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J-GLOBAL ID:200901009660126592
Update date: Nov. 22, 2024
Tanaka Shigenori
タナカ シゲノリ | Tanaka Shigenori
Affiliation and department:
Job title:
Professor
Research field (1):
Biogeoscience
Research theme for competitive and other funds (13):
- 2021 - 2024 Computational study on thermal relaxation processes in biomolecular systems
- 2017 - 2022 水を通して見る生体分子夾雑系の情報熱力学
- 2018 - 2021 生命の起源物質生成の計算機シミュレーション:アミノ酸・核酸とその重合化
- 2016 - 2019 Development of analysis method of transition state for improvement of enzymatic function
- 2015 - 2018 Development of super-resolution structure analysis techniques for bio-macromolecules based on a quantum chemical calculation
- 2014 - 2017 創薬への応用に向けたrasがん遺伝子産物の構造ダイナミクスの分子機構の解明
- 2014 - 2017 計算創薬のための蛋白質複合系の精密構造・相互作用解析手法の開発
- 2011 - 量子モンテカルロ-フラグメント分子軌道法による水の第一原理シミュレーション
- 2010 - 厚生科研「新型インフルエンザH1N1のウイルスの病原性等の解析に関する研究」
- 2007 - 戦略的:フラグメント分子軌道法による生体分子計算システムの開発
- 2006 - フラグメント分子軌道法による生体分子計算システムの開発
- 2003 - 2005 Analysis of charge transfer and I-V property for the DNA chip by quantum chemical calculations
- 2005 - フラグメント分子軌道法による生体系の応用計算
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Papers (292):
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Akihiro Nishiyama, Shigenori Tanaka, Jack Tuszynski. Non-Equilibrium Quantum Brain Dynamics: Water Coupled with Phonons and Photons. Entropy. 2024
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Yuki Fujii, Hikaru Ioka, Chihiro Minamoto, Ikuo Kurisaki, Shigenori Tanaka, Kaoru Ohta, Keisuke Tominaga. Vibrational frequency fluctuations of poly(N,N-diethylacrylamide) in the vicinity of coil-to-globule transition studied by two-dimensional infrared spectroscopy and molecular dynamics simulations. The Journal of Chemical Physics. 2024
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Yoshiharu Mori, Shigenori Tanaka. Stabilization Mechanism of Initiator Transfer RNA in the Small Ribosomal Subunit from Coarse-Grained Molecular Simulations. 2024
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Shuya Nakata, Yoshiharu Mori, Shigenori Tanaka. Navigating Ultra-Large Virtual Chemical Spaces with Product-of-Experts Chemical Language Models. 2024
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Akihiro Nishiyama, Shigenori Tanaka, Jack Tuszynski. Quantum Brain Dynamics: Optical and Acoustic Super-Radiance via a Microtubule. Foundations. 2024
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MISC (105):
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MIYAGISHI Toma, KAMIMURA Kenta, HANDA Yuma, HANDA Yuma, TAKIMOTO-KAMIMURA Midori, TAKIMOTO-KAMIMURA Midori, ENDO Mayumi, OKUWAKI Koji, MORI Yoshiharu, TANAKA Shigenori, et al. Interaction analysis of IL-10 receptor complex using MD and FMO calculations. CBI学会大会(CD-ROM). 2023. 2023
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鬼頭宏任, 梅垣俊仁, 西山陽大, 田中成典. Benchmarking of Quasi-Classical Mapping Approach to Quantum Dissipative System. 日本物理学会講演概要集(CD-ROM). 2023. 78. 1
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大山達也, 高橋俊太郎, 建石寿枝, 田中成典, 杉本直己, 杉本直己. Nucleic Acids Chemistry beyond the Watson-Crick Double Helix (77): The effect of high-pressure on non-canonical structures of DNA. 日本化学会春季年会講演予稿集(Web). 2022. 102nd
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建石寿枝, 松本咲, 大山達也, YE Teng, 田中成典, 杉本直己, 杉本直己. Method for regulation of the interaction between C9orf72-derived repeat RNA and peptides based on quantitative analysis of nucleic acid structure. 日本核酸医薬学会年会講演要旨集(CD-ROM). 2022. 7th
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鬼頭宏任, 梅垣俊仁, 西山陽大, 田中成典. Application of the symmetrical quasi-classical method to electronically non-adiabatic processes. 日本物理学会講演概要集(CD-ROM). 2022. 77. 1
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Books (32):
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量子と生命
現代思想(青土社) 2020
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生体分子夾雑系の理論計算化学:分子論から生命論へ
東京化学同人 2019
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Taking Water into Account with the Fragment Molecular Orbital Method
Humana Press 2019
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計算分子生物学 : 物質科学からのアプローチ
内田老鶴圃 2018 ISBN:9784753623136
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大学への数学
東京出版 2018
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Lectures and oral presentations (227):
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Quantum Brain Dynamics from a Viewpoint of Field Theory
(The 2nd Workshop on Quantum Cognition 2019)
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Perspectives of Computational Drug Discovery: AMED-BINDS Activities in Japan
(AHeDD2019/IPAB2019 Joint Symposium 2019)
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大規模分子系の第一原理計算と量子生命科学
(遠隔講義「計算生命科学の基礎VI」 2019)
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多体問題と生命
(研究会「計算生命科学:多体問題から生命システムへ」 2019)
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生命と量子
(JST-CREST「生命動態の理解と制御のための基盤技術の創出」研究領域・第12回数理デザイン道場 2019)
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Education (1):
- - 1986 東京大学 大学院理学系研究科博士課程物理学専攻修了
Professional career (1):
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