RNA検出方法

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出願人/特許権者：
代理人 (1件)：特許業務法人前田特許事務所
公報種別：公開公報
出願番号（国際出願番号）：特願2017-085299
公開番号（公開出願番号）：特開2018-183065
出願日： 2017年04月24日
公開日（公表日）： 2018年11月22日
要約：

【課題】標的RNA上の任意配列をプローブの認識配列として設定することができると共に、特異性が高いRNA検出方法を実現できるようにする。【解決手段】RNA検出手段は、標的RNA101と、標的RNA101の内部配列に相補的なパドロック型のDNAプローブ102とをハイブリダイズするハイブリダイズ工程S1と、標的RNA101とハイブリダイズされたDNAプローブ102をDNA結合酵素により環状化する環状化工程S2と、DNAプローブ102を環状化した後、ハイブリダイズされている標的RNA101に、RNaseH104を用いてニックを形成するニック形成工程S3と、ニックが形成された標的RNAをプライマー101Aとし、環状化したDNAプローブ102を鋳型として、ローリングサークル型DNA増幅法により一本鎖DNA106の増幅を行う増幅工程S4とを備えている。【選択図】図1

請求項（抜粋）：

標的RNAと、前記標的RNAの内部配列に相補的なパドロック型のDNAプローブとをハイブリダイズするハイブリダイズ工程と、前記標的RNAとハイブリダイズされた前記DNAプローブをDNA結合酵素により環状化する環状化工程と、前記DNAプローブを環状化した後、ハイブリダイズされている前記標的RNAに、RNaseHを用いてニックを形成するニック形成工程と、ニックが形成された前記標的RNAをプライマーとし、環状化した前記DNAプローブを鋳型として、ローリングサークル型DNA増幅法により一本鎖DNAの増幅を行う増幅工程と、を備えているRNA検出方法。

IPC (2件)：

C12Q 1/68 , C12Q 1/48

FI (2件)：

C12Q1/68 A , C12Q1/48 Z

Fターム (9件)：

4B063QA01 , 4B063QQ42 , 4B063QQ52 , 4B063QR32 , 4B063QR35 , 4B063QR56 , 4B063QR62 , 4B063QS24 , 4B063QS34

引用特許：

審査官引用 (1件)

RNAの直接検出法
公報種別：公開公報出願番号：特願2010-271842 出願人：独立行政法人農業・食品産業技術総合研究機構

引用文献：

審査官引用 (4件)

Chemical Science, 20170307, Vol.8, p.3668-3675
RNA, 2016, Vol.23, p.250-256
Analytical Sciences, 2014, Vol.30, p.59-64

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