマウイルス遺伝子型52および58(HPV52/58)は,日本を含む東アジア諸国における頚部上皮内腫瘍形成(CIN)および浸潤子宮頸癌(ICC)患者において頻繁に検出される。他のHPV遺伝子型と同様に,HPV52/58は同じHPV遺伝子型の完全ゲノム配列間の10%未満の差を持つ遺伝的変異体の複数の系統から成る。しかしながら,ウイルス全ゲノムにわたるヌクレオチドおよびアミノ酸配列の部位変異は,HPV52/58に対し完全には検討されていない。本研究の目的は,ウイルス全ゲノム配列を分析することによって,日本人女性の間で流行するHPV52/58の遺伝的変異を調査することであった。【方法】HPV52/58の全ゲノム領域を,CINまたはICCを有する日本人患者から分離した頸部剥離細胞から抽出した全細胞DNAを用いて,長距離PCRにより増幅した。増幅されたDNAは,完全なウイルスゲノム配列を決定するために次世代配列決定を受けた。系統発生分析を全ゲノム配列により行い,HPV52/58分離株に変異体系統/サブ系統を割り当てた。ウイルス蛋白質のアミノ酸配列の変動性を,HPV蛋白質の個々のアミノ酸位置におけるShannonエントロピースコアを計算することにより評価した。【結果】HPV52(CIN1,n=20;CIN2/3,n=21;ICC,n=11)の52の分離株の間で,50の分離株は系統B(サブ系統B2)に属し,2つの分離株は系統A(サブ系統A1)に属した。HPV58の48の分離株(CIN1,n=21;CIN2/3,n=19;ICC,n=8)の間で,47の分離株は系統A(サブ系統A1/A2/A3)に属し,1つの分離株は系統Cに属した。個々の変異系統に特異的な一塩基多型を,日本のHPV52/58分離株と参照HPV52/58ゲノムの多重配列アラインメントに基づいてウイルスゲノムを通して決定した。エントロピー分析は,E1蛋白質がHPV52分離株の間で比較的可変であることを明らかにした。一方,E7,E4,およびL2蛋白質は,HPV58分離株の間でいくつかの変異を示した。結論:CII/ICCを有する日本人女性のHPV52/58陽性標本の間で,変異体分布は,組織学的カテゴリーにわたってHPV52とHPV58の系統Aに対して系統Bに対して強く偏っていた。ウイルス全ゲノムを通して,HPV52およびHPV58においてアミノ酸変異の異なるパターンが観察された。Copyright 2018 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *ゲノム ,  変異 ,  アミノ酸 ,  DNA【核酸】 ,  患者 ,  *子宮頚部腫瘍 ,  *日本 ,  アミノ酸配列 ,  ウイルスタンパク質 ,  *ウイルス ,  *遺伝子型 ,  *女性
準シソーラス用語： 分離株 ,  ゲノム配列 ,  *ヒトパピローマウイルス , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： ヒトパピローマウイルス ,  HPV52/58 ,  子宮頚癌 ,  バリアント ,  SNPs

分類 (2件)： 遺伝子の構造と化学  (EC02020U) ,  女性生殖器と胎児の腫よう  (GS04000K)

引用文献 (39件)：

• Nat Rev Cancer; Papillomaviruses and cancer: from basic studies to clinical application; H Hausen; 2; 5; 2002; 342-350; 10.1038/nrc798; CR1;
• Virology; International standardization and classification of human papillomavirus types; D Bzhalava, C Eklund, J Dillner; 476; 2015; 341-344; 10.1016/j.virol.2014.12.028; CR2;
• J Pathol; Are 20 human papillomavirus types causing cervical cancer?; M Arbyn, M Tommasino, C Depuydt, J Dillner; 234; 4; 2014; 431-435; 10.1002/path.4424; CR3;
• Rev Med Virol; Human papillomavirus molecular biology and disease association; J Doorbar, N Egawa, H Griffin, C Kranjec, I Murakami; 25; Suppl 1; 2015; 2-23; 10.1002/rmv.1822; CR4;
• Nat Rev Cancer; Human papillomavirus oncoproteins: pathways to transformation; CA Moody, LA Laimins; 10; 8; 2010; 550-560; 10.1038/nrc2886; CR5;

タイトルに関連する用語 (8件)： 子宮頚部上皮内腫瘍 ,  浸潤 ,  子宮頸癌 ,  日本人 ,  女性 ,  ヒトパピローマウイルス ,  遺伝子型 ,  全ゲノム解析