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J-GLOBAL ID:201201004912271535   Update date: Apr. 01, 2025

Shimizu Atsushi

シミズ アツシ | Shimizu Atsushi
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Affiliation and department:
Job title: Professor
Other affiliations (5):
  • Iwate Medical University  Iwate Tohoku Medical Megabank Organization 
  • Iwate Medical University  Center for Genome and Omics Analysis, Institute for Biomedical Sciences 
  • National Institute of Genetics  DNA Data Bank of Japan 
  • Keio University  School of Medicine, Department of Preventive Medicine and Public Health   Professor
  • Tohoku University  Tohoku Medical Megabank Organization 
Homepage URL  (2): http://iwate-megabank.orghttp://researchmap.jp/atsushi_ngs/
Research field  (4): Genomics ,  Systems genomics ,  Medical biochemistry ,  Fetal medicine/Pediatrics
Research keywords  (6): バイオインフォマティクス ,  次世代シークエンサー ,  疫学 ,  遺伝医学 ,  ゲノム医学 ,  Molecular genetics
Research theme for competitive and other funds  (28):
  • 2023 - 2028 Usefulness of metabolite biomarker as a common pathway for the prevention of non-communicable diseases and frailty
  • 2022 - 2028 Platform of Supporting Cohort Study and Biospecimen Analysis
  • 2023 - 2026 Development and Validation of a Combined Risk Prediction Model for Childhood Obesity Using Cord Blood Genomics and Epigenomics
  • 2022 - 2026 A comprehensive Mendelian Randomization on the causal pathway from psychological traits to all-cause mortality
  • 2022 - 2026 A comprehensive Mendelian Randomization on the causal pathway from psychological traits to all-cause mortality
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Papers (175):
  • Yoichi Sutoh, Tsuyoshi Hachiya, Yayoi Otsuka-Yamasaki, Tomoharu Tokutomi, Akiko Yoshida, Yuka Kotozaki, Shohei Komaki, Shiori Minabe, Hideki Ohmomo, Kozo Tanno, et al. Reference-Based Standardization Approach Stabilizing Small Batch Risk Prediction via Polygenic Score. Genetic epidemiology. 2025. 49. 2. e70002
  • Masatoshi Nagata, Shohei Komaki, Yuichiro Nishida, Hideki Ohmomo, Megumi Hara, Keitaro Tanaka, Atsushi Shimizu. Influence of physical activity on the epigenetic clock: evidence from a Japanese cross-sectional study. Clinical epigenetics. 2024. 16. 1. 142-142
  • Yoichi Sutoh, Tsuyoshi Hachiya, Yayoi Otsuka-Yamasaki, Shohei Komaki, Shiori Minabe, Hideki Ohmomo, Makoto Sasaki, Atsushi Shimizu. Healthy lifestyle practice correlates with decreased obesity prevalence in individuals with high polygenic risk: TMM CommCohort study. Journal of human genetics. 2024
  • MINABE Shiori, KOMAKI Shohei, OHMOMO Hideki, SHIMIZU Atsushi. DNA Methylation Study in DOHaD Theory: A Perspective from the Tohoku Medical Megabank (TMM) Project. Developmental Origins of Health and Disease Research. 2024. 12. 1. 5-10
  • Masato Takase, Naoki Nakaya, Kozo Tanno, Mana Kogure, Rieko Hatanaka, Kumi Nakaya, Ippei Chiba, Ikumi Kanno, Kotaro Nochioka, Naho Tsuchiya, et al. Relationship between traditional risk factors for hypertension and systolic blood pressure in the Tohoku Medical Megabank Community-based Cohort Study. Hypertension research : official journal of the Japanese Society of Hypertension. 2024. 47. 6. 1533-1545
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MISC (202):
  • 土岐了大, 小島駿, 小島駿, 伏木蒼太郎, 伏木蒼太郎, 原田成, 平田あや, 飯田美穂, 松元美奈子, 宮川尚子, et al. 日本人集団における血中アミノ酸濃度のゲノムワイド関連解析(GWAS)とそれを用いた疾患との関連研究. 日本疫学会学術総会講演集(Web). 2024. 34th
  • 清水厚志, 清水厚志, 清水厚志, 小巻翔平, 小巻翔平, 小巻翔平, 荒木重則, 荒木重則, 美辺詩織, 美辺詩織, et al. Personalized medicine through disclosing epigenomic age to individuals: Feasibility Study. 日本遺伝カウンセリング学会誌. 2024. 45. 2
  • 清水厚志, 清水厚志, 清水厚志, 小巻翔平, 小巻翔平, 小巻翔平, 大桃秀樹, 大桃秀樹, 大桃秀樹. 日本人マイクロアレイデータをレファレンスとして用いるエピゲノム年齢推定法の開発. 日本抗加齢医学会総会プログラム・抄録集. 2024. 24th
  • 美辺詩織, 美辺詩織, 小巻翔平, 小巻翔平, 大桃秀樹, 大桃秀樹, 清水厚志, 清水厚志. DNA Methylation Study in DOHaD Theory: A Perspective from the Tohoku Medical Megabank (TMM) Project. DOHad研究(Web). 2024. 12. 1
  • 羽入田明子, 羽入田明子, 後藤温, 後藤温, 中杤昌弘, 若井建志, 清水厚志, 丹野高三, 木下賢吾, 寶澤篤, et al. Glycemic traits and POAG: Mendelian randomization study in a Japanese population. 日本眼科学会雑誌. 2023. 127
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Patents (2):
  • 腎細胞癌の診断マーカー及びそれを用いた診断方法
  • 脳梗塞発症リスクの予測モデル作成方法および予測方法
Books (7):
  • がんゲノムデータ解析
    メディカルサイエンスインターナショナル 2022 ISBN:4815730520
  • 次世代シークエンサーDRY解析教本
    学研メディカル秀潤社 2019 ISBN:478090983X
  • 実験医学増刊 Vol.35 No.17 ヒト疾患のデータベースとバイオバンク〜情報をどう使い、どう活かすか?ゲノム医療をどう実現するか?
    羊土社 2017 ISBN:4758103666
  • 次世代シークエンサーDRY解析教本 (細胞工学別冊)
    学研メディカル秀潤社 2015 ISBN:4780909201
  • 実験医学別冊「次世代シークエンス解析スタンダード」ヒトゲノム・オミックス情報のコホート研究への応用.
    羊土社 2014
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Lectures and oral presentations  (122):
  • 脳梗塞のゲノム疫学研究
    (第54回日本動脈硬化学会総会・学術集会 2022)
  • ポリジェニックリスクスコアのがん予防や治療への実装と課題
    (日本人類遺伝学会第66回大会 第28回日本遺伝子診療学会大会 合同開催 2021)
  • 大規模ゲノムコホート連携と遺伝情報を活用した疾患発症リスク予測モデルによる個別化予防の実現
    (第123回 慶應義塾大学医学部生涯教育研修セミナー 2021)
  • いわて東北メディカル・メガバンク機構(IMM)におけるコホート検体の複合オミックス解析
    (慶應義塾大学 システム医療研究開発センター セミナー 2016)
  • ヒトゲノム情報を活用した次世代型予防医療の実現に向けて
    (成育医療センター特別セミナー 2016)
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Education (2):
  • 1994 - 1999 Aoyama Gakuin University Graduate School of Science and Engineering
  • 1900 - 1994 Aoyama Gakuin University College of Science and Engineering Department of Chemistry
Professional career (1):
  • 博士(理学) (青山学院大学)
Work history (13):
  • 2022/04 - 現在 National Institute of Genetics Bioinformation and DDBJ Center Professor
  • 2020/05 - 現在 Tohoku University Tohoku Medical Megabank Organization
  • 2020/01 - 現在 岩手医科大学 Division of Biomedical Information Analysis, Institute for Biomedical Sciences Professor
  • 2019/08 - 現在 Keio University School of Medicine, Department of Preventive Medicine and Public Health Professor
  • 2013/04 - 2024/03 Keio University School of Medicine, Department of Physiology
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Committee career (4):
  • 2022/01 - 現在 日本疫学会疫学 リソース利用促進委員会リンケージ基盤推進ワーキンググループ委員
  • 2019/11 - 現在 日本人類遺伝学会 利益相反委員会委員
  • 2019/11 - 現在 日本人類遺伝学会 評議員
  • 2018/04 - 2020/03 日本バイオインフォマティクス学会 理事
Association Membership(s) (9):
NGS現場の会 ,  日本オミックス医療学会 ,  日本エピジェネティクス研究会 ,  THE KEIO MEDICAL SOCIETY ,  THE MOLECULAR BIOLOGY SOCIETY OF JAPAN ,  American Society of Human Genetics ,  日本遺伝子診療学会 ,  THE JAPAN SOCIETY OF HUMAN GENETICS ,  THE JAPANESE SOCIETY FOR GENETIC COUNSELING
※ Researcher’s information displayed in J-GLOBAL is based on the information registered in researchmap. For details, see here.

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