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J-GLOBAL ID：201601008741364144   Update date: Sep. 24, 2024

Okuda Satoru

オクダ サトル | Okuda Satoru
Affiliation and department：
Kanazawa University

About Kanazawa University


Homepage URL  (2)： http://mechgen.jp ,  http://mechgen.jp/index-en.html
Research field  (8)： Developmental biology ,  Biological, health, and medical informatics ,  Structural and functional materials ,  Bio-, chemical, and soft-matter physics ,  Biomaterials ,  Biomedical engineering ,  Cell biology ,  Machine materials and mechanics
Research keywords  (18)： 神経発生 ,  オルガノイド ,  細胞接着 ,  ゆらぎ ,  自己組織化 ,  集団運動 ,  細胞運動 ,  細胞骨格 ,  バーテックスモデル ,  幹細胞 ,  形態形成 ,  数理モデル ,  シミュレーション ,  ソフトマター ,  バイオメカニクス ,  器官形成 ,  メカノバイオロジー ,  生体力学
Research theme for competitive and other funds  (19)：
  • 2022 - 2027 Theoretical study of self-organization induced by mechanochemical feedback
  • 2024 - 2026 ECMが弾性を介して神経可塑性を制御する機構:新規AFMによる脳内の網羅計測
  • 2024 - 2026 3D力学動態モデリングによる細胞競合現象の理論的な理解
  • 2022 - 2025 核内の粘弾的特性がNanogの転写調節領域の空間的ゆらぎを制御する
  • 2021 - 2025 Unraveling the role of peri-synaptic collagen in ageing with protein engineering
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Papers (39)：
  • Itsuki Shioka, Ritsuko Morita, Rei Yagasaki, Duligengaowa Wuergezhen, Tadahiro Yamashita, Hironobu Fujiwara, Satoru Okuda. Ex vivo SIM-AFM measurements reveal the spatial correlation of stiffness and molecular distributions in 3D living tissue. bioRxiv. 2024
  • Shou Miyasaka, Keita Izumi, Satoru Okuda, Yuichiro Miki. Numerical assessment of the applicability of geometry-based force inference on homogeneous and heterogeneous cells. PLOS ONE. 2024. 19. 4. e0299016-e0299016
  • Aki Teranishi, Misato Mori, Rihoko Ichiki, Satoshi Toda, Go Shioi, Satoru Okuda. Epithelial Folding Irreversibility is Controlled by Elastoplastic Transition via Mechanosensitive Actin Bracket Formation. bioRxiv. 2023
  • Yuki Fujimura, Itsuki Sakai, Itsuki Shioka, Nozomu Takata, Atsushi Hashimoto, Takuya Funatomi, Satoru Okuda. Machine learning-based estimation of spatial gene expression pattern during ESC-derived retinal organoid development. Scientific Reports. 2023. 13. 1. 22781
  • Satoshi Arai, Hideki Itoh, Cong Quang Vu, Mizuho Nakayama, Masanobu Oshima, Atsuya Morita, Kazuko Okamoto, Satoru Okuda, Aki Teranishi, Madori Osawa, et al. qMaLioffG: A single green fluorescent protein FLIM indicator enabling quantitative imaging of endogenous ATP. 2023
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MISC (9)：
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Patents (2)：
Lectures and oral presentations  (68)：
  • 脊椎動物胚における相同な管腔構造の種間で異なる成長の力学
    (日本動物学会 第95回長崎大会 2024)
  • 形の記憶:器官形成に必須な組織の機械特性
    (NEURO2024 2024)
  • Diverged growth mechanisms in conserved otic vesicles: A mechanical perspective
    (57th Annual Meeting of the Japanese Society of Developmental Biologists 2024)
  • Elastoplastic transition in epithelial folding controlled by actin bracket formation as a basis for the unidirectionality of morphogenesis
    (57th Annual Meeting of the Japanese Society of Developmental Biologists 2024)
  • Exploring the mechanism of optic vesicle evagination in mouse ES cell-derived retinal organoids
    (57th Annual Meeting of the Japanese Society of Developmental Biologists 2024)
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Education (3)：
  • 2010 - 2013 Kyoto University
  • 2008 - 2010 Kyoto University
  • 2004 - 2008 Kyoto University Faculty of Engineering
Professional career (1)：
  • 博士(工学) (京都大学)
Work history (5)：
  • 2019/04 - 現在 Kanazawa University Nano Life Science Institute Associate Professor
  • 2016/10 - 2020/03 Japan Science and Technology Agency (JST) PRESTO Researcher
  • 2016/04 - 2018/03 RIKEN Center for Developmental Biology (CDB) Special Postdoctoral Researcher
  • 2013/04 - 2016/03 RIKEN Center for Developmental Biology (CDB) Research Scientist
  • 2010/04 - 2013/03 Japan Society for the Promotion of Science Pre-Doctoral Fellow DC1
Awards (11)：
  • 2024/04 - 文部科学省 令和6年度 科学技術分野の文部科学大臣表彰 若手科学者賞 多細胞組織のアクティブな機械特性と力学動態に関する研究
  • 2022/11 - 化学とマイクロ・ナノシステム学会 優秀研究賞 マイクロ構造体上での組織変形を記述する粒子ベース力学モデルの開発
  • 2021/06 - 日本機械学会バイオエンジニアリング部門 瀬口賞
  • 2020/04 - 日本機械学会 2019年度日本機械学会賞(論文)
  • 2020/03 - さきがけ「統合1細胞解析のための革新的技術基盤」研究領域 ライジングスター賞
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Association Membership(s) (4)：
JAPANESE SOCIETY OF DEVELOPMENTAL BIOLOGISTS ,  THE BIOPHYSICAL SOCIETY OF JAPAN ,  THE JAPAN SOCIETY OF MECHANICAL ENGINEERS ,  日本神経科学学会
※ Researcher’s information displayed in J-GLOBAL is based on the information registered in researchmap. For details, see here.

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