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J-GLOBAL ID：200901086154329960
Update date: Feb. 17, 2025 INAGAKI Yuji
イナガキ ユウジ | INAGAKI Yuji
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University of Tsukuba Center for Computational Sciences
About University of Tsukuba Center for Computational Sciences
Job title： Professor
Research theme for competitive and other funds (18)：
- 2019 - 2023 ミトコンドリアDNAポリメラーゼの多様性と進化の全容解明
- 2018 - 2022 海洋原生生物に共生する細菌多様性の実態解明
- 2017 - 2020 Elucidation of evolutionary process of light adaptation in a course of loss of photosynthesis.
- 2016 - 2019 Study on the residual green alga-derived nucleomorphs in dinoflagellates
- 2016 - 2019 海洋バクテリアの長期炭素隔離機能に対する海洋酸性化の影響評価
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- Pánek, Tomáš, Tice, Alexander K., Corre, Pia, Hrubá, Pavla, Žihala, David, Kamikawa, Ryoma, Yazaki, Euki, Shiratori, Takashi, Kume, Keitaro, Hashimoto, Tetsuo, et al. An expanded phylogenomic analysis of Heterolobosea reveals the deep relationships, non-canonical genetic codes, and cryptic flagellate stages in the group. Molecular Phylogenetics and Evolution. 2025. 204. 108289
- Nakayama, Takuro, Harada, Ryo, Yabuki, Akinori, Nomura, Mami, Shiba, Kogiku, Inaba, Kazuo, Inagaki, Yuji. Drastic genome reduction driven by parasitic lifestyle: Two complete genomes of endosymbiotic bacteria possibly hosted by a dinoflagellate. bioRχiv. 2025
- Kohei, Bamba, Ryo, Harada, INAGAKI, Yuji. AUTOEB: A software for systematically evaluating bipartitions in a phylogenetic tree employing an approximately unbiased test. IPSJ Transactions on Bioinformatics. 2024. 17. 72-82
- 稲垣, 祐司, 原田亮. The diversity and evolution of DNA polymerases localized in organelles: What we have unveiled and what we are uncertain about. 月刊アグリバイオ. 2024. 8. 12. 43-47
- Yazaki, Euki, Uehara, Tadaaki, Sakaoto, Hirokazu, Inagaki, Yuji. Dinotoms possess two evolutionary distinct autophagy-related ubiquitin-like conjugation systems. Protist. 2024. 175. 6. 126067-126067
- 潟端篤, 松尾充啓, 鈴木穣, 水口洋平, 野口英樹, 豊田敦, 藤山秋佐夫, 佐藤壮一郎, 松崎素道, 中山卓郎, et al. 有殻アメーバPaulinella chromatophoraのトランスクリプトーム解析. 第37回日本分子生物学会年会. 2014. 37th
- 稲垣祐司, 西村祐貴, 神川龍馬, 谷藤吾朗, 中山卓郎, 橋本哲男. 大規模配列データで解明される新奇真核微生物系統とそのオルガネラゲノム. 日本植物学会第78回大会. 2014
- MPI/OpenMP HYBRID Parallelization of Phylogenetic Analyses Based on Non-Homogeneous Substitution Models: Implementation and Performance Evaluation for Large-scale Computing Systems. 2014. 7. 3. 13-24
- 久米慶太郎, 高林舜, 森田幸之介, 神川龍馬, 稲垣祐司, 橋本哲男. Fornicata生物のミトコンドリア関連オルガネラタンパク質におけるmatrix targeting signal. 第15回進化学会. 2014
- 西村祐貴, 神川龍馬, 谷藤吾朗, 橋本哲男, 稲垣祐司. 真核微生物Palpitomonas bilixにおけるミトコンドリアゲノム解析. 日本進化学会第16回大会. 2014
- 共生微生物
化学同人 2016 ISBN:9784759817287 - Reference modules in Materials Science and Engineering 2016
2016 - ロングブランチの誘惑--分子系統解析のダークサイド
The Japanese Journal of Phycology 2007 - アピコンプレクサ類の退化葉緑体は緑藻起源か?
The Japanese Journal of Phycology 2004
-
Morphology, ultrastructure and phylogeny of a new species of <i>Glissandra</i> (Protista incertae sedis).
(ICOP2017 2017) -
大規模系統解析におけるブートストラップ値100%は信頼できるのか?:AU検定を応用した系統樹中の二分岐に対する新たな評価手法.
(第57回日本原生生物学会大会) -
系統的所属不明真核生物<i>Glissandra oviformis</i>が拡張するCRuMsクレードの多様性.
(第57回日本原生生物学会大会) -
Two evolutionarily distinct autophagy-related ubiquitin-like conjugation systems in dinotoms.
(APCOP-V 2024) -
単細胞ゲノム増幅産物から発見された極小古細菌ゲノム.
(日本微生物生態学会第37回大会)
- 2016/04 - 現在 University of Tsukuba Center for Computational Sciences
- 2008/08 - 日本進化学会 日本進化学会研究奨励賞
- 2007/04 - 文部科学省 科学技術分野の文部科学大臣表彰若手科学者賞
- 1993/04 - 公益信託森安大学院生奨学基金
International Society of Protistologists
, THE JAPANESE SOCIETY OF PHYCOLOGY
, Society for Molecular Biology and Evolution
, The Molecular Biology Society of Japan
, SOCIETY OF EVOLUTIONARY STUDIES, JAPAN
, International Society for Evolutionary Protistology
※ Researcher’s information displayed in J-GLOBAL is based on the information registered in researchmap. For details, see here.
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