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J-GLOBAL ID：202002289273097861   整理番号：20A2511293

パーキンソン病における標的遺伝子パネル再シークエンシングによる疾患関連変異体の同定【JST・京大機械翻訳】

Identification of Disease-Associated Variants by Targeted Gene Panel Resequencing in Parkinson’s Disease

著者 (13件)： Daida Kensuke (Department of Neurology, Juntendo University School of Medicine, Tokyo, Japan) ,  Funayama Manabu (Department of Neurology, Juntendo University School of Medicine, Tokyo, Japan) ,  Funayama Manabu (Research Institute for Diseases of Old Age, Graduate School of Medicine, Juntendo University, Tokyo, Japan) ,  Funayama Manabu (Center for Genomic and Regenerative Medicine, Graduate School of Medicine, Juntendo University, Tokyo, Japan) ,  Li Yuanzhe (Department of Neurology, Juntendo University School of Medicine, Tokyo, Japan) ,  Yoshino Hiroyo (Research Institute for Diseases of Old Age, Graduate School of Medicine, Juntendo University, Tokyo, Japan) ,  Hayashida Arisa (Department of Neurology, Juntendo University School of Medicine, Tokyo, Japan) ,  Ikeda Aya (Department of Neurology, Juntendo University School of Medicine, Tokyo, Japan) ,  Ogaki Kotaro (Department of Neurology, Juntendo University School of Medicine, Tokyo, Japan) ,  Nishioka Kenya (Department of Neurology, Juntendo University School of Medicine, Tokyo, Japan) ,  Hattori Nobutaka (Department of Neurology, Juntendo University School of Medicine, Tokyo, Japan) ,  Hattori Nobutaka (Research Institute for Diseases of Old Age, Graduate School of Medicine, Juntendo University, Tokyo, Japan) ,  Hattori Nobutaka (Center for Genomic and Regenerative Medicine, Graduate School of Medicine, Juntendo University, Tokyo, Japan)
資料名： Frontiers in Neurology (Web)  (Frontiers in Neurology (Web))
巻： 11  ページ： 576465  発行年： 2020年 
JST資料番号： U7085A  ISSN： 1664-2295  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 背景:ハイスループット配列決定のような最近の先進技術は,多様な変異体の同定を可能にした。Parkinson病(PD)関連遺伝子に対する標的化遺伝子パネル再配列決定を用いて,PD患者において疾患関連であると考えられているいくつかの単一ヌクレオチド変異体(SNV)を見出した。これらの潜在的疾患関連変異体の重要性を確認するために,次世代標的再配列決定を用いてゲノム会合分析を行い,同定されたSNVとPDの間の関連を評価した。方法:PDと診断された766人の患者からゲノムDNAを得て,日本人起源の全てで336人の健康な対照を得た。すべてのデータを,単一パネルにおいて29のPD-または痴呆関連遺伝子を有するIon AmpliSeqパネル配列を用いて分析した。著者らは,対照群においてHardy-Weinberg平衡に適合しなかった変異体を除外した。PDと対照群における変動頻度は,PLINKを使用して比較した。フィッシャーの正確検定を用いてBenjamini-Hochberg手順を適用した後,同定された変異体をP<0.05の周波数差で確認した。各変異体の病原性と罹患率を,公共遺伝子データベースに基づいて推定した。【結果】著者らは,PDと有意に関連した3つのまれな変異体を同定した:それは,イントロン変異体であるDJ-1において,SYNJ1およびrs372754391において,そして,エキソン変異体であるApoEにおいてrs7412であるrs372754391であった。SYNJ1とApoEの変異体は対照群で頻繁に同定され,SYNJ1のrs20112663/rs150500694はPDに対して保護的役割を果たす可能性がある。DJ-1変異体はPD群で高頻度に同定され,高いオッズ比は2.2であった:検出された変異体はPDにおいて遺伝的修飾因子または疾患関連変異体を示す可能性がある。標的化遺伝子-パネル再配列決定は,PDにおける疾患原因変異および遺伝的関連研究を検出する有用な方法である。Copyright 2020 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *遺伝 ,  *遺伝子 ,  ゲノム ,  病原性 ,  イントロン ,  ターゲティング ,  *Parkinson病 ,  認知症
準シソーラス用語： *配列解析 ,  遺伝子データベース ,  DJ-1蛋白質 ,  ゲノムDNA ,  ハイスループット ,  日本人 ,  *標的遺伝子 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： 次世代シークエンシング ,  パネル再順序付け ,  遺伝的関連研究 ,  Parkinson病 ,  遺伝性の欠損

分類 (2件)： 分子遺伝学一般  (EC02010J) ,  神経の基礎医学  (GN01020W)

引用文献 (44件)：

• GibbWRLeesAJ. The relevance of the Lewy body to the pathogenesis of idiopathic Parkinson's disease. J Neurol Neurosurg Psychiatry. (1988) 51:745-52. doi: 10.1136/jnnp.51.6.7452841426
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• ZimprichABiskupSLeitnerPLichtnerPFarrerMLincolnS. Mutations in LRRK2 cause autosomal-dominant parkinsonism with pleomorphic pathology. Neuron. (2004) 44:601-7. doi: 10.1016/j.neuron.2004.11.00515541309

タイトルに関連する用語 (6件)： パーキンソン病 ,  標的遺伝子 ,  シークエンシング ,  疾患 ,  変異体 ,  同定