Rchr
J-GLOBAL ID:200901018729077270
Update date: Nov. 13, 2024
Sumi Tomonari
スミ トモナリ | Sumi Tomonari
Affiliation and department:
Job title:
Professor
Homepage URL (2):
https://rdsoran.muroran-it.ac.jp/html/200000540_ja.html
,
https://rdsoran.muroran-it.ac.jp/html/200000540_en.html
Research field (4):
Biological, health, and medical informatics
, Biophysics
, Bio-, chemical, and soft-matter physics
, Basic physical chemistry
Research keywords (24):
Muscarinic acetylcholine receptor
, Alzheimer's disease
, Mathematical model
, Persistent viral infection
, Long COVID
, Immune response
, SARS-CoV-2
, Autotroph
, Last Universal Common Ancestor (LUCA)
, Metabolic evolution
, Carbon metabolism
, Hippocampus
, Synapse plasticity
, Protein folding
, Protein
, Solvent effect
, Molecular Motor
, Stochastic Modeling
, Density-functional Theory
, Soft Matter Physics
, Biophysics
, Chemical Physics
, Liquid State Theory
, Statistical mechanics
Research theme for competitive and other funds (14):
- 2022 - 2026 Study on the origin of sustained drug releasability of polymeric nanomicelles based on clarifying the interaction potential surface
- 2022 - 2026 Study on the origin of sustained drug releasability of polymeric nanomicelles based on clarifying the interaction potential surface
- 2024 - 線虫C. elegansの育成環境記憶に依存した味覚嗜好性に関するニューラルネットワークシミュレーション解析
- 2023 - 2024 新型コロナ後遺症の原因となる宿主内持続感染の予防法並びに治療法の細胞免疫学的研究
- 2020 - 2023 Verification of the hydrophobic interaction hypothesis in protein structural stability and theoretical/experimental study on cosolvent effects
- 2018 - 2023 Understanding solvent-mediated forces with diverse responses to ions, co-solvents, and temperature
- 2016 - 2020 Experimental/theoretical studies on the structural stability and intermolecular interactions of proteins
- 2015 - 2017 粒子間相互作用のモデルポテンシャルフリー解析
- 2013 - 2016 Chemomechanical network modeling for molecular motor dynamics of kinesin
- 2009 - 2010 ソフトマターを対象とした液体論的マルチスケール解析手法の開発とその応用
- 2007 - 2008 大きな揺らぎの存在する媒体中での高分子挙動に関する理論的解析手法の開発とその応用
- 2006 - 2008 Statistical Physics of ionic liquids
- 2005 - 2007 Research and development on computafional chemistry technologies by using "multiple molecular objective"approach adapted for large scale distdbuted processing
- 2003 - 2004 Theoretical Study on New Optical Functional Material by Unified Simulation Techniques
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Papers (67):
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Masakatsu Hironaka, Tomonari Sumi. A neural network model that generates salt concentration memory-dependent chemotaxis in Caenorhabditis elegans. 2024
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Tomonari Sumi, Kouji Harada. Vaccine and antiviral drug promise for preventing post-acute sequelae of COVID-19, and their combination for its treatment. Frontiers in Immunology. 2024. 15
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Takeshi Morita, Yusuke Torii, Hiroshi Imamura, Teruki Kadota, Fumie Sakuma, Kenjirou Higashi, Tomonari Sumi. Pair Potential between Poloxamer 407 Micelles in 14 wt % Aqueous Solution Clarifying the Sol-Gel-Sol Transition by Temperature Rise. The Journal of Physical Chemistry Letters. 2024. 7909-7915
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Hidefumi Naito, Tomonari Sumi, Kenichiro Koga. How do water-mediated interactions and osmotic second virial coefficients vary with particle size?. Faraday Discussions. 2024. 249. 440-452
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Aoi Taira, Ryuichi Okamoto, Tomonari Sumi, Kenichiro Koga. Solvation free energies of alcohols in water: temperature and pressure dependences. Physical Chemistry Chemical Physics. 2023. 25. 45. 31107-31117
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MISC (12):
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墨智成, 今村比呂志. タンパク質は疎水効果で安定化しているのか. 月刊「アグリバイオ 」4月号 (月刊「細胞」 Vol. 55, 162-165からの転載). 2023. 7. 4. 372-377
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墨智成, 今村比呂志. タンパク質は疎水効果で安定化しているのか?. 月刊「細胞」3月号. 2023. 55. 2. 162-165
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墨智成. 新型コロナ後遺症と宿主内持続感染 新型コロナ後遺症に関する仮説. 「BAN」3月号. 2023. 286. 56-63
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墨 智成. タンパク質構造安定性機序の新たな理解〜水は疎水基を嫌っていなかった〜. 化学と工業. 2022. 75. 11. 803-803
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Takeshi Morita, Nobuo Uehara, Hiroshi Imamura, Tomonari Sumi. Model-potential-free determination of the interaction potential between biological sensing nanoparticles. Photon Factory Highlights. 2016. 38-39
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Books (1):
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タンパク質の構造解析手法とIn silicoスクリーニングへの応用事例
技術情報協会 2023 ISBN:9784861049712
Lectures and oral presentations (4):
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水中の個別イオンの部分モル体積に基づく電荷スケールイオンモデルの開発
(日本物理学会 第79回年次大会 2024)
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疎水性相互作用の溶質サイズ依存性を定める熱力学的及び微視的要因
(日本物理学会 第79回年次大会 2024)
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二つのイオン特異的効果の関係性:塩析と塩誘起有効相互作用
(日本物理学会 第79回年次大会 2024)
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線虫の塩濃度記憶に依存した塩走性の神経回路メカニズム
(日本物理学会 第79回年次大会 2024)
Education (2):
- 1994 - 1999 Kyushu University Graduate School of Engineering epartment of Applied physics
- 1990 - 1994 Yamaguchi University Faculty of Science
Professional career (1):
- Doctor of Engineering (Kyushu University)
Work history (8):
- 2024/11 - 現在 Muroran Institute of Technology Graduate School of Engineering College of Information and Systems Professor
- 2024/10 - 2024/11 Muroran Institute of Technology Professor
- 2016/04 - 2024/09 Okayama University Research Institute for Interdisciplinary Science Associate professor
- 2013/04 - 2016/03 Okayama University Graduate School of Natural Science and Technology Associate professor
- 2007/04 - 2013/03 Toyohashi University of Technology Assistant professor
- 2002/04 - 2007/03 Toyohashi University of Technology Research Associate
- 1999/04 - 2002/03 JSPS post doctoral fellow
- 1999/04 - 2002/03 Institute for Molecular Science JSPS Postdoctoral Fellow
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Committee career (12):
- 2021/11 - 2021/12 分子シミュレーション学会 第35回分子シミュレーション討論会実行委員
- 2018/09 - 2018/09 日本生物物理学会 第56回日本生物物理学会実行委員
- 2017/09 - 2017/09 第29回液体の化学夏の学校講師
- 2015/11 - 2015/11 日本化学会 中国四国支部大会実行委員
- 2014/09 - 2014/09 第26回液体の化学夏の学校の世話人(岡山閑谷学校開催)
- 2012/08 - 2012/08 第50回分子科学若手の会・夏の学校の講師(第五分科会)
- 2012/02 - 2012/02 日本化学会 第42回国際化学オリンピック準備問題翻訳担当
- 2006/10 - 2011/03 量子化学データーベースQCLDB収集
- 2011/02 - 2011/02 日本化学会 第41回国際化学オリンピック準備問題翻訳担当
- 2010/02 - 2010/02 日本化学会 第40回国際化学オリンピック準備問題翻訳担当
- 2008/05 - 2009/04 日本物理学会 日本物理学会領域12運営委員委員
- 2008/05 - 2009/04 日本物理学会 領域12化学物理分野運営委員
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Awards (5):
- 2024/10 - 両備檉(てい)園記念財団 両備檉(てい)園記念財団 生物学研究奨励賞
- 2024/10 - 両備檉(てい)園記念財団 生物学研究奨励賞
- 2023/07 - Okayama Foundation for Science and Technology
- 2022/03 - 墨 智成 岡山大学理学部教育貢献賞
- 2022/03 - 岡山大学理学部 岡山大学理学部教育貢献賞
Association Membership(s) (5):
THE MOLECULAR SIMULATION SOCIETY OF JAPAN
, THE BIOPHYSICAL SOCIETY OF JAPAN
, JAPAN SOCIETY FOR MOLECULAR SCIENCE
, 日本物理学会
, 日本化学会
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