文献

J-GLOBAL ID：201802277441817521   整理番号：18A1282125

次世代シーケンサーデータの解析手法 第12回 Galaxy:ヒストリーとワークフロー

Methods for analyzing next-generation sequencing data: XII. Galaxy-Sharing histories and workflows

著者 (6件)： 寺田朋子 (東大 大学院農学生命科学研究科) ,  大田達郎 (情報・システム研究機構 データサイエンス共同利用基盤施設 ライフサイエンス統合データベースセ) ,  清水謙多郎 (東大 大学院農学生命科学研究科) ,  清水謙多郎 (東大 微生物科学イノベーション連携研究機構) ,  門田幸二 (東大 大学院農学生命科学研究科) ,  門田幸二 (東大 微生物科学イノベーション連携研究機構)
資料名： 日本乳酸菌学会誌  (Japanese Journal of Lactic Acid Bacteria)
巻： 29  号： 2  ページ： 79-88  発行年： 2018年07月02日 
JST資料番号： L3534A  ISSN： 1343-327X  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 解説  発行国： 日本 (JPN)  言語： 日本語 (JA)

抄録/ポイント： Galaxyは,ウェブブラウザ上でマウスを操作して行うGUI...

シソーラス用語： 自動分析計 ,...
準シソーラス用語： Galaxy ,...

ログイン（無料）して見る     続きはJDreamIII（有料）にて  {{ this.onShowAbsJLink("http://jdream3.com/lp/jglobal/index.html?docNo=18A1282125&from=J-GLOBAL&jstjournalNo=L3534A") }}

分類 (2件)： 分子遺伝学一般  (EC02010J) ,  分子・遺伝情報処理  (JE15040B)

引用文献 (6件)：

• 1) Afgan E, Baker D, van den Beek M, Blankenberg D, Bouvier D, et al. (2016) The Galaxy platform for accessible, reproducible and collaborative biomedical analyses: 2016 update. Nucleic Acids Res 44: W3-W10.
• 2) Bolger AM, Lohse M, Usadel B. (2014) Trimmomatic: a flexible trimmer for Illumina sequence data. Bioinformatics 30: 2114-2120.
• 3) 谷澤靖洋,神沼英里,中村保一,清水謙多郎,門田幸二(2016)次世代シーケンサーデータの解析手法:第 6 回ゲノムアセンブリ.日本乳酸菌学会誌 27: 41-52.
• 4) 大田達郎,寺田朋子,清水謙多郎,門田幸二(2017)次世代シーケンサーデータの解析手法:第 11 回統合データ解析環境 Galaxy.日本乳酸菌学会誌 28: 167-175.
• 5) Mashima J, Kodama Y, Fujisawa T, Katayama T, Okuda Y, et al. (2017) DNA Data Bank of Japan. Nucleic Acids Res 45: D25-D31.

タイトルに関連する用語 (4件)： 次世代シーケンサー ,  解析手法 ,  ヒストリー ,  ワークフロー