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J-GLOBAL ID：202002268936803702   整理番号：20A0425427

大規模選択反応モニタリング戦略を用いたトマトTrichome腺細胞における標的プロテオームの定量分析【JST・京大機械翻訳】

Quantitative assay of targeted proteome in tomato trichome glandular cells using a large-scale selected reaction monitoring strategy

著者 (10件)： Takemori Ayako (Department of Bioresource Production Science, The United Graduate School of Agricultural Sciences, Ehime University, Matsuyama, Japan) ,  Nakashima Taiken (Research Faculty of Agriculture, Hokkaido University, Sapporo, Japan) ,  Omura Hisashi (Graduate School of Biosphere Science, Hiroshima University, Higashi-Hiroshima, Japan) ,  Tanaka Yuki (Advanced Research Support Center, Ehime University, Toon, Japan) ,  Nakata Keisuke (Department of Bioresource Production Science, The United Graduate School of Agricultural Sciences, Ehime University, Matsuyama, Japan) ,  Nonami Hiroshi (Department of Bioresource Production Science, The United Graduate School of Agricultural Sciences, Ehime University, Matsuyama, Japan) ,  Nonami Hiroshi (Plant Biophysics/Biochemistry Research Laboratory, Faculty of Agriculture, Ehime University, Matsuyama, Japan) ,  Nonami Hiroshi (Division of Proteomics Research, Proteo-Science Center, Ehime University, Toon, Japan) ,  Takemori Nobuaki (Advanced Research Support Center, Ehime University, Toon, Japan) ,  Takemori Nobuaki (Division of Proteomics Research, Proteo-Science Center, Ehime University, Toon, Japan)
資料名： Plant Methods (Web)  (Plant Methods (Web))
巻： 15  号： 1  ページ： 40  発行年： 2019年 
JST資料番号： U7033A  ISSN： 1746-4811  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 維管束植物に見られる腺毛様体は,それらが腺細胞において二次代謝産物を合成し貯蔵するため,天然細胞工場と呼ばれている。腺細胞における代謝過程を系統的に理解するためには,細胞プロテオーム動力学を解析することが不可欠である。質量分析に基づく従来のプロテオミクス法は,大規模な蛋白質分析を可能にしたが,徹底的な分析のための多数のトリホーム試料を必要とし,標的蛋白質の迅速で高感度な定量に適していない。ここでは,特定の反応モニタリング(SRM)アッセイを用いて,特異的な毛様細胞における標的蛋白質を定量するためのハイスループット戦略を提示する。モデル系としてトマトのVI型毛様体細胞における蛋白質を標的とするSRMアッセイプラットホームは,限られた量の試料からの複数の蛋白質の定量におけるその有効性を示した。大規模SRM分析は,ナノフロー液体クロマトグラフにオンラインで接続された三重四重極質量分析計を使用し,120分以内に100の腺毛様体から回収された腺細胞試料中に含まれる221の標的蛋白質の発現レベルを正確に測定した。異なる器官(葉,緑色果実,およびカリックス)間のVI型毛様体細胞のSRMアッセイを用いた比較定量的プロテオミクスは,特異的な器官濃縮蛋白質を明らかにした。最小サンプリング努力により興味ある蛋白質の定量を可能にする確立したSRMアッセイを用いた標的化プロテオミクス法を示した。SRMアッセイとその簡単な実験的ワークフローの顕著な成功は,腺毛様体におけるプロテオミクス研究を増加させるであろう。Copyright 2020 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： タンパク質濃縮物 ,  四重極質量分析計 ,  有効性 ,  質量分析 ,  プロテオミクス ,  二次代謝産物 ,  液体クロマトグラフィー ,  ターゲティング ,  *トマト ,  *定量分析 ,  ワークフロー ,  毛様体 ,  ペプチド ,  *プロテオーム ,  タンパク質

著者キーワード (10件)： トマトVI型腺トリコーム ,  二次代謝 ,  植物防御機構 ,  標的プロテオミクス ,  質量分析 ,  選択された反応モニタリング ,  プロテオタイプペプチド ,  蛋白質定量化 ,  アクアペプチド ,  QConcat

分類 (5件)： 遺伝子発現  (EC02040Q) ,  植物生理学一般  (EH02010Y) ,  細胞構成体一般  (EF03010Z) ,  生化学的分析法  (EA03030G) ,  遺伝学研究法  (EC01020N)

引用文献 (60件)：

• Structure and function of secretory cells; Plant trichomes; 2000; 37-75; CR1; A Fahn; citation_publisher=Academic Press
• New Phytol; Secretory tissues in vascular plants; A Fahn; 108; 1988; 229-257; 10.1111/j.1469-8137.1988.tb04159.x; citation_id=CR2
• BMC Plant Biol; The development of type VI glandular trichomes in the cultivated tomato Solanum lycopersicum and a related wild species S. habrochaites; N Bergau, S Bennewitz, F Syrowatka, G Hause, A Tissier; 15; 2015; 289; 10.1186/s12870-015-0678-z; citation_id=CR3
• Plant Physiol; Secreting glandular trichomes: more than just hairs; GJ Wagner; 96; 3; 1991; 675-679; 10.1104/pp.96.3.675; citation_id=CR4
• Anal Biochem; Isolation of secretory cells from plant glandular trichomes and their use in biosynthetic studies of monoterpenes and other gland products; J Gershenzon, D McCaskill, JI Rajaonarivony, C Mihaliak, F Karp, R Croteau; 200; 1; 1992; 130-138; 10.1016/0003-2697(92)90288-I; citation_id=CR5

タイトルに関連する用語 (7件)： 大規模 ,  選択反応モニタリング ,  戦略 ,  トマト ,  標的 ,  プロテオーム ,  定量分析