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J-GLOBAL ID：202002248320755040   整理番号：20A2640930

緑色春タマネギ(Allium fistulosum)と中国エゾネギ(A.tuberosum)の種間雑種,ネギ-ニラ エゾネギのメタボロームプロファイル

Metabolome profile of Negi-Nira chive, an interspecies hybrid of green spring onion (Allium fistulosum) and Chinese chive (A. tuberosum)

著者 (9件)： Ara Takeshi (Kazusa DNA Research Institute) ,  Suda Kunihiro (Kazusa DNA Research Institute) ,  Amagai Masayuki (Tochigi Agricultural Experimental Station) ,  Amagai Masayuki (Department of Biological Sciences, Kisarazu Campus of Tohoku University) ,  Namai Kiyoshi (Tochigi Agricultural Experimental Station) ,  Suzuki Hideyuki (Kazusa DNA Research Institute) ,  Sakurai Nozomu (Kazusa DNA Research Institute) ,  Shibata Daisuke (Kazusa DNA Research Institute) ,  Shibata Daisuke (Department of Biological Sciences, Kisarazu Campus of Tohoku University)
資料名： Plant Biotechnology  (Plant Biotechnology)
巻： 37  号： 3  ページ： 383-387(J-STAGE)  発行年： 2020年 
JST資料番号： L0316A  ISSN： 1342-4580  CODEN： PLBIF6  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 日本 (JPN)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： フレーバー野菜,緑色春タマネギ(Alliumfistulosum),中国エゾネギ(A.tuberosum),およびその種間雑種ネギ-ニラ エゾネギメタボローム分析を,約2ppm質量精度で液体クロマトグラフィー-フーリエ変換イオンサイクロトロン共鳴-質量分析を用いて行った。野菜葉の4つの生物学的複製のクロマトグラムにおけるイオンピークを,代謝産物比較のためにアラインメントソフトウェアPowerGetを用いて処理し,それから潜在的化学式を得た。全体で,860のイオンピークが再現性よく検出された。即ち,このうち,506,525および336のピークが,それぞれハイブリッド,A.tuberosumおよびA.fistulosumで見出された。ハイブリッドに特異的な130のピークがあった。これから,31の代謝産物を,化合物データベースの探索によって注釈した。硫黄含有化合物とフラボノイドをバイオインフォマティクスを用いて分析し,この種におけるネギ属揮発分の硫黄代謝とフラボノイド経路を調べた。結論として,この種間雑種とその親のメタボローム分析は,その代謝背景を解明するユニークな機会を提供する。(翻訳著者抄録)

シソーラス用語： タマネギ ,  *ネギ ,  *ニラ ,  *種間雑種 ,  ネギ属 ,  解析 ,  液体クロマトグラフィー ,  LC-MS分析 ,  FT-ICR質量分析 ,  クロマトグラム ,  代謝産物 ,  化学表記法 ,  データベース ,  硫黄化合物 ,  フラボノイド ,  情報科学 ,  生物学 ,  揮発分 ,  代謝 ,  エゾネギ ,  化学式 ,  化合物データベース ,  バイオインフォマティクス ,  硫黄代謝 ,  メタボロミクス ,  人文科学
準シソーラス用語： *Allium fistulosum ,  *Allium tuberosum ,  メタボローム解析 ,  液体クロマトグラフィー/質量分析 ,  Fourier変換イオンサイクロトロン共鳴質量分析

著者キーワード (6件)： Fourier変換イオンサイクロトロン共鳴-質量分析 ,  種間雑種 ,  メタボローム ,  Fourier変換イオンサイクロトロン共鳴-質量分析 ,  種間雑種 ,  メタボローム

分類 (5件)： 研究開発  (FA01030T) ,  野菜  (FC03043X) ,  液体クロマトグラフィー  (CC04014L) ,  質量分析  (CC03013N) ,  物質の代謝  (EH02050Q)

引用文献 (11件)：

• Amagai M, Ohashi K, Kimura S, Oguri N, Kojima A (1995) Breeding of interspecies hybrid between Allium fitsulosum and A. tuberosum by embryo culture. Bull Tochigi Agr Exp Stn 43: 87-94 (in Japanese)
• Ara T, Enomoto M, Arita M, Ikeda C, Kera K, Yamada M, Nishioka T, Ikeda T, Nihei Y, Shibata D, et al. (2015) Metabolonote: A wiki-based database for managing hierarchical metadata of metabolome analyses. Front Bioeng Biotechnol 3: 38
• Iijima Y, Nakamura Y, Ogata Y, Tanaka K, Sakurai N, Suda K, Suzuki T, Suzuki H, Okazaki K, Kitayama M, et al. (2008) Metabolite annotations based on the integration of mass spectral information. Plant J 54: 949-962
• Kobayashi A, Amagai M, Kubota K, Morisawa C (1997) Aroma composition of an interspecies hybrid cultivar named “Nakamidori” between Allium fistulosum and A. tuberosum by Embryo Culture. Nippon Nogeikagaku Kaishi 71: 1273-1279 (in Japanese)
• Kojima A, Nagato Y, Hinata K (1991) Degree of apomixis in Chinese chive (Allium tuberosum) estimated by esterase isozyme analysis. Japan J Breed 41: 73-83

タイトルに関連する用語 (9件)： 緑色 ,  春 ,  タマネギ ,  Allium ,  中国 ,  エゾネギ ,  種間雑種 ,  ネギ ,  ニラ