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J-GLOBAL ID：202102253729960402   整理番号：21A0384700

Pan-Genome分析により明らかにした新規特異的標的に基づくFlammulina velutipes植物における病原性Listeriaの同定に対する多重PCR【JST・京大機械翻訳】

Multiplex PCR for the Identification of Pathogenic Listeria in Flammulina velutipes Plant Based on Novel Specific Targets Revealed by Pan-Genome Analysis

著者 (14件)： Li Fan (Guangdong Provincial Key Laboratory of Microbial Safety and Health, State Key Laboratory of Applied Microbiology Southern China, Guangdong Institute of Microbiology, Guangdong Academy of Sciences, Guangzhou, China) ,  Li Fan (School of Biology and Biological Engineering, South China University of Technology, Guangzhou, China) ,  Ye Qinghua (Guangdong Provincial Key Laboratory of Microbial Safety and Health, State Key Laboratory of Applied Microbiology Southern China, Guangdong Institute of Microbiology, Guangdong Academy of Sciences, Guangzhou, China) ,  Chen Moutong (Guangdong Provincial Key Laboratory of Microbial Safety and Health, State Key Laboratory of Applied Microbiology Southern China, Guangdong Institute of Microbiology, Guangdong Academy of Sciences, Guangzhou, China) ,  Zhang Jumei (Guangdong Provincial Key Laboratory of Microbial Safety and Health, State Key Laboratory of Applied Microbiology Southern China, Guangdong Institute of Microbiology, Guangdong Academy of Sciences, Guangzhou, China) ,  Xue Liang (Guangdong Provincial Key Laboratory of Microbial Safety and Health, State Key Laboratory of Applied Microbiology Southern China, Guangdong Institute of Microbiology, Guangdong Academy of Sciences, Guangzhou, China) ,  Wang Juan (College of Food Science, South China Agricultural University, Guangzhou, China) ,  Wu Shi (Guangdong Provincial Key Laboratory of Microbial Safety and Health, State Key Laboratory of Applied Microbiology Southern China, Guangdong Institute of Microbiology, Guangdong Academy of Sciences, Guangzhou, China) ,  Zeng Haiyan (Guangdong Provincial Key Laboratory of Microbial Safety and Health, State Key Laboratory of Applied Microbiology Southern China, Guangdong Institute of Microbiology, Guangdong Academy of Sciences, Guangzhou, China) ,  Gu Qihui (Guangdong Provincial Key Laboratory of Microbial Safety and Health, State Key Laboratory of Applied Microbiology Southern China, Guangdong Institute of Microbiology, Guangdong Academy of Sciences, Guangzhou, China) ,  Zhang Youxiong (Guangdong Provincial Key Laboratory of Microbial Safety and Health, State Key Laboratory of Applied Microbiology Southern China, Guangdong Institute of Microbiology, Guangdong Academy of Sciences, Guangzhou, China) ,  Wei Xianhu (Guangdong Provincial Key Laboratory of Microbial Safety and Health, State Key Laboratory of Applied Microbiology Southern China, Guangdong Institute of Microbiology, Guangdong Academy of Sciences, Guangzhou, China) ,  Ding Yu (Department of Food Science and Technology, Jinan University, Guangzhou, China) ,  Wu Qingping (Guangdong Provincial Key Laboratory of Microbial Safety and Health, State Key Laboratory of Applied Microbiology Southern China, Guangdong Institute of Microbiology, Guangdong Academy of Sciences, Guangzhou, China)
資料名： Frontiers in Microbiology (Web)  (Frontiers in Microbiology (Web))
巻： 11  ページ： 634255  発行年： 2020年 
JST資料番号： U7080A  ISSN： 1664-302X  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： Listeria spp.は重要な食品媒介病薬であり,しばしば新鮮なキノコ(Flamulina velutipes)とその生産環境に見られる。本研究の目的は,F.velutipes植物におけるListeria monocytogenesおよびListeria ivanoviiの迅速同定のためのマルチプレックスPCRおよび非病原性Listeriaを開発することであった。Pan-ゲノム分析を最初に用いて,5つの新規Listeria特異的標的を同定した:Listeria属に対する1つ,L.monocytogenesのための1つ,およびL.ivanoviiのための3つ。新規標的のプライマーは,個々の反応で高度に特異的であった。検出限界は103~104CFU/mLであり,分子検出の要求を満たした。病原性Listeriaの同定のためのmPCRアッセイを,Listeria属(LMOSLCC2755_0944),リステリア菌(LMOSLCC2755_0090),およびL.ivanovii(queT_1)に特異的な新規遺伝子をターゲットとするプライマーを用いて設計した。アッセイ特異性は,非病原性Listeriaと非Listeria spp.菌株を分析することによりロバストに検証された。測定した検出限界は,L.monocytogenesで2.0×103CFU/mL,L.ivanoviiで3.4×103CFU/mLであった。さらに,このアッセイは4~12時間の濃縮後にF.velutipes試料にスパイクした病原性Listeriaの7.6×104から7.6×100CFU/10gを検出した。異なるF.velutipes植物から採取した129試料を分析することによって,アッセイの実現可能性を従来の培養ベース法と比較して評価した。Listeria spp.とL.monocytogenesの有病率はそれぞれ58.1%と41.1%であった。Listeria spp.,L.monocytogenesおよびL.ivanoviiに対するκ因子は,それぞれ0.97,0.97および1であった。新規mPCRアッセイの結果は,培養に基づく方法と非常に一致した。したがって,新しいアッセイは食品とその生産環境における病原性Listeriaの迅速,特異的,正確な検出とモニタリングを可能にするであろう。Copyright 2021 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 食品 ,  遺伝子 ,  ゲノム ,  *多重化 ,  *病原性 ,  *Listeria ,  リステリア菌 ,  検出限界 ,  ロバスト性 ,  きのこ
準シソーラス用語： マルチプレックスPCR ,  Listeria ivanovii ,  特異性 ,  分子検出 ,  非病原性 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： 新規標的遺伝子 ,  リステリア ,  汎ゲノム解析 ,  多重PCR ,  キノコ

分類 (2件)： 微生物検査法  (EG02020G) ,  食品の汚染  (FJ01053P)

引用文献 (41件)：

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• ChiangY. C.TsenH. Y.ChenH. Y.ChangY. H.LinC. K.ChenC. Y.. (2012). Multiplex PCR and a chromogenic DNA macroarray for the detection of Listeria monocytogens, Staphylococcus aureus, Streptococcus agalactiae, Enterobacter sakazakii, Escherichia coli O157:H7, Vibrio parahaemolyticus, Salmonella spp. and Pseudomonas fluorescens in milk and meat samples. J. Microbiol. Methods 88 110-116. doi: 10.1016/j.mimet.2011.10.021 22101309
• CornuM.KalmokoffM.FlandroisJ.-P. (2002). Modelling the competitive growth of Listeria monocytogenes and Listeria innocua in enrichment broths. Int. J. Food Microbiol. 73 261-274. doi: 10.1016/S0168-1605(01)00658-4

タイトルに関連する用語 (10件)： PAN ,  分析 ,  標的 ,  Flammulina ,  植物 ,  病原性 ,  Listeria ,  同定 ,  多重 ,  PCR