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J-GLOBAL ID：201601016652461368   Update date: Jun. 13, 2024

kobayashi Tetsuya J

コバヤシ テツヤ | kobayashi Tetsuya J
Affiliation and department：
The University of Tokyo Institute of Industrial Science

About The University of Tokyo Institute of Industrial Science


Job title： Professor
Homepage URL  (1)： http://research.crmind.net
Research field  (6)： Bio-, chemical, and soft-matter physics ,  Mathematical informatics ,  Biophysics ,  Soft computing ,  Biological, health, and medical informatics ,  Systems genomics
Research keywords  (20)： Computational neuroscience ,  Olfactory systems ,  Large deviation theory ,  Dynamical systems ,  Point processes ,  Chemical thermodynamics ,  Nonequilibrium physics ,  Chemical Reaction Network ,  optimal filtering theory ,  Optimal control ,  Information Geometry ,  Applied mathematics ,  進化生物学 ,  systems biology ,  Developmental biology ,  Immunology ,  Bioinformatics ,  Biophysics ,  Theoretical Biology ,  Quantitative Biology
Research theme for competitive and other funds  (18)：
  • 2019 - 2024 情報物理学でひもとく生命の秩序と設計原理
  • 2019 - 2024 適応過程の情報物理学的理解
  • 2019 - 2022 Quantitative understanding of self-replication of cells
  • 2018 - 2020 深層ネットワークを援用した表現型制約と表現型進化原理の探索と普遍構造の探求
  • 2018 - 2020 低次元化に基づく免疫受容体配列ダイバーシティ解析手法の改良と応用展開
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Papers (104)：
  • Atsushi Kamimura, Yuki Sughiyama, Tetsuya J. Kobayashi. Thermodynamic and stoichiometric laws ruling the fates of growing systems. Physical Review Research. 2024. 6. 023173
  • Tsuyoshi Mizohata, Tetsuya J. Kobayashi, Louis-S. Bouchard, Hideyuki Miyahara. Information geometric bound on general chemical reaction networks. Physical Review E. 2024. 109. 4
  • Yuki Takakura, Moeka Machida, Natsumi Terada, Yuka Katsumi, Seika Kawamura, Kenta Horie, Maki Miyauchi, Tatsuya Ishikawa, Nobuko Akiyama, Takao Seki, et al. Mitochondrial protein C15ORF48 is a stress-independent inducer of autophagy that regulates oxidative stress and autoimmunity. Nature Communications. 2024. 15. 1
  • Tetsuya J. Kobayashi, Dimitri Loutchko, Atsushi Kamimura, Shuhei A. Horiguchi, Yuki Sughiyama. Information geometry of dynamics on graphs and hypergraphs. Information Geometry. 2023
  • Kenta Horie, Kano Namiki, Kyouhei Kinoshita, Maki Miyauchi, Tatsuya Ishikawa, Mio Hayama, Yuya Maruyama, Naho Hagiwara, Takahisa Miyao, Shigeo Murata, et al. Acute irradiation causes a long-term disturbance in the heterogeneity and gene expression profile of medullary thymic epithelial cells. Frontiers in Immunology. 2023. 14
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MISC (36)：
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Books (5)：
  • 機械学習を生命科学に使う! : シークエンスや画像データをどう解析し、新たな生物学的発見につなげるか?
    羊土社 2020 ISBN:9784758103916
  • 定量生物学 : 生命現象を定量的に理解するために
    化学同人 2018 ISBN:9784759817300
  • バイオ画像解析手とり足とりガイド : バイオイメージングデータを定量して生命の形態や動態を理解する!
    羊土社 2014 ISBN:9784758108157
  • 「特集」生命システムを定量する! : 未知なる現象の謎を解け!
    羊土社 2013 ISBN:9784758100953
  • 生命科学の新しい潮流 理論生物学
    共立出版 2011 ISBN:4320057139
Lectures and oral presentations  (105)：
  • epiNMF: a Novel Method to Uncover the Influence of Epigenome on Local Mutation Rates
    (Gordon Research Seminar, DNA Damage, Mutation and Cancer 2024)
  • ストレス条件下における髄質胸腺上皮細胞の分化ダイナミクス変化の情報学的解析
    (第8回理論免疫学ワークショップ 2024)
  • 環境を通じて情報共有する細胞集団の強化学習的理解
    (第8回理論免疫学ワークショップ 2024)
  • 細胞集団の勾配流によるモデリング
    (第8回理論免疫学ワークショップ 2024)
  • 歴史から紐解く化学反応論と化学熱力学
    (定量生物学の会 第十一回年会 2024)
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Professional career (1)：
  • Science (The University of Tokyo)
Work history (8)：
  • 2023/04 - 現在 The University of Tokyo Institute of Industrial Science Professor
  • 2011/10 - 現在 The University of Tokyo The Graduate School of Information Science and Technology Department of Mathematical Informatics Associate Professor
  • 2011/10 - 現在 The University of Tokyo The Graduate School of Engineering Department of Electrical Engineering and Information Systems Associate Professor
  • 2011/10 - 2023/03 The University of Tokyo Institute of Industrial Science Associate Professor
  • 2017/03 - 2018/03 University College London honorary research associate
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Awards (4)：
  • 2024/03 - 総務省 2023年度「異能ジェネレーションアワード」 生物はどこまで賢く匂いを探索するのか?ノイズに負けない 探索戦略を紐解く新理論の構築
  • 2019/11 - 生産技術研究所 奨励会 顕彰 免疫レパートリビッグデータの解析技術の構築とシステム免疫学の国際ネットワークの形成
  • 2013/10 - 日本生物物理学会 日本生物物理学会若手奨励賞 細胞システムの内因的・外因的ゆらきに対するロバスト性に関する理論的基礎
  • 2010/06 - (独)科学技術振興機構 CREST「生命システムの動作原理と基盤技術」 ポスター賞
Association Membership(s) (4)：
The Biophysical Society of Japan ,  Japanese society for quantitative biology ,  Japanese Society for Cell Synthesis Research ,  Japanese Society for Mathematical Biology
※ Researcher’s information displayed in J-GLOBAL is based on the information registered in researchmap. For details, see here.

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