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J-GLOBAL ID：202102217198107095   整理番号：21A0461400

東北医学メガバンクプロジェクトの前向きゲノムコホート研究における口腔マイクロバイオーム解析【JST・京大機械翻訳】

Oral Microbiome Analysis in Prospective Genome Cohort Studies of the Tohoku Medical Megabank Project

著者 (40件)： Saito Sakae (Tohoku Medical Megabank Organization, Tohoku University, Sendai, Japan) ,  Aoki Yuichi (Tohoku Medical Megabank Organization, Tohoku University, Sendai, Japan) ,  Aoki Yuichi (Graduate School of Information Sciences, Tohoku University, Sendai, Japan) ,  Tamahara Toru (Tohoku Medical Megabank Organization, Tohoku University, Sendai, Japan) ,  Tamahara Toru (Graduate School of Dentistry, Tohoku University, Sendai, Japan) ,  Goto Maki (Tohoku Medical Megabank Organization, Tohoku University, Sendai, Japan) ,  Matsui Hiroyuki (Tohoku Medical Megabank Organization, Tohoku University, Sendai, Japan) ,  Matsui Hiroyuki (Graduate School of Dentistry, Tohoku University, Sendai, Japan) ,  Kawashima Junko (Tohoku Medical Megabank Organization, Tohoku University, Sendai, Japan) ,  Danjoh Inaho (Tohoku Medical Megabank Organization, Tohoku University, Sendai, Japan) ,  Danjoh Inaho (Graduate School of Medicine, Tohoku University, Sendai, Japan) ,  Hozawa Atsushi (Tohoku Medical Megabank Organization, Tohoku University, Sendai, Japan) ,  Hozawa Atsushi (Graduate School of Medicine, Tohoku University, Sendai, Japan) ,  Kuriyama Shinichi (Tohoku Medical Megabank Organization, Tohoku University, Sendai, Japan) ,  Kuriyama Shinichi (Graduate School of Medicine, Tohoku University, Sendai, Japan) ,  Kuriyama Shinichi (International Research Institute of Disaster Science, Tohoku University, Sendai, Japan) ,  Suzuki Yoichi (Tohoku Medical Megabank Organization, Tohoku University, Sendai, Japan) ,  Suzuki Yoichi (Department of Clinical Genetics, Ageo Central General Hospital, Ageo, Japan) ,  Fuse Nobuo (Tohoku Medical Megabank Organization, Tohoku University, Sendai, Japan) ,  Fuse Nobuo (Graduate School of Medicine, Tohoku University, Sendai, Japan) ,  Kure Shigeo (Tohoku Medical Megabank Organization, Tohoku University, Sendai, Japan) ,  Kure Shigeo (Graduate School of Medicine, Tohoku University, Sendai, Japan) ,  Yamashita Riu (Tohoku Medical Megabank Organization, Tohoku University, Sendai, Japan) ,  Yamashita Riu (Exploratory Oncology Research & Clinical Trial Center, National Cancer Center, Kashiwa, Japan) ,  Tanabe Osamu (Tohoku Medical Megabank Organization, Tohoku University, Sendai, Japan) ,  Tanabe Osamu (Biosample Research Center, Radiation Effects Research Foundation, Hiroshima, Japan) ,  Minegishi Naoko (Tohoku Medical Megabank Organization, Tohoku University, Sendai, Japan) ,  Minegishi Naoko (Graduate School of Medicine, Tohoku University, Sendai, Japan) ,  Minegishi Naoko (Advanced Research Center for Innovations in Next-Generation Medicine, Tohoku University, Sendai, Japan) ,  Kinoshita Kengo (Tohoku Medical Megabank Organization, Tohoku University, Sendai, Japan) ,  Kinoshita Kengo (Graduate School of Information Sciences, Tohoku University, Sendai, Japan) ,  Kinoshita Kengo (Advanced Research Center for Innovations in Next-Generation Medicine, Tohoku University, Sendai, Japan) ,  Tsuboi Akito (Tohoku Medical Megabank Organization, Tohoku University, Sendai, Japan) ,  Tsuboi Akito (Graduate School of Dentistry, Tohoku University, Sendai, Japan) ,  Tsuboi Akito (Graduate School of Medicine, Tohoku University, Sendai, Japan) ,  Shimizu Ritsuko (Tohoku Medical Megabank Organization, Tohoku University, Sendai, Japan) ,  Shimizu Ritsuko (Graduate School of Medicine, Tohoku University, Sendai, Japan) ,  Yamamoto Masayuki (Tohoku Medical Megabank Organization, Tohoku University, Sendai, Japan) ,  Yamamoto Masayuki (Graduate School of Medicine, Tohoku University, Sendai, Japan) ,  Yamamoto Masayuki (Advanced Research Center for Innovations in Next-Generation Medicine, Tohoku University, Sendai, Japan)
資料名： Frontiers in Cellular and Infection Microbiology (Web)  (Frontiers in Cellular and Infection Microbiology (Web))
巻： 10  ページ： 604596  発行年： 2020年 
JST資料番号： U7063A  ISSN： 2235-2988  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 東北医学メガバンク機構(TMM)のベースライン経口ミクロビオーム研究を,日本人集団における口腔ミクロビオームのプロファイルを特性化するために計画した。本研究はまた,口腔ミクロビオームと宿主ゲノム/オミクス情報の統合解析により多因子疾患の危険因子を明らかにすることを目的とした。方法:2013年から2016年まで,TMMで歯科検査を受けた合計25,101人の参加者から,3種類の経口バイオ試料,唾液,歯肉上プラークおよび舌スワブを採取した。本研究では,2つの独立したコホートを使用した;発見と検証コホートとしてコミュニティベースコホートとBirthと3Generation Cohortを,それぞれ,単一歯科医によって検査された参加者を選択した。コミュニティベースコホート研究の834名の参加者の16SリボソームRNA遺伝子配列分析により,唾液とプラーク間の微生物組成と群集構造の違いがあることを見出した。唾液とプラークにおける種の多様性は歯周病の重症度との相関で増加した。これらの結果を,Birthと3Genation Cohort Studyの455人の参加者の分析で良好に再現した。さらに,歯周炎関連生物膜形成を伴うプラークと唾液の両方における微生物分類群の強い正と負の関連を共起ネットワーク分析によって検出した。口腔健康関連細菌種を含むActinobacteriaとBacilliは唾液中で正の相関を示した。これらの結果は,唾液とプラークの間の微生物組成と群集構造の違い,および微生物種と歯周病の重症度の間の相関を明らかにした。TMMバイオバンクにおける口腔ミクロビオームの大きなデータベースは,口腔疾患の治療および予防のための新規標的の発見,ならびに全身疾患の治療および/または予防標的の発見を助けることが期待される。Copyright 2021 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： データベース ,  微生物 ,  細菌 ,  *口腔 ,  *ゲノム ,  歯科学 ,  プラーク ,  歯肉 ,  *母集団 ,  歯周炎 ,  歯科医 ,  危険因子 ,  *コホート研究 ,  オミックス
準シソーラス用語： バイオバンク , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (7件)： 16SリボソームRNA ,  唾液 ,  歯垢 ,  マイクロバイオーム ,  歯周疾患 ,  前向きコホート ,  口腔衛生

分類 (5件)： 疫学  (GB03000E) ,  研究開発  (GA01030U) ,  集団遺伝学  (EC01040J) ,  公衆衛生  (GB02000X) ,  遺伝学研究法  (EC01020N)

引用文献 (44件)：

• AbuslemeL.DupuyA. K.DutzanN.SilvaN.BurlesonJ. A.StrausbaughL. D.. (2013). The subgingival microbiome in health and periodontitis and its relationship with community biomass and inflammation. ISME J. 7 (5), 1016-1025. doi: doi: 10.1038/ismej.2012.174
• BokulichN. A.KaehlerB. D.RideoutJ. R.DillonM.BolyenE.KnightR.. (2018). Optimizing taxonomic classification of marker-gene amplicon sequences with QIIME 2’s q2-feature-classifier plugin. Microbiome 6 (1), 90. doi: doi: 10.1186/s40168-018-0470-z
• BolyenE.RideoutJ. R.DillonM. R.BokulichN. A.AbnetC. C.Al-GhalithG. A.. (2019). Reproducible, interactive, scalable and extensible microbiome data science using QIIME 2. Nat. Biotechnol. 37 (8), 852-857. doi: doi: 10.1038/s41587-019-0209-9
• BryanN. S.TribbleG.AngelovN. (2017). Oral microbiome and nitric oxide: the missing link in the management of blood pressure. Curr. Hypertens. Rep. 19 (4), 33. doi: doi: 10.1007/s11906-017-0725-2
• CallahanB. J.McMurdieP. J.RosenM. J.HanA. W.JohnsonA. J.HolmesS. P. (2016). DADA2: High-resolution sample inference from Illumina amplicon data. Nat. Methods 13 (7), 581-583. doi: doi: 10.1038/nmeth.3869

タイトルに関連する用語 (5件)： 医学 ,  ゲノムコホート研究 ,  口腔 ,  マイクロバイオーム ,  解析