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J-GLOBAL ID：201301035018419474
Update date: Oct. 07, 2024
Onami Jun-ichi
オオナミ ジュンイチ | Onami Jun-ichi
Affiliation and department：
Job title：
Research & Development Scientist
Research field (2)：
Database science
, Systems genomics
Research theme for competitive and other funds (4)：
- 2023 - 2027 学術情報の早期評価のための指標統合
- 2021 - 2023 人文学研究データのオープンサイエンスにおける活用を最大化する情報基盤の構築
- 2021 - 2022 国内で検出された新型コロナウイルス遺伝情報のCOVID-19データポータルJAPANへの掲載
- 2017 - 2019 The comprehensive analysis of type I collagen sequence as a biomarker for distinguishing fossils and archaeological samples.
Papers (10)：
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So Nakagawa, Toshiaki Katayama, Lihua Jin, Jiaqi Wu, Kirill Kryukov, Rise Oyachi, Junko S Takeuchi, Takatomo Fujisawa, Satomi Asano, Momoka Komatsu, et al. SARS-CoV-2 HaploGraph: visualization of SARS-CoV-2 haplotype spread in Japan. Genes & Genetic Systems. 2023
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Rumi Konuma, Maiko Watanabe, Daisuke Irikura, Yoshiko Sugita-Konishi, Akiko Yamazaki, U Yanagi, Doha Yahia, Naoki Kobayashi, Hiroji Chibana, Jun-ichi Onami, et al. Polymorphism of Aspergillus Fumigatus Major Allergen Genes Associating with Their Isolated Sites Affects Their IgE Epitope Structures. Fungal Genomics & Biology. 2022. 12. 4
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Qingyu Chen, Ramona Britto, Ivan Erill, Constance J. Jeffery, Arthur Liberzon, Michele Magrane, Jun-ichi Onami, Marc Robinson-Rechavi, Jana Sponarova, Justin Zobel, et al. Quality Matters: Biocuration Experts on the Impact of Duplication and Other Data Quality Issues in Biological Databases. Genomics, Proteomics & Bioinformatics. 2020
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Jun-ichi Onami, Hideki Hatanaka, Shoko Kawamoto, Toshihisa Takagi. Life science database cross search: A single window system for dispersed biological databases. Bioinformation. 2019. 15. 12. 883-886
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Shohei Takuno, Ryutaro Miyagi, Jun-ichi Onami, Shiho Takahashi-Kariyazono, Akie Sato, Herbert Tichy, Masato Nikaido, Mitsuto Aibara, Shinji Mizoiri, Hillary D. J. Mrosso, et al. Patterns of genomic differentiation between two Lake Victoria cichlid species, Haplochromis pyrrhocephalus and H. sp. ‘macula’. BMC Evolutionary Biology. 2019. 19. 68
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MISC (3)：
Books (2)：
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バイオDBとウェブツール ラボで使える最新70選(実験医学増刊)
羊土社 2022 ISBN:9784758104067
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今日から使える! データベース・ウェブツール 達人になるための実践ガイド100(実験医学増刊)
羊土社 2014 ISBN:9784758103435
Lectures and oral presentations (98)：
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NCBI塩基配列データベースに蓄積するエラー解析
(トーゴーの日シンポジウム2024 2024)
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理研BRCが提供する遺伝子材料リソースの構成とBackbone情報に基づく系譜の分析
(トーゴーの日シンポジウム2024 2024)
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RDMkit-jp:研究データ管理(RDM)の知識や情報を共有するサービス
(トーゴーの日シンポジウム2024 2024)
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学術情報検索サービスCiNiiの機械翻訳活用による海外利用者拡大の試み
(情報知識学会 第32回(2024年度)年次大会 2024)
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CiNiiのログから見るユーザーアクセスグラフの計量分析
(情報知識学会 第32回(2024年度)年次大会 2024)
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Works (8)：
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APAN data
Jun-ichi Onami 2022 - 現在
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COVID-19 Data Portal Japan
2020 - 現在
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FORCE2019参加報告 ~オープンな科学やデータのために~
Jun-ichi Onami 2020 -
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日本進化学会第21回大会に参加して
Jun-ichi Onami 2019 -
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BioHackathon 2018 Parisに参加して
大波純一 2019 -
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Education (3)：
- 2006 - 2009 東京工業大学大学院 生命理工学研究科 生体システム専攻
- 2004 - 2006 東京大学大学院 理学系研究科 生物科学専攻
- 2000 - 2004 Tokyo Institute of Technology
Professional career (1)：
Work history (6)：
- 2024/04 - 現在 RIKEN BioResource Research Center Research & Development Scientist
- 2020/07 - 現在 Japan Science and Technology Agency National Bioscience Database Center Visiting researcher
- 2020/10 - 2024/03 National Institute of Health Sciences Division of microbiology Collaborative researcher
- 2020/07 - 2024/03 National Institute of Informatics (NII) Research Center for Open Science and Data Platform (RCOS) Project Associate Professor
- 2020/04 - 2020/06 National Institute of Informatics (NII) Research Center for Open Science and data platform (RCOS) Project researcher
- 2012/03 - 2020/03 JAPAN SCIENCE AND TECHNOLOGY AGENCY (JST) National Bioscience Database Center (NBDC) Researcher
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