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J-GLOBAL ID：201601016652461368   Update date: Apr. 03, 2025

kobayashi Tetsuya J

コバヤシ テツヤ | kobayashi Tetsuya J
Affiliation and department：
The University of Tokyo Institute of Industrial Science

About The University of Tokyo Institute of Industrial Science


Job title： Professor
Homepage URL  (1)： http://research.crmind.net
Research field  (6)： Bio-, chemical, and soft-matter physics ,  Mathematical informatics ,  Biophysics ,  Soft computing ,  Biological, health, and medical informatics ,  Systems genomics
Research keywords  (20)： Computational neuroscience ,  Olfactory systems ,  Large deviation theory ,  Dynamical systems ,  Point processes ,  Chemical thermodynamics ,  Nonequilibrium physics ,  Chemical Reaction Network ,  optimal filtering theory ,  Optimal control ,  Information Geometry ,  Applied mathematics ,  進化生物学 ,  systems biology ,  Developmental biology ,  Immunology ,  Bioinformatics ,  Biophysics ,  Theoretical Biology ,  Quantitative Biology
Research theme for competitive and other funds  (18)：
  • 2019 - 2024 情報物理学でひもとく生命の秩序と設計原理
  • 2019 - 2024 適応過程の情報物理学的理解
  • 2019 - 2022 Quantitative understanding of self-replication of cells
  • 2018 - 2020 深層ネットワークを援用した表現型制約と表現型進化原理の探索と普遍構造の探求
  • 2018 - 2020 低次元化に基づく免疫受容体配列ダイバーシティ解析手法の改良と応用展開
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Papers (109)：
  • Kento Nakamura, Tetsuya J. Kobayashi. Gradient sensing limit of an elongated cell with orientational control. Physical Review E. 2024. 110. 6
  • Atsushi Kamimura, Yuki Sughiyama, Tetsuya J. Kobayashi. Chemical thermodynamics of growing autocatalytic processes. JSAP Review. 2024. 2024. 240217
  • Yusuke Himeoka, Shuhei A. Horiguchi, Tetsuya J. Kobayashi. Theoretical basis for cell deaths. Physical Review Research. 2024. 6. 4
  • 上村 淳, 杉山 友規, 小林 徹也. 体積成長を伴う自己複製反応過程の化学熱力学. 応用物理. 2024. 93. 11. 624-629
  • Masahito Uwamichi, Simon K. Schnyder, Tetsuya J. Kobayashi, Satoshi Sawai. Integrating GNN and Neural ODEs for Estimating Non-Reciprocal Two-Body Interactions in Mixed-Species Collective Motion. NeurIPS. 2024. 15155
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MISC (37)：
  • Kento NAKAMURA, Tetsuya J. KOBAYASHI. 大腸菌走化性運動における最適な感知と制御. Seibutsu Butsuri. 2023. 63. 6. 325-329
  • 小林徹也, 中村絢斗. 細胞はどれくらい賢く匂いを嗅げるのか?-生体による化学情報感知の普遍的性質. AROMA RESEARCH. 2022. 23. 4. 320-327
  • 中村絢斗, 小林徹也. バクテリア化学走性と確率最適制御:Bacterial chemotaxis and stochastic optimal control. システム/制御/情報. 2022. 66. 9. 346-351
  • 梶田真司, 合原一幸, 小林徹也. 免疫T細胞の抗原識別における確率ノイズの機能. 日本数理生物学会年会(Web). 2019. 29th
  • Kajita Masashi, Aihara Kazuyuki, Kobayashi Tetsuya. Cellular ligand discrimination and nonlinear response to affinity. Proceedings of the Japan Joint Automatic Control Conference. 2017. 60. 0. 1003-1004
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Books (5)：
  • 機械学習を生命科学に使う! : シークエンスや画像データをどう解析し、新たな生物学的発見につなげるか?
    羊土社 2020 ISBN:9784758103916
  • 定量生物学 : 生命現象を定量的に理解するために
    化学同人 2018 ISBN:9784759817300
  • バイオ画像解析手とり足とりガイド : バイオイメージングデータを定量して生命の形態や動態を理解する!
    羊土社 2014 ISBN:9784758108157
  • 「特集」生命システムを定量する! : 未知なる現象の謎を解け!
    羊土社 2013 ISBN:9784758100953
  • 生命科学の新しい潮流 理論生物学
    共立出版 2011 ISBN:4320057139
Lectures and oral presentations  (152)：
  • Information Geometry of Chemical Reaction Dynamics and Thermodynamics
    (Further Developments of Information Geometry 2025)
  • Phase Transitions Induced by Resource Limitations in Biological Information Processing
    (APS Global Physics Summit 2025 2025)
  • Chemical thermodynamics for growing systems
    (TSVP Thematic Program "Computation and Physical Understanding of Biological Information Processing" 2025)
  • Development of a low-frequency antigen-specific T cell clone identification method using optimal transport theory
    (TSVP Thematic Program "Computation and Physical Understanding of Biological Information Processing" 2025)
  • Quantifying Relaxation Dynamics on CRNs with Convexity
    (TSVP Thematic Program "Computation and Physical Understanding of Biological Information Processing" 2025)
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Professional career (1)：
  • Science (The University of Tokyo)
Work history (8)：
  • 2023/04 - 現在 The University of Tokyo Institute of Industrial Science Professor
  • 2011/10 - 現在 The University of Tokyo The Graduate School of Information Science and Technology Department of Mathematical Informatics Associate Professor
  • 2011/10 - 現在 The University of Tokyo The Graduate School of Engineering Department of Electrical Engineering and Information Systems Associate Professor
  • 2011/10 - 2023/03 The University of Tokyo Institute of Industrial Science Associate Professor
  • 2017/03 - 2018/03 University College London honorary research associate
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Awards (4)：
  • 2024/03 - 総務省 2023年度「異能ジェネレーションアワード」 生物はどこまで賢く匂いを探索するのか?ノイズに負けない 探索戦略を紐解く新理論の構築
  • 2019/11 - 生産技術研究所 奨励会 顕彰 免疫レパートリビッグデータの解析技術の構築とシステム免疫学の国際ネットワークの形成
  • 2013/10 - 日本生物物理学会 日本生物物理学会若手奨励賞 細胞システムの内因的・外因的ゆらきに対するロバスト性に関する理論的基礎
  • 2010/06 - (独)科学技術振興機構 CREST「生命システムの動作原理と基盤技術」 ポスター賞
Association Membership(s) (4)：
The Biophysical Society of Japan ,  Japanese society for quantitative biology ,  Japanese Society for Cell Synthesis Research ,  Japanese Society for Mathematical Biology
※ Researcher’s information displayed in J-GLOBAL is based on the information registered in researchmap. For details, see here.

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