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J-GLOBAL ID：200901072845730830 Update date: Feb. 02, 2025

Katahira Masato

カタヒラマサト | Katahira Masato

Affiliation and department：
Homepage URL (1)： http://www.iae.kyoto-u.ac.jp/bio/jp/Top.html

Research field (3)： Biophysics , Pharmaceuticals - analytical and physicochemistry , Applied biofunctional and bioprocess engineering

Research keywords (9)： drug , disease , biomass , protein , nucleic acids , 物理系薬学 , 構造生物学 , Physical Pharmaceutics , Structural Biology

Research theme for competitive and other funds (59)：

2023 - 2027 Structural chemistry of intracellular recognition by nucleic acid aptamers and brain barrier permeation strategies for the treatment of neurodegenerative disease
2024 - 2026 ヒト生細胞中における核酸の立体構造とダイナミクスの細胞周期依存性
2023 - 2026 核酸の塩基対の開閉挙動及びリガンドとの相互作用の試験管内と生細胞中における違い
2023 - 2025 物質共生が成立したヒト生細胞中における相互作用の測定・解析手法の開発と応用
2022 - 2025 On the basis of understanding of the particle formation of HIV with Gag protein from a structural viewpoint, the measures against AIDs will be developed. Particularly

2022 - 2024 長鎖ノンコーディングRNAのメチル化による天然変性蛋白質の凝集抑制の分子機構

2021 - 2023 ヒト生細胞中における核酸の構造と相互作用を解析するインセルNMR法の開発と応用

2020 - 2023 Anti-Alzheimer's disease effect by inhibition of prion protein which is an Ab receptor by RNA

2019 - 2022 HIV複製と創薬研究を推進する革新的な構造生物学研究基盤の創成

2021 - 木材関連物質のNMR法による構造解析

2019 - 2021 Integrated Biorefinery of Sugarcane Trash

2021 - 木材や農水産廃棄物などのバイオマスの温和な変換

2016 - 2019 Study of tuberculosis latency and development of anti-tuberculosis strategy by keeping latent state

2016 - 2018 RNAアプタマー・スイッチング素子・蛋白質のスライディングの動作原理の解明と活用

2016 - 2018 Development of functional RNA whose activity of trapping a protein switches on/off for intra- and extracellular conditions

2015 - 2018 The roles of the G-quadruplex-binding activity of human ORC in replication origin establishment

2014 - 2018 Elucidation of the mechanism by which virus inhibits the function of human anti-virus enzymes and molecular basis of drug discovery

2015 - 2017 選択標識による宿主とウイルスの蛋白質間相互作用の構造基盤の解明とその阻害剤の探索

2014 - 2016 蛋白質の捕捉と酵素活性のスイッチングの二面性を有するRNAの動作原理の解明と活用

2014 - 2016 Development of intelligent ribozyme and aptamer whose activities switch on in response to environment

2013 - 2016 Structural basis of prevention by RNA aptamer of transformation of prion protein and its interaction with Ab

2013 - 2015 ウィルスと宿主の蛋白質間相互作用による抗ウィルス効果の抑制と再活性化の構造基盤

2012 - 2014 DNA上のスライディングの方向による塩基変換の酵素反応速度の違いとそのメカニズム

2011 - 2014 Development of dissolution and biomimetic degradation systems of whole plant cell walls for biorefinerywalls

2011 - 2012 Development of ion-channel composed of nucleic acids

2010 - 2011 DNA上の極性を有したスライディングとカップルした塩基変換酵素反応の解析

2009 - 2011 Structural analysis of A1 protein-telomere-telomerase complex, and development of inhibition of telomerase

2008 - 2010 Molecular basis for the formation of translational repression complex that regulates stem cell differentiation

2007 - 2008 ラフトタンパク質PFOの構造・相互作用解析と核酸性イオンチャネルの創製

2007 - 2007 核酸4重鎖構造をベースにした核酸性イオンチャネルの創製

2006 - 2007 結合蛋白質によるテロメア長制御の構造基盤の解明と癌治療に向けたデコイ法の試み

2006 - 2007 Structure-function correlation of disease-related functional RNA

2005 - 2006 hnRNP A1/D、Musashi及びアプタマーによる遺伝情報制御の分子基盤

2005 - 2006 ラフトのコレステロールに結合するPFOタンパク質の構造遷移と相互作用様式の解明

2004 - 2004 機能性脂質ドメイン(ラフト)におけるコレステロールとタンパク質の相互作用の解析

2003 - 2004 hnRNP D、FMRP及びアプタマーによる遺伝情報発現制御の分子基盤

2002 - 2002 アプタマー、Musashi及びhnRNP Dによる遺伝情報発現制御の分子基盤

2000 - 2002 Drug design based on the complex structure of HIV-Tat and its RNA aptamer

1998 - 2001 Roles of protein-protein interactions in nuclear signal transductions

1999 - 1999 カリウムイオンが誘起するDNA4重鎖構造とテロメア配列結合性蛋白質によるその破壊

1998 - 1998 カリウムイオンによるDNAの構造遷移を利用したリボザイム活性のスイッチング

1997 - 1998 Structural basis of novel quadruplex-duplex switching of nucleic acids

1994 - 1998 Analyses of Signal Transduction Mechanisms based on Protein Structures

1997 - 1997 カリウムが誘導する核酸の新規2重鎖-4重鎖転移及びリボザイムの構造化学的研究

1994 - 1997 Role of three dimensional structure of proteins in signal transduction

1996 - 1996 亜鉛フィンガー蛋白質EIAと鉛リボザイムの生理機能発現機構の構造化学的研究

1996 - 1996 アデニン-カルテットを含む新規核酸4重鎖構造の研究

1995 - 1995 新しいNMR技術を用いた鉛リボザイムの切断活性具現機構の構造的基盤の解明

1993 - 1994 Structure and Function of Heat-stable Sweet Protein, Mabinlin

1993 - 1994 生体高分子用レーザー増感NMR装置の製作

1993 - 1994 新型リボザイムにおける構造-活性相関及び非標準型塩基対形成能のNMRによる研究

1993 - 1993 蛋白質の高次構造に基づくシグナル認識機構の解明

1989 - 1989 塩基配列に依存した核酸構造の多様性と蛋白質によるその識別

蛋白質と核酸の相互作用

核酸の構造-機能相関

蛋白質の構造-機能相関

Interaction between Protein and Nucleic Acid

Structure-function correlation of Nucleic Acids

Structure-function Correlation of Proteins

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Papers (199)：

Masahiro Kinoshita, Tomohiko Hayashi, Yuka Nakamura, Akira Yoshimori, Masato Katahira, Takashi Nagata. A physical picture of liquid-liquid phase separation of proteins. Journal of Molecular Liquids. 2025. 127040-127040
Kazuyuki Kumagai, Keisuke Kamba, Takuya Suzuki, Yuto Sekikawa, Chisato Yuki, Michiaki Hamada, Kayoko Nagata, Akifumi Takaori-Kondo, Li Wan, Masato Katahira, et al. Selection and characterization of aptamers targeting the Vif-CBFβ-ELOB-ELOC-CUL5 complex. Journal of biochemistry. 2024
Yuriko Ozeki, Akira Yokoyama, Akihito Nishiyama, Yutaka Yoshida, Yukiko Ohara, Tsukasa Mashima, Chikako Tomiyama, Amina K Shaban, Atsuki Takeishi, Mayuko Osada-Oka, et al. Recombinant mycobacterial DNA-binding protein 1 with post-translational modifications boosts IFN-gamma production from BCG-vaccinated individuals' blood cells in combination with CpG-DNA. Scientific reports. 2024. 14. 1. 9141-9141
Nozomi Yoneda, Haruka Iyama, Takashi Nagata, Masato Katahira, Yoshiki Ishii, Kohei Tada, Kazuhiko Matsumoto, Rika Hagiwara. Fluoride Ion in Alcohols: Isopropanol vs. Hexafluoroisopropanol. The Journal of Physical Chemistry Letters, in press. 2024
Apisan Phienluphon, Keiko Kondo, Bunzo Mikami, Kenneth Sze Kai Teo, Kaori Saito, Takashi Watanabe, Takashi Nagata, Masato Katahira. Structure-based characterization and improvement of an enzymatic activity of <i>Acremonium alcalophilum</i> feruloyl esterase. ACS Sustainable Chemistry & Engineering. 2024. 12. 3831-3840

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MISC (484)：

阪本知樹, 阪本知樹, 山置佑大, 山置佑大, 永田崇, 永田崇, 片平正人, 片平正人. The first detection of the formation of DNA triplex structure in living human cells and an analysis of base pair dynamics under molecular crowding environment. 日本化学会春季年会講演予稿集(Web). 2023. 103rd
遠藤朱梨, 関口真裕, 阪本智樹, 堀内正隆, 石川岳志, 片平正人, 永田崇, 山岸賢司, 坂本泰一. Effect of modification on the aptamer that binds to IgG1. 日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web). 2023. 46th
長谷川拓矢, 阪本智樹, 関口真裕, 石川岳志, 片平正人, 永田崇, 山岸賢司, 坂本泰一. Comparison of structural characteristics of RNA aptamer and Chimera aptamer against IgG1. 日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web). 2023. 46th
阪本知樹, 阪本知樹, 山置佑大, 山置佑大, 永田崇, 永田崇, 片平正人, 片平正人. Analysis of base pair opening-closing dynamics under molecular crowding environment of triplex structure-forming DNAs. 日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web). 2022. 45th
山置佑大, 山置佑大, 永田崇, 永田崇, 川上愛加, 阪本知樹, ELADL Omar, 近藤敬子, 片平正人, 片平正人. Base-pair opening dynamics of nucleic acids in living human cells studied by in-cell NMR and analysis of nucleic acid condensate. 日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web). 2022. 45th

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Patents (3)：

Nucleic Acid-Enzyme Complex
Hsp70を有効成分として含有するHIV-1感染症治療剤
核酸酵素複合体

Books (20)：

生命金属ダイナミクス : 生体内における金属の挙動と制御
エヌ・ティー・エス 2021 ISBN:9784860437060
核酸科学ハンドブック
講談社 2020 ISBN:9784065207864
海洋微生物酵素群によるリグニン分解高度化と人工漆材料への展開
CMC出版 2020
ヒト生細胞中における核酸NMRシグナルの初観測
生物物理、59巻1号 2019
Multiplicity in long noncoding RNA in living cells
Biomedical Sciences, 4, 18-23 2018

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Lectures and oral presentations (80)：

Behavior of nucleic acids in living human cells as revealed by in-cell NMR
(Japan-Taiwan Bilateral NMR Conference 2024)
液液相分離で生じた核酸コンデンセート中の分子の並進運動と回転運動及びインセルNMR
(第46回日本分子生物学会)
生命科学研究とバイオマス研究におけるNMRの応用
(日本分光学会主催セミナー「NMR分光法の基礎」 2023)
生細胞中の核酸の挙動のインセルNMR法による直接観測
(第13回CSJ化学フェスタ2023 2023)
Structure, dynamics and interaction of nucleic acids in living human cells as revealed by in-cell NMR
(The 10th Asia-Pacific NMR 2023)

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Works (8)：

神経分化を制御するMusashi蛋白質の構造生物学
1999 -
エイズウィルスの悪性蛋白質に対するRNAアプタマーの作用機序
1999 -
テロメア結合蛋白質hnRNP D0の構造生物学
1999 -
Structural biology on Musashi regulating neural cell fate
1999 -
Structural biology on RNA aptamer for HIV Tat
1999 -

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Education (3)：

1986 - 1989 Osaka University
1984 - 1986 The University of Tokyo Graduate School of Science
1980 - 1984 Waseda University School of Science and Engineering

Professional career (2)：

Ph.D. (Osaka University)
(BLANK) (The University of Tokyo)

Work history (8)：

2024/04 - 現在 Kyoto University Institute of Advanced Energy Director
2021/04 - 2024/03 京都大学エネルギー理工学研究所附属エネルギー複合機構研究センターセンター長
2010/02/01 - Institute of Advanced Energy, Kyoto University Professor
2005 - 2010 Yokohama City University International Graduate School of Arts and Sciences Professor
1995 - 2005 Yokohama National University

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Committee career (34)：

2024/04 - 2026/03 日本核磁気共鳴学会評議員
2024 - 2025 日本核酸化学会評議員
2022/04 - 2024/03 日本核磁気共鳴学会理事
2022/04 - 2024/03 日本核磁気共鳴学会評議員
2023/01 - 2023/12 日本生物物理学会分野別専門委員・欧文誌アドバイザリーボード

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Awards (1)：

2019/09 - 日本生物物理学会日本生物物理学会若手招待講演賞 In-cell NMR法を用いたヒト生細胞内核酸の構造およびダイナミクスの評価

Association Membership(s) (10)：

日本核磁気共鳴学会 , 日本蛋白質科学会 , 日本RNA学会 , 日本生化学会 , 日本化学会 , 日本分子生物学会 , 日本生物物理学会 , The Lignin Society , The Japan Wood Research Society , 日本核酸化学会

※ Researcher’s information displayed in J-GLOBAL is based on the information registered in researchmap. For details, see here.

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