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J-GLOBAL ID：201101041455018000   Update date: Apr. 03, 2025

Ueda HIroki

ウエダ ヒロキ | Ueda HIroki
Clips
Affiliation and department：
The University of Tokyo Graduate School of Medicine and Faculty of Medicine

About The University of Tokyo Graduate School of Medicine and Faculty of Medicine


Job title： Professor
Other affiliations (2)：
  • Laboratory for Synthetic Biology, RIKEN  Laboratory Head
  • Kurume University  Professor
Homepage URL  (1)： http://kaken.nii.ac.jp/ja/r/20373277
Research field  (1)： Pharmacology
Research keywords  (26)： ハイスループット測定 ,  時計制御配列 ,  転写回路 ,  DNAチップ ,  理論生物学 ,  細胞間同調 ,  転写ダイナミクス ,  メラノプシン ,  データベース ,  バイオイメージング ,  脱同調 ,  光による定量的な制御 ,  遺伝子発現制御 ,  一細胞測定 ,  シンセティックバイオロジー ,  システムバイオロジー ,  再構成 ,  細胞間情報伝達 ,  プロモーター ,  バイオインフォマティクス ,  ハイスループット ,  合成生物学 ,  シンギュラリティー現象 ,  ゲノムワイド ,  体内時計 ,  システム生物学
Research theme for competitive and other funds  (8)：
  • 2018 - 2023 Designing the mammalian biological oscillators
  • 2013 - 2018 Understanding the design principle of circadian oscillator in mammals through reconstitution
  • 2015 - 2017 Proteome analysis for low abundant ptoteins
  • 2011 - 2016 Small-number issues in biological rhythms: regulation of oscillation system with low-abundant proteins through tuning turnover rate
  • 2011 - 2016 Spying minority in biological phenomena -Toward bridging dynamics between individual and ensemble processes-
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Papers (204)：
  • Kazuki Tainaka, Tatsuya C. Murakam, Etsuo A. Susaki, Chika Shimizu, Rie Saito, Kei Takahashi, Akiko Hayashi-Takagi, Hiroshi Sekiya, Yasunobu Arima, Satoshi Nojima, et al. Chemical Landscape for Tissue Clearing based on Hydrophilic Reagents. Cell Reports. 2108. 24. 8. 2196-2210
  • Hiroki Ueda, Tomoki Mitani, Kosei Yamaura, Rikuhiro Yamada, Katsuhiko Matsumoto, Etsuo Susaki, Naruhiko Sahara, Rin Yanai, Kensuke Ikenaka, Shiying Jiang, et al. Whole-Brain Single-Neuron Atlas Reveals Microglial Security Hole Accelerating Neuronal Vulnerability. 2025
  • Katsuhiko Matsumoto, Shoko Y Harada, Shota Y Yoshida, Ryohei Narumi, Tomoki T Mitani, Saori Yada, Aya Sato, Eiichi Morii, Yoshihiro Shimizu, Hiroki R Ueda. DECODE enables high-throughput mapping of antibody epitopes at single amino acid resolution. PLoS biology. 2025. 23. 1. e3002707
  • 南 陽一, 岸 哲史, 上田 泰己. 睡眠健診の実現にむけて 子ども睡眠健診プロジェクトの現状. 睡眠と環境. 2024. 18. 2. 21-26
  • Tomoki T Mitani, Kosei Yamaura, Katsuhiko Matsumoto, Rikuhiro Yamada, Etsuo A Susaki, Hiroki R Ueda. Whole-brain Cellome-Wide Association Study (CWAS) Unveils Ultra-Early Neurodegeneration Phenomena in a 3D Spatial Cell Atlas. Alzheimer's & Dementia. 2024. 20. S1
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MISC (350)：
  • Hiroki R. Ueda, Koji L. Ode, Hiroyuki J. Kanaya. Faculty Opinions Recommendation of [Cichon J et al., Nat Neurosci 2023 26(1:39-52)]. Faculty Opinions. 2023
  • 山下勝成, 松本桂彦, 松本桂彦, 吉田将太, 吉田将太, 上田泰己, 上田泰己. Whole brain activity atlas of circadian rhythm: A quantitative analysis with tissue clearing, 3D immunostaining, and 3D imaging. 日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web). 2023. 46th
  • MINAMI Yoichi, KISHI Akifumi, UEDA Hiroki. Large-scale sleep analysis in youth and neurodevelopmental disorders. 11th Congress of the Asian Society for Child and Adolescent Psychiatry and Allied Professions, 2023. 2023
  • 南陽一, 南陽一, 岸哲史, 岸哲史, 上田泰己, 上田泰己, 上田泰己. ウェアラブルデバイスを用いた睡眠教育. 日本公衆衛生学会総会抄録集(CD-ROM). 2023. 82nd
  • 曹思ぎょく, 戸根大輔, 山田陸裕, 隅山健太, 上田泰己, 上田泰己. Study on the dephosphorylated-modulation of synaptic proteins engaged in sleep-wakefulness regulation. 日本薬理学雑誌. 2023. 158. Supplement
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Education (3)：
  • - 2004 東京大学大学院医学系研究科博士課程修了
  • - 2000 The University of Tokyo Faculty of Medicine
  • 1991 - 1994 Kurume University High School
Work history (22)：
  • 2011 - 2018 Japan Science and Technology Agency
  • 2011 - 2018 理化学研究所 生命システム研究センター 細胞デザインコア/合成生物学研究グループ コア長/グループディレクター
  • 2018 - 理化学研究所 生命機能科学研究センター 合成生物学研究チーム チームリーダー
  • 2017 - 東京大学国際高等研究所ニューロインテリジェンス国際研究機構 主任研究員(兼担)
  • 2016 - 東京大学大学院情報理工学研究科システム情報学専攻 教授(兼担)
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Awards (15)：
  • 2018 - 第50回 市村学術賞功績賞 市村学術賞功績賞
  • 2017 - 第4回イノベーター・オブ・ザ・イヤー イノベーター・オブ・ザ・イヤー
  • 2015 - 第15回山崎貞一賞 山崎貞一賞
  • 2012 - 塚原仲晃記念賞 塚原仲晃記念賞
  • 2011 - 永瀬賞(フロンティアサロン) 永瀬賞(フロンティアサロン)
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Association Membership(s) (13)：
European Biological Rhythms Society (EBRS) ,  European Sleep Research Society (ESRS) ,  Society for Neuroscience (SfN) ,  Society for Research on Biological Rhythms (SRBR) ,  日本神経科学学会 ,  日本抗加齢学会 ,  日本マーモセット研究会 ,  日本生物物理学会 ,  日本睡眠学会 ,  日本薬理学会 ,  日本生化学会 ,  日本分子生物学会 ,  「細胞を創る」研究会
※ Researcher’s information displayed in J-GLOBAL is based on the information registered in researchmap. For details, see here.

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