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J-GLOBAL ID：201501053011063391 Update date: Nov. 06, 2024

Kimura Hiroshi

キムラヒロシ | Kimura Hiroshi

Affiliation and department：
Job title： Professor
Homepage URL (1)： http://kimura-lab.bio.titech.ac.jp/

Research field (4)： Molecular biology , Cell biology , Genetics , Biophysics

Research keywords (32)： live cell imaging , monoclonal antibody , cell nucleus , chromosome , クロマチン , ヒストン , 染色体 , 細胞核 , 翻訳後修飾 , 遺伝子発現 , エピジェネティクス , ヌクレオソーム , 細胞周期 , 細胞 , リン酸化 , 転写制御 , 分子生物学 , 細胞生物学 , DNA複製 , 転写 , 核構造 , モノクローナル抗体 , chromatin , 機能 , histone modification , nucleosome , gene regulation , 生細胞観察 , epigenetics , メチル化 , MCM遺伝子 , FRAP

Research theme for competitive and other funds (34)：

2021 - 2025 Significance and mechanism of mutually exclusive inactive histone marks
2020 - 2025 細胞シート工学を用いたラミノパチー疾患モデル構築と核ラミナ修復機構の解明
2018 - 2023 遺伝子制御の基盤となるクロマチンポテンシャル
2018 - 2023 細胞核・クロマチン構造のダイナミクスと遺伝子制御
2017 - 2021 生細胞解析による転写制御におけるクロマチン修飾の意義の解明

2016 - 2018 Elucidation of chromatin dynamics by an energy sensor histone demethylase

2015 - 2018 International research network for chromatin structure, dynamics, and function

2013 - 2018 Chromatin structure, dynamics, and function

2014 - 2017 Development of a new therapy by regulating histone acetylation

2012 - 2017 Elucidation of mechanisms of transcription cycle using multi-color, single-molecule, quantitative fluorescence imaging of living cell nuclei.

2013 - 2017 A multidimensional analysis of chromatin dynamics in living cells by quantitative measurements and reconstruction

2013 - 2016 Euro-Japan collaborative field work for the understanding of symbiotic evolution of marine microbes

2014 - 2016 Understanding biological ignificance of histone modifications by epigenetic manipulation using multifunctional antibodies

2013 - 2014 Analysis of stem cell differentiation process on the basis of epigenetic change

2013 - 2014 生体内蛋白質翻訳後修飾イメージング

2013 - 2014 DNA損傷修復過程におけるヒストン修飾の生細胞動態

2012 - 2013 Detection of histone modification cross-talk using fluorescence cross-correlation spectroscopy

2011 - 2012 Analyses of centromeric chromatin structure

2011 - 2012 RNAポリメラーゼIIによる転写の場のダイナミクス

2010 - 2012 Live cell imaging of histone methylation and inactive X chromosome dynamics

2010 - 2012 G2期におけるauroraBによるヒストンリン酸化の意義

2009 - 2011 Functional analysis of nuclear envelope targeting plasma membrane Proteins : using EGF family proteins

2009 - 2010 The structural analysis of centromere specific nucleosome

2009 - 2010 RNAポリメラーゼIIによる転写の時空間場

2007 - 2009 The structure and dynamics of chromatin harboring specific histone modifications

2007 - 2008 抗体エンジニアリングによるヒストン修飾シグナル可視化システムの開発

2004 - 2008 Nuclear dynamics

2004 - 2008 Molecular mechanisms of chromatin formation and dynamics

2004 - 2005 セミインタクト細胞核を用いた第三世代試験管内転写系の開発

2003 - 2005 Regulation of gene expression and chromatin dynamics in living cells

1999 - 2003 分子間相互作用の可視化と細胞内分子定量イメージング

1995 - 1995 マウスMCMタンパク質の機能とその制御機構

1995 - 1995 マウスP1タンパク質のリン酸化制御

1994 - 1994 マウスMCM関連タンパク質の解析

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Papers (340)：

Nao Yonezawa, Tomoko Shindo, Haruka Oda, Hiroshi Kimura, Yasushi Hiraoka, Tokuko Haraguchi, Kazuo Yamagata. Reconstruction of artificial nuclei with nuclear import activity in living mouse oocytes. Genes to Cells. 2024
Ioana Olan, Masami Ando-Kuri, Aled J. Parry, Tetsuya Handa, Stefan Schoenfelder, Peter Fraser, Yasuyuki Ohkawa, Hiroshi Kimura, Masako Narita, Masashi Narita. HMGA1 orchestrates chromatin compartmentalization and sequesters genes into 3D networks coordinating senescence heterogeneity. Nature Communications. 2024
Noémie M. Chabot, Ramya Purkanti, Alessia Del Panta Ridolfi, Damian Dalle Nogare, Haruka Oda, Hiroshi Kimura, Florian Jug, Alma Dal Co, Nadine L. Vastenhouw. Local DNA compaction creates TF-DNA clusters that enable transcription. 2024
Koichiro Komatsu, Hisashi Ideno, Kazuhisa Nakashima, Nobuyuki Udagawa, Yasuhiro Kobayashi, Hiroshi Kimura, Makoto Tachibana, Teruhito Yamashita, Akira Nifuji. The G9a histone methyltransferase represses osteoclastogenesis and bone resorption by regulating NFATc1 function. FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology. 2024. 38. 13. e23779
Yasuyuki Ohkawa, Akihito Harada, Takeru Fujii, Kosuke Tomimatsu, Michiko Kato, Miho Ito, Kazumitsu Maehara, Shoko Sato, Hitoshi Kurumizaka, Yuko Sato, et al. Tracking chromatin structure changes by single-cell multi-epigenomics with RNA polymerase II binding profiles. 2024

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MISC (101)：

Shimi Takeshi, Kono Yohei, Adam Stephen, Sato Yuko, Reddy Karen, Zheng Yixian, Medalia Ohad, Goldman Robert, Kimura Hiroshi. Hot topics on nuclear envelope Molecular mechanisms underlying defective repair of nuclear envelope ruptures in laminopathies(タイトル和訳中). The Journal of Physiological Sciences. 2023. 73. Suppl.1. 43-43
福田渓, 志村知古, 志見剛, 木村宏, 眞貝洋一. 転写促進と抑制-表と裏から理解する遺伝子発現制御ヘテロクロマチンの核内空間制御におけるクロマチン修飾の役割. 日本生化学会大会プログラム・講演要旨集. 2022. 95th. 2S16e-06
河野洋平, 木村宏, 志見剛. 核膜損傷修復における核ラミンAおよびCの異なる動態の解明. 日本生化学会大会プログラム・講演要旨集. 2022. 95回. 3P-232
志見剛, 河野洋平, Pack Chan-Gi, Adam Stephen A., Zheng Yixian, Medalia Ohad, Goldman Robert D., 木村宏. 核膜孔複合体からみた細胞の増殖、分化、発生の調節から種の進化まで A型ラミンが損傷した核ラミナを修復する分子メガニズム(Molecular mechanisms in repairing the nuclear lamina by A-type lamins after nuclear rupture). 日本細胞生物学会大会講演要旨集. 2021. 73回. S12-3
趙寧, 森崎達也, 小田春佳, 佐藤優子, 木村宏, Stasevich Timothy J. クローズアップ実験法(series 320) タンパク質1分子を翻訳過程からイメージング可能なプローブ「HA Frankenbody」. 実験医学. 2020. 38. 4. 607-613

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Books (6)：

新・生細胞蛍光イメージング
共立出版 2015 ISBN:9784320057791
細胞核 : 遺伝情報制御と疾患 : 染色体・核輸送のダイナミクスと細胞分化から個体発生, 破綻による疾患まで
羊土社 2009 ISBN:9784758103022
生細胞蛍光イメージング : 講義と実習 : 阪大・北大顕微鏡コースブック
共立出版 2007 ISBN:9784320056602
細胞核の世界 : ダイナミクスから病態まで
共立出版 2007 ISBN:9784320056558
生細胞におけるクロマチンの可視化
実験医学別冊「クローズアップ実験法総集編」(羊土社) 2002

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Lectures and oral presentations (36)：

ヒストン修飾と転写の生細胞動態から捉えるクロマチンポテンシャル
(第41回日本分子生物学会年会 2018)
A chromatin integration labeling method enables epigenomic profiling with lower input
(3R&3C Symposium 2018)
Sensing Histone Modification and Transcription Dynamics in Living Cells
(2nd Epigenetics and Bioengineering Conference 2018)
クロマチン修飾ダイナミクス生細胞イメージングとエピゲノム解析の融合に向けて
(第91回日本生化学会大会 2018)
Chromatin Modification Dynamics in Living Cells
(Gordon Research Conference "Chromatin Structure and Function" 2018)

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Education (2)：

1987 - 1991 Hokkaido University Graduate School of Science Department of Chemistry II
1984 - 1987 Hokkaido University Faculty of Science Department of Chemistry II

Professional career (1)：

PhD (Hokkaido University)

Work history (9)：

2024/10 - 現在 Institute of Sciecne Tokyo Cell Biology Center, Institute of Integrated Research Professor
2016/04 - 2024/09 Tokyo Institute of Technology Institute of Innovative Research
2014/07 - 2016/03 Tokyo Institute of Technology Bioscience and Biotechnology
2007/10 - 2014/06 Osaka University
2007/04 - 2007/09 情報通信機構未来ICT研究センター特任研究員

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Awards (2)：

2021/04 - 科学技術分野の文部科学大臣表彰科学技術賞
2015/08 - The Society for Histochemisty Robert Feulgen Prize

※ Researcher’s information displayed in J-GLOBAL is based on the information registered in researchmap. For details, see here.

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