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J-GLOBAL ID:200901069748595773   Update date: Mar. 20, 2025

Matubayasi Nobuyuki

マツバヤシ ノブユキ | Matubayasi Nobuyuki
Affiliation and department:
Job title: Associate Professor
Research field  (1): Basic physical chemistry
Research keywords  (2): 理論化学 ,  Physical Chemistry
Research theme for competitive and other funds  (26):
  • 2022 - 2024 Protein Solubility and Aggregation in Solution
  • 2019 - 2022 Exploring a Guideline for Inhibiting the Peptide Aggregation through All-Atom Analysis of Cosolvent Effect
  • 2015 - 2019 Spatial-Decomposition Analysis of Transport Coefficients
  • 2014 - 2018 All-Atom Analysis of Cosolvent Effect on Protein Structure through Free-Energy Calculation
  • 2016 - 2017 Driving myosin by polymorphism and hydration-state control of actin filaments
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Papers (279):
  • Kyohei Kawashima, Takumi Sato, Kei-ichi Okazaki, Kang Kim, Nobuyuki Matubayasi, Toshifumi Mori. Investigating the hyperparameter space of deep neural network models for reaction coordinates. APL Machine Learning. 2025. 3. 1
  • Shunsuke Ogita, Yoshiki Ishii, Go Watanabe, Hitoshi Washizu, Kang Kim, Nobuyuki Matubayasi. Atomistic analysis of nematic phase transition in 4-cyano-4′-n-alkyl biphenyl liquid crystals: Sampling for the first-order phase transition and the free-energy decomposition. The Journal of Chemical Physics. 2025. 162. 5
  • Stefan Hervø-Hansen, Kazuya Okita, Kento Kasahara, Nobuyuki Matubayasi. Solvent-Environment Dependence of the Excess Chemical Potential and Its Computation Scheme Formulated through Error Minimization. Journal of Chemical Theory and Computation. 2025. 21. 3. 1064-1077
  • Kazuya Okita, Yusei Maruyama, Kento Kasahara, Nobuyuki Matubayasi. Flexible framework of computing binding free energy using the energy representation theory of solution. The Journal of Chemical Physics. 2025. 162. 3
  • Yuya Matsubara, Ryo Okabe, Ren Masayama, Nozomi Morishita Watanabe, Hiroshi Umakoshi, Kento Kasahara, Nobuyuki Matubayasi. A methodology of quantifying membrane permeability based on returning probability theory and molecular dynamics simulation. The Journal of Chemical Physics. 2024. 161. 2
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MISC (61):
  • 荻田隼輔, 石井良樹, 鷲津仁志, 金鋼, 松林伸幸. ネマチック-等方相転移の拡張アンサンブルによる高効率サンプリングと自由エネルギー解析. 分子シミュレーション討論会講演要旨集. 2023. 37th
  • 大門翔太, 水野英如, KIM K., 松林伸幸. Fragility of glass-forming liquid and scaling by boson peak. 日本物理学会講演概要集(CD-ROM). 2021. 76. 1
  • 大門翔太, 水野英如, KIM K., 松林伸幸. Vibrational density of states of glass-forming liquid and its dependence on fragility. 日本物理学会講演概要集(CD-ROM). 2020. 75. 1
  • 後藤頌太, 水野英如, 金鋼, 松林伸幸. 環状高分子メルトの振動状態およびダイナミクスの粗視化分子動力学シミュレーションによる解析. 分子シミュレーション討論会講演要旨集. 2020. 34th (CD-ROM)
  • 大門翔太, 水野英如, KIM K., 松林伸幸. A study of fragility and scaling relationships of glass-forming liquid. 日本物理学会講演概要集(CD-ROM). 2020. 75. 2
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Professional career (1):
  • Ph. D. (Rutgers University)
Work history (2):
  • 2014/04 - 現在 Osaka University Graduate School of Engineering Science
  • 2007/04 - 2014/03 Kyoto University Institute for Chemical Research
Committee career (41):
  • 2025/01 - 現在 分子シミュレーション学会 会長 および 国際連携担当幹事
  • 2023/04 - 現在 日本化学会 理論化学・情報化学・計算化学ディビジョン 主査
  • 2021/06 - 現在 科学技術振興機構 領域アドバイザー
  • 2020/10 - 現在 計算物質科学協議会 運営委員
  • 2020/06 - 現在 日本水・蒸気性質協会 副会長
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Awards (9):
  • 2019/03 - 日本化学会 学術賞
  • 2015/07 - 大阪大学 総長顕彰
  • 2014/11 - 高度情報科学技術研究機構 HPCIシステム利用研究課題優秀成果賞
  • 2008/11 - 分子シミュレーション研究会 学術賞 および 能勢賞
  • 2007/11 - 溶液化学研究会 学術賞
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Association Membership(s) (8):
分子シミュレーション学会 ,  溶液化学研究会 ,  日本高圧力学会 ,  日本化学会 ,  分子科学会 ,  化学工学会 ,  日本生物物理学会 ,  理論化学会
※ Researcher’s information displayed in J-GLOBAL is based on the information registered in researchmap. For details, see here.

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