文献

J-GLOBAL ID：201802278681232716   整理番号：18A0966710

2つのTrichoderma hamatum株における異なるセロビオース加水分解活性へのゲノミクス洞察【JST・京大機械翻訳】

Genomics insights into different cellobiose hydrolysis activities in two Trichoderma hamatum strains

著者 (13件)： Cheng Peng (Hunan Provincial Key Laboratory of Phytohormones and Growth Development, Hunan Provincial Key Laboratory for Crop Germplasm Innovation and Utilization, Hunan Agricultural University, Changsha, China) ,  Cheng Peng (National Center for Citrus Improvement, Hunan Agricultural University, Changsha, China) ,  Liu Bo (College of Life Science and Technology, Huazhong Agricultural University, Wuhan, China) ,  Su Yi (Hunan Provincial Key Laboratory of Phytohormones and Growth Development, Hunan Provincial Key Laboratory for Crop Germplasm Innovation and Utilization, Hunan Agricultural University, Changsha, China) ,  Hu Yao (College of Life Science and Technology, Huazhong Agricultural University, Wuhan, China) ,  Hong Yahui (Hunan Provincial Key Laboratory of Phytohormones and Growth Development, Hunan Provincial Key Laboratory for Crop Germplasm Innovation and Utilization, Hunan Agricultural University, Changsha, China) ,  Yi Xinxin (College of Life Science and Technology, Huazhong Agricultural University, Wuhan, China) ,  Chen Lei (Hunan Provincial Key Laboratory of Phytohormones and Growth Development, Hunan Provincial Key Laboratory for Crop Germplasm Innovation and Utilization, Hunan Agricultural University, Changsha, China) ,  Su Shengying (Hunan Provincial Key Laboratory of Phytohormones and Growth Development, Hunan Provincial Key Laboratory for Crop Germplasm Innovation and Utilization, Hunan Agricultural University, Changsha, China) ,  Chu Jeffrey S. C. (Wuhan Frasergen Bioinformatics Co. Ltd, Wuahn, China) ,  Chen Nansheng (College of Life Science and Technology, Huazhong Agricultural University, Wuhan, China) ,  Chen Nansheng (Department of Molecular Biology and Biochemistry, Simon Fraser University, Burnaby, Canada) ,  Xiong Xingyao (Hunan Provincial Key Laboratory of Phytohormones and Growth Development, Hunan Provincial Key Laboratory for Crop Germplasm Innovation and Utilization, Hunan Agricultural University, Changsha, China)
資料名： Microbial Cell Factories (Web)  (Microbial Cell Factories (Web))
巻： 16  号： 1  ページ： 63  発行年： 2017年 
JST資料番号： U7049A  ISSN： 1475-2859  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 【背景】効率的バイオマス生物変換は,リグノセルロース廃棄物に関連する代替エネルギー資源および環境問題に対する有望な解決策である。セルロース分解性真菌のTrichoderma種は強いセルロース分解能を有し,それらのセルラーゼ系は広く研究されている。現在,Trichoderma株の主要な制限はβ-グルコシダーゼの低生産である。【結果】2つのTrichoderma hamatum株YYH13とYYH16を,劇的に異なるセルロース分解効率で分離した。YYH13はより高いセロビオース加水分解効率を有する。そのような差異の基礎となる機構を理解するために,YYH13とYYH16のゲノムを配列化し,それらは本質的に同一(それぞれ38.93と38.92Mb)であり,T.hamatum株GD12のそれと類似していた。GeneMark-ESを用いて,YYH13およびYYH16においてそれぞれ11,316および11,755の蛋白質コード遺伝子を注釈した。比較分析は,陽性選択下でYYH13における13の機能的に重要な遺伝子を同定した。オーソログ関係を調べることにより,YYH13,YYH16およびGD12においてそれぞれ172,655および320のゲノム特異的遺伝子を同定した。YYH13とYYH16の間の差異を示す15のプロテアーゼファミリーを見出した。酵素試験は,エキソグルカナーゼ,エンドグルカナーゼおよびβ-グルコシダーゼ活性がYYH16よりYYH13において高いことを示した。さらに,YYH13は,GH1,GH3,GH18,GH35およびGH55ファミリーのキチナーゼ,グルコシダーゼ,ガラクトシダーゼおよびグルカナーゼを含む10ファミリーの炭水化物活性酵素を含み,より強い正の選択圧を受けた。さらに,β-グルコシダーゼ遺伝子(YYH1311079)およびpGEX-KG/YYH1311079細菌発現ベクターは,より高いセロビオース加水分解効率を有するβ-グルコシダーゼの設計に対する価値ある洞察を提供することを見出した。結論:本研究は,T.hamatumのYYH13株がセルロースバイオマスを効率的に分解する強い能力のため,セルラーゼを生産するモデル生物として役立つ可能性を持つことを示唆する。YYH13とYYH16のゲノム配列は,バイオ燃料の効率的生産を研究するための価値ある資源である。Copyright 2018 The Author(s). All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 細菌 ,  グルコシダーゼ ,  *加水分解 ,  セルラーゼ ,  β-グルコシダーゼ ,  ゲノム ,  生体内変化 ,  タンパク質 ,  バイオマス ,  *Trichoderma ,  キチナーゼ ,  生物燃料 ,  リグノセルロース ,  ヘキソース ,  アルドース ,  二糖類 ,  ピラノシド ,  グルコシド
準シソーラス用語： セルロース分解 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： Trichoderma hamatum ,  比較ゲノミクス ,  遺伝的多様性 ,  β-グルコシダーゼ ,  セロビオース

分類 (1件)： 遺伝子の構造と化学  (EC02020U)

物質索引 (1件)： セロビオース

引用文献 (57件)：

• Biotechnol Biofuels; Comparative metabolism of cellulose, sophorose and glucose in Trichoderma reesei using high-throughput genomic and proteomic analyses; LDS Castro, WR Pedersoli, ACC Antoniêto, AS Steindorff, R Silva-Rocha, NM Martinez-Rossi, A Rossi, NA Brown, GH Goldman, VM Faça; 7; 1; 2014; 196-202; CR1;
• New Biotechnol; Enhanced production of xylanase by Aspergillus carneus M34 in solid-state fermentation with agricultural waste using statistical approach; T Fang, B Liao, S Lee; 27; 1; 2009; 25-32; 10.1016/j.nbt.2009.09.008; CR2;
• BMC Biochem; Characterization of a chemostable serine alkaline protease from Periplaneta americana; PT Sanatan, PR Lomate, AP Giri, VK Hivrale; 14; 22; 2013; 1-9; CR3;
• Microb Cell Fact; Enzyme production by filamentous fungi: analysis of the secretome of Trichoderma reesei grown on unconventional carbon source; J He, T Kieselbach, LJ Jönsson; 10; 47; 2010; 68; CR4;
• AMB Express; Characterization of Aspergillus aculeatus, β-glucosidase 1 accelerating cellulose hydrolysis with Trichoderma, cellulase system; Y Baba, JI Sumitani, S Tani, T Kawaguchi; 5; 1; 2015; 1-9; 10.1186/s13568-014-0090-3; CR5;

タイトルに関連する用語 (6件)： Trichoderma ,  株 ,  セロビオース ,  加水分解活性 ,  ゲノミクス ,  洞察